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使用蒙特卡洛模拟分析海南黎族和广西壮族群体进化历史

摘要第1-4页
Abstract第4-6页
目录第6-8页
第一章 引言第8-12页
   ·地中海贫血概述第8-9页
   ·群体遗传学推演群体演化历史的基本逻辑第9页
   ·广西壮族与海南黎族地理历史第9-10页
     ·广西壮族的地理历史环境第9-10页
     ·海南黎族的地理历史环境第10页
   ·广西壮族和海南黎族同地中海贫血关系与研究意义第10-12页
第二章 研究数据及来源第12-16页
   ·实验数据及来源第12页
   ·历史人口数据及来源第12-16页
第三章 群体遗传学的相关概念第16-21页
   ·有效群体数第16页
   ·遗传漂变第16-17页
   ·迁移第17页
   ·自然选择第17-18页
   ·中性进化第18页
   ·赖特-舍菲特模型第18-19页
   ·蒙特卡洛模拟第19-20页
   ·最大似然法(Max-mum Likelihood Simulation)第20-21页
第四章 模拟工具MS程序介绍第21-26页
   ·MS程序简介第21页
   ·MS程序编译与随机数发生器简介第21-22页
   ·MS程序输出简介第22-26页
     ·数据形式第22-24页
     ·基本模型简介第24页
     ·根据历史数据计算MS参数第24-25页
     ·模型中的参数说明第25-26页
第五章 蒙特卡洛模拟分析第26-34页
   ·核基因数据分析平衡选择系数第26-27页
   ·使用MS程序模拟不含瓶颈效应的模型第27-32页
     ·分析数据的单倍型第28-29页
     ·分析数据的突变频谱第29-31页
     ·分析数据的π值和θ值第31-32页
   ·使用MS程序模拟黎族发生瓶颈效应的模型第32-34页
     ·黎族和壮族分歧模型第32-33页
     ·瓶颈效应中使用的随机数第33-34页
第六章 结果与讨论第34-39页
附录第39-56页
 附录1:包含瓶颈效应模型模拟所使用的随机数第39-44页
 附录2:包含瓶颈效应模型模拟脚本第44-56页
参考文献第56-59页
致谢第59-60页

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