| 中文摘要 | 第1-15页 |
| 英文摘要 | 第15-18页 |
| 第一章: 综述：线状植物病毒概述 | 第18-31页 |
| 1．1 线状植物病毒基本特征简述 | 第18-24页 |
| 1．1．1 马铃薯Y病毒属（genus Potyvirus） | 第18-19页 |
| 1．1．2 黑麦草花叶病毒属（genus Rymovirus） | 第19-20页 |
| 1．1．3 大麦黄花叶病毒属（genus Bymovirus） | 第20页 |
| 1．1．4 甘薯病毒属（genus Ipomovirus） | 第20页 |
| 1．1．5 桑橙病毒属（genus Maclurvirus） | 第20页 |
| 1．1．6 小麦花叶病毒属（genus Tritimovirus） | 第20-21页 |
| 1．1．7 香石竹潜隐病毒属（genus Carlavirus） | 第21页 |
| 1．1．8 青葱X病毒属（genus Allexivirus） | 第21页 |
| 1．1．9 凹陷病毒属（genus Foveavirus） | 第21-22页 |
| 1．1．10 马铃薯X病毒属（genus Potexvirus） | 第22页 |
| 1．1．11 发形病毒属（genus Capillovirus） | 第22页 |
| 1．1．12 纤毛病毒属（genus Trichovirus） | 第22-23页 |
| 1．1．13 葡萄病毒属（genus Vitivirus） | 第23页 |
| 1．1．14 长线形病毒属（genus Closterovirus） | 第23-24页 |
| 1．1．15 毛形病毒属（genus Crinivirus） | 第24页 |
| 1．2 Carlavirus、Allexivirus、Foveavirus和Potexvirus属成员区别 | 第24页 |
| 1．3 Potyvirus属分子生物学研究进展 | 第24-29页 |
| 1．3．1 基因组结构和特点 | 第25-26页 |
| 1．3．2 基因组翻译产物的加工和功能 | 第26-29页 |
| 1．4 Carlavirus属分子生物学研究进展 | 第29-30页 |
| 1．4．1 基因组结构 | 第29页 |
| 1．4．2 编码蛋白的推测功能 | 第29-30页 |
| 1．5 本文研究背景和目的 | 第30-31页 |
| 第二章: 材料与方法 | 第31-38页 |
| 2．1 植物总RNA抽提 | 第31页 |
| 2．2 植物线状病毒提纯 | 第31页 |
| 2．3 电子显微镜观察 | 第31-32页 |
| 2．3．1 浸出法 | 第31页 |
| 2．3．2 超薄切片 | 第31-32页 |
| 2．4 SDS-PAGE和Western Blot | 第32-34页 |
| 2．4．1 SDS-PAGE | 第32-33页 |
| 2．4．2 转移 | 第33页 |
| 2．4．3 免疫显色反应 | 第33-34页 |
| 2．5 病毒RNA抽提 | 第34-35页 |
| 2．6 逆转录 | 第35页 |
| 2．7 聚合酶链式反应（PCR） | 第35页 |
| 2．8 克隆 | 第35-37页 |
| 2．8．1 DNA片段的切胶纯化 | 第35页 |
| 2．8．2 T-A连接 | 第35-36页 |
| 2．8．3 氯化钙法转化 | 第36页 |
| 2．8．3．1 感受态细胞制备 | 第36页 |
| 2．8．3．2 转化 | 第36页 |
| 2．8．4 碱裂法小量制备质粒 | 第36-37页 |
| 2．9 序列测定及分析 | 第37-38页 |
| 第三章： 葫芦科作物上发生的小西葫芦黄花叶病毒分子鉴定 | 第38-58页 |
| 3．1 扩增ZYMV全序列引物设计 | 第40页 |
| 3．2 ZYMV病样 | 第40-41页 |
| 3．3 ZYMV中国分离物的基因组结构特征 | 第41页 |
| 3．4 ZYMV基因组编码的蛋白保守基序及其功能推测 | 第41-51页 |
| 3．5 核苷酸和氨基酸同源性比较 | 第51-53页 |
| 3．6 ZYMV进化树分析 | 第53-58页 |
| 第四章： 侵染半夏的大豆花叶病毒分离物鉴定 | 第58-66页 |
| 4．1 半夏病样 | 第59页 |
| 4．2 半夏病症、SMV半夏分离物（SMV-P）在大豆品种上的反应 | 第59页 |
| 4．3 病毒粒子形态学和细胞病理学特征 | 第59页 |
| 4．4 病毒粒子免疫电镜观察及其病毒外壳蛋白Western blot分析 | 第59页 |
| 4．5 SMV-P基因组3′-末端部分序列特征 | 第59-60页 |
| 4．6 SMV-P分离物基因组3′-末端部分序列差异及进化树分析 | 第60-66页 |
| 第五章： 百合线状病毒分子鉴定 | 第66-74页 |
| 5．1 百合斑驳病毒（Lily mottle virus, LMoV） | 第66-69页 |
| 5．1．1 LMoV病样 | 第66-67页 |
| 5．1．2 LMoV-HZ2分离物基因组3′-端结构 | 第67-68页 |
