| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-20页 |
| ·课题背景和研究意义 | 第11-12页 |
| ·课题背景 | 第11页 |
| ·研究意义 | 第11-12页 |
| ·国内外研究现状 | 第12-18页 |
| ·目前国内外主要算法 | 第12-17页 |
| ·主要算法比较 | 第17页 |
| ·算法存在的主要问题 | 第17-18页 |
| ·文章的主要工作和创新点 | 第18页 |
| ·文章结构 | 第18-20页 |
| 第二章 基于树模型的RNA序列结构比对基础知识 | 第20-30页 |
| ·RNA序列结构相关知识 | 第20-22页 |
| ·RNA序列结构比对基础理论 | 第22-26页 |
| ·RNA序列结构比对问题描述 | 第22-24页 |
| ·RNA序列结构比对打分方法设计 | 第24-26页 |
| ·树模型的构建和操作 | 第26-29页 |
| ·树模型的构建 | 第26-27页 |
| ·树模型的操作 | 第27-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 基于树模型的RNA双序列结构比对算法 | 第30-40页 |
| ·动态规划算法基本思想及应用 | 第30页 |
| ·基于树模型的RNA双序列结构比对算法 | 第30-35页 |
| ·符号定义 | 第30-31页 |
| ·算法设计 | 第31-34页 |
| ·算法复杂度分析 | 第34-35页 |
| ·数值实验和结果分析 | 第35-39页 |
| ·数值实验设计 | 第35-36页 |
| ·数值实验结果 | 第36-38页 |
| ·实验结果分析和讨论 | 第38-39页 |
| ·本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 结合T-coffee算法的RNA多序列结构比对算法 | 第40-57页 |
| ·T-coffee算法引入 | 第40-42页 |
| ·渐进多序列比对算法概述 | 第40-41页 |
| ·T-coffee算法基本原理 | 第41-42页 |
| ·结合T-coffee算法的RNA多序列结构比对算法 | 第42-46页 |
| ·算法设计 | 第42-44页 |
| ·算法描述 | 第44-46页 |
| ·算法复杂度分析 | 第46页 |
| ·数值实验和结果分析 | 第46-56页 |
| ·数值实验设计 | 第46-47页 |
| ·数值实验结果 | 第47-56页 |
| ·实验结果分析和讨论 | 第56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 第五章 结束语 | 第57-59页 |
| ·总结 | 第57-58页 |
| ·展望 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 作者在学期间取得的学术成果 | 第64页 |