| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-16页 |
| 第一部分 文献综述 | 第16-43页 |
| 1 盐芥研究进展 | 第16-21页 |
| ·盐芥属的系谱发生 | 第16-17页 |
| ·生物学特性及国内分布 | 第17页 |
| ·多种胁迫耐受性 | 第17页 |
| ·钠钾离子运输 | 第17-18页 |
| ·保护性物质代谢 | 第18页 |
| ·基因表达谱 | 第18-19页 |
| ·基因功能鉴定 | 第19页 |
| ·技术工具及信息资源 | 第19-20页 |
| ·总结及展望 | 第20-21页 |
| 2 蛋白质组学及其在植物学中的应用 | 第21-41页 |
| ·蛋白质组学研究技术概况 | 第21-30页 |
| ·蛋白质组学的内涵 | 第22页 |
| ·基于质谱的蛋白质组学 | 第22-30页 |
| ·不依赖凝胶分离的蛋白质组学分析方法 | 第23-24页 |
| ·毛细管电泳技术 | 第23页 |
| ·高效液相色谱技术 | 第23-24页 |
| ·ICAT | 第24页 |
| ·iTRAQ | 第24页 |
| ·SILAC | 第24页 |
| ·基于凝胶分离的蛋白质组学分析方法 | 第24-30页 |
| ·对角线电泳 | 第25页 |
| ·IEF/SDS-PAGE | 第25-27页 |
| ·IEF 的发展 | 第26页 |
| ·第二向SDS-PAGE | 第26-27页 |
| ·DIGE 和Proteomic contig | 第27页 |
| ·凝胶染色 | 第27页 |
| ·图像采集 | 第27-28页 |
| ·质谱分析 | 第28-29页 |
| ·蛋白质测序 | 第29-30页 |
| ·生物信息学分析 | 第30页 |
| ·蛋白质组学在植物学中的应用 | 第30-41页 |
| ·植物群体遗传和突变体蛋白质组学研究 | 第30-31页 |
| ·植物环境信号响应蛋白质组学 | 第31-34页 |
| ·非生物环境因子蛋白质组学研究 | 第31-33页 |
| ·生物环境因子蛋白质组研究 | 第33页 |
| ·植物激素蛋白质组学研究 | 第33-34页 |
| ·植物组织器官蛋白质组学 | 第34-35页 |
| ·植物亚细胞蛋白质组学 | 第35-40页 |
| ·细胞壁 | 第35-36页 |
| ·质膜 | 第36-37页 |
| ·液泡膜 | 第37-38页 |
| ·叶绿体 | 第38-39页 |
| ·细胞核 | 第39页 |
| ·其他内膜系统 | 第39-40页 |
| ·PTM 鉴定 | 第40-41页 |
| ·磷酸化 | 第40-41页 |
| ·糖基化 | 第41页 |
| ·泛素化 | 第41页 |
| ·植物蛋白质组学研究前景 | 第41页 |
| 3 盐芥蛋白质组学研究的目的及意义 | 第41-43页 |
| 第二部分 实验论文 | 第43-103页 |
| 1 实验材料 | 第43-45页 |
| ·植物材料 | 第43页 |
| ·化学试剂 | 第43-44页 |
| ·主要设备 | 第44-45页 |
| 2 实验方法 | 第45-50页 |
| ·材料的培养 | 第45页 |
| ·盐芥生理形态参数的测定 | 第45页 |
| ·样品的制备 | 第45-46页 |
| ·蛋白质沉淀 | 第45-46页 |
| ·蛋白样品的裂解 | 第46页 |
| ·蛋白样品浓度测定 | 第46页 |
| ·样品再水化等电聚焦 | 第46-47页 |
| ·IPG 胶条的平衡 | 第47页 |
| ·SDS-PAGE 垂直电泳 | 第47-48页 |
| ·染色 | 第48页 |
| ·图像采集及分析 | 第48-49页 |
| ·差异蛋白点的胶内酶解回收 | 第49页 |
| ·蛋白点的质谱分析 | 第49-50页 |
| ·蛋白数据库搜索鉴定 | 第50页 |
| ·质谱鉴定蛋白的功能分类分析 | 第50页 |
| 3 实验结果与分析 | 第50-103页 |
| ·盐芥与拟南芥叶片蛋白质组分析 | 第50-75页 |
| ·叶片蛋白的双向电泳分析 | 第51-52页 |
| ·盐芥和拟南芥叶片蛋白的质谱分析 | 第52-58页 |
| ·盐芥和拟南芥叶片质谱鉴定蛋白的功能分类 | 第58-74页 |
| ·盐芥和拟南芥叶片表达模式相似蛋白分析 | 第65-68页 |
| ·盐芥和拟南芥叶片光合作用相关差异蛋白分析 | 第68-70页 |
| ·盐芥和拟南芥叶片防御、胁迫相关差异蛋白分析 | 第70-73页 |
| ·盐芥和拟南芥叶片代谢相关差异蛋白分析 | 第73-74页 |
| ·盐芥和拟南芥叶片蛋白质组分析小结 | 第74-75页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型基础生理指标和蛋白质组差异分析 | 第75-103页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型基础生理差异 | 第76-80页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型形态差别 | 第77-78页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型生物量差异 | 第78-80页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型蛋白质组学分析 | 第80-100页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型叶片蛋白质组学分析 | 第80-90页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型叶片蛋白双向电泳分析 | 第80-81页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型叶片差异蛋白的质谱鉴定 | 第81-83页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型叶片质谱鉴定蛋白的功能分类 | 第83-86页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型叶片差异蛋白功能分析 | 第86-90页 |
| ·乙烯合成相关酶差异 | 第86-87页 |
| ·防御、抗性及胁迫应答相关蛋白差异 | 第87-88页 |
| ·其他蛋白差异 | 第88-90页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型根蛋白质组学分析 | 第90-100页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型根蛋白双向电泳分析 | 第90-91页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型根差异蛋白的质谱鉴定 | 第91-93页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型根质谱鉴定蛋白的功能分类 | 第93-96页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型根差异蛋白的功能分析 | 第96-100页 |
| ·代谢、能量相关蛋白差异 | 第96-98页 |
| ·胁迫、防御相关蛋白差异 | 第98-99页 |
| ·其他蛋白差异 | 第99-100页 |
| ·盐芥SD 和XJ 生态型生理指标差异及蛋白质组差异分析小结 | 第100-103页 |
| 第三部分 讨论总结与展望 | 第103-106页 |
| 1 利用拟南芥蛋白数据库进行盐芥蛋白质组学研究的现实可行性和局限性 | 第103页 |
| 2 光合作用及物质能量分配差异影响了盐芥和拟南芥的生长速度及胁迫耐受性 | 第103-104页 |
| 3 激素及物质能量相关差异影响盐芥SD、XJ 型形态和生物量 | 第104页 |
| 4 盐芥蛋白质组学发展前景展望 | 第104-106页 |
| 参考文献 | 第106-124页 |
| 附录 | 第124-132页 |
| 附录A 实验中所用试剂的配制 | 第124-127页 |
| 附录B 盐芥水培方法 | 第127-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
| 攻读博士学位期间参加的课题及发表的论文 | 第133页 |
