摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-6页 |
目录 | 第6-8页 |
第一章 引言 | 第8-12页 |
·地中海贫血概述 | 第8-9页 |
·群体遗传学推演群体演化历史的基本逻辑 | 第9页 |
·广西壮族与海南黎族地理历史 | 第9-10页 |
·广西壮族的地理历史环境 | 第9-10页 |
·海南黎族的地理历史环境 | 第10页 |
·广西壮族和海南黎族同地中海贫血关系与研究意义 | 第10-12页 |
第二章 研究数据及来源 | 第12-16页 |
·实验数据及来源 | 第12页 |
·历史人口数据及来源 | 第12-16页 |
第三章 群体遗传学的相关概念 | 第16-21页 |
·有效群体数 | 第16页 |
·遗传漂变 | 第16-17页 |
·迁移 | 第17页 |
·自然选择 | 第17-18页 |
·中性进化 | 第18页 |
·赖特-舍菲特模型 | 第18-19页 |
·蒙特卡洛模拟 | 第19-20页 |
·最大似然法(Max-mum Likelihood Simulation) | 第20-21页 |
第四章 模拟工具MS程序介绍 | 第21-26页 |
·MS程序简介 | 第21页 |
·MS程序编译与随机数发生器简介 | 第21-22页 |
·MS程序输出简介 | 第22-26页 |
·数据形式 | 第22-24页 |
·基本模型简介 | 第24页 |
·根据历史数据计算MS参数 | 第24-25页 |
·模型中的参数说明 | 第25-26页 |
第五章 蒙特卡洛模拟分析 | 第26-34页 |
·核基因数据分析平衡选择系数 | 第26-27页 |
·使用MS程序模拟不含瓶颈效应的模型 | 第27-32页 |
·分析数据的单倍型 | 第28-29页 |
·分析数据的突变频谱 | 第29-31页 |
·分析数据的π值和θ值 | 第31-32页 |
·使用MS程序模拟黎族发生瓶颈效应的模型 | 第32-34页 |
·黎族和壮族分歧模型 | 第32-33页 |
·瓶颈效应中使用的随机数 | 第33-34页 |
第六章 结果与讨论 | 第34-39页 |
附录 | 第39-56页 |
附录1:包含瓶颈效应模型模拟所使用的随机数 | 第39-44页 |
附录2:包含瓶颈效应模型模拟脚本 | 第44-56页 |
参考文献 | 第56-59页 |
致谢 | 第59-60页 |