| 5．1．3 LMoV的分类、分子变异和序列进化树分析 | 第68-69页 |
| 5．2 百合无症病毒（Lily symptomless virus, LSV） | 第69-74页 |
| 5．2．1 LSV病样 | 第70页 |
| 5．2．2 LSV基因组3′-末端结构 | 第70-72页 |
| 5．2．3 LSV同源性和进化树分析 | 第72-74页 |
| 第六章： 水仙线状病毒分子鉴定 | 第74-86页 |
| 6．1 水仙迟季黄化病毒（Narcissus late season yellows virus, NLSYV） | 第75-79页 |
| 6．1．1 NLSYV杭州分离物（NLSYV-HZ）3′-末端序列结构 | 第75-76页 |
| 6．1．2 NLSYV的分类 | 第76-79页 |
| 6．2 虎眼万年青花叶病毒（Ornithogalum mosaic virus, OrMV） | 第79-82页 |
| 6．2．1 OrMV杭州分离物（OrMV-HZ）基因组3′-端结构 | 第79-80页 |
| 6．2．2 外壳蛋白序列同源性和进化树分析 | 第80-82页 |
| 6．3 水仙普通潜隐病毒（Narcisuss common latent virus, NCLV） | 第82-86页 |
| 6．3．1 NCLV杭州分离物（NCLV-HZ）基因组3′-端结构分析 | 第82-84页 |
| 6．3．2 NCLV-HZ分离物外壳蛋白同源性与进化树分析 | 第84-86页 |
| 第七章： 其他Potyvirus属病毒分子鉴定 | 第86-106页 |
| 7．1 菜豆普通花叶病毒（Bean common mosaic virus, BCMV） | 第86-92页 |
| 7．1．1 菜豆普通花叶病毒菜豆分离物（BCMV-b） | 第86-90页 |
| 7．1．1．1 BCMV-b基因组3′-端结构与分析 | 第86-87页 |
| 7．1．1．2 外壳蛋白基因序列同源性比较及进化分析 | 第87-90页 |
| 7．1．2 菜豆普通花叶病毒花生分离物（BCMV-p） | 第90-92页 |
| 7．1．2．1 BCMV-p基因组3′-末端结构和外壳蛋白进化树分析 | 第91-92页 |
| 7．2 菜豆黄花叶病毒（Bean yellow mosaic virus, BYMV） | 第92-95页 |
| 7．2．1 BYMV杭州分离物（BYMV-HZ）基因组3′-末端结构 | 第92-93页 |
| 7．2．2 BYMV分离物外壳蛋白基因核苷酸序列进化树分析 | 第93-95页 |
| 7．3 莴苣花叶病毒（Lettuce mosaic virus, LMV） | 第95-99页 |
| 7．3．1 LMV病样 | 第95页 |
| 7．3．2 LMV基因组3′端序列结构与分析 | 第95-96页 |
| 7．3．3 LMV杭州分离物（LMV-HZ）外壳蛋白同源性和进化树分析 | 第96-99页 |
| 7．4 马铃薯Y病毒（Potato virus Y, PVY） | 第99-103页 |
| 7．4．1 马铃薯病样 | 第99页 |
| 7．4．2 PVY杭州分离物（PVY-HZ）基因组3′-末端结构 | 第99-100页 |
| 7．4．3 PVY-HZ外壳蛋白基因核苷酸序列进化树分析 | 第100-103页 |
| 7．5 芜菁花叶病毒（Turnip mosaic virus, TuMV） | 第103-106页 |
| 7．5．1 TuMV病样 | 第103页 |
| 7．5．2 TuMV杭州芥菜分离物（TuMV-HZ）基因组3′-末端结构 | 第103-104页 |
| 7．5．3 外壳蛋白基因进化树分析 | 第104-106页 |
| 第八章： 其他Carlavirus属病毒分子鉴定 | 第106-114页 |
| 8．1 马铃薯S病毒（Potato virus S, PVS） | 第106-110页 |
| 8．1．1 PVS杭州分离物（PVS-HZ）基因组3′-端序列 | 第106-108页 |
| 8．1．2 PVS-HZ基因组ORF3-6核苷酸及编码的蛋白氨基酸同源性分析 | 第108页 |
| 8．1．3 PVS-HZ外壳蛋白基因同源性及进化树分析 | 第108-110页 |
| 8．2 侵染人参果的马铃薯M病毒（Potato virus M, PVM） | 第110-114页 |
| 8．2．1 PVM人参果分离物3′-末端序列 | 第110-112页 |
| 8．2．2 与其他相关病毒分离物的3′-末端序列同源性比较和进化分析 | 第112-114页 |
| 第九章： 主要结论和展望 | 第114-119页 |
| 9．1 简并引物对所有样品的检测结果 | 第114页 |
| 9．2 本研究测定的病毒分离物序列 | 第114页 |
| 9．3 主要结论 | 第114-118页 |
| 9．4 展望 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-134页 |
| 博士期间代表性论文 | 第134-135页 |
| 致谢 | 第135-136页 |
| 图版 | 第136-143页 |
