个人简历 | 第3-6页 |
中英文缩略词对照表 | 第6-7页 |
摘要 | 第7-10页 |
ABSTRACT | 第10-12页 |
第1部分 前言 | 第13-15页 |
第2部分 材料和方法 | 第15-26页 |
2.1 数据的准备 | 第15-17页 |
2.1.1 数据来源 | 第15页 |
2.1.2 纳入和排除标准 | 第15-16页 |
2.1.3 表达量数据的标准化 | 第16-17页 |
2.1.4 其他临床数据的处理方法 | 第17页 |
2.2 DCTN家族基因的生物信息学分析 | 第17-21页 |
2.2.1 DCTN家族基因的表达在组织中的分布 | 第17页 |
2.2.2 DCTN家族基因在皮肤癌组织和正常组织的表达情况分析 | 第17-18页 |
2.2.3 预测DCTN家族基因之间的相互作用 | 第18页 |
2.2.4 DCTN基因家族蛋白互作网络 | 第18-19页 |
2.2.5 DCTN家族基因表达的相关性分析 | 第19页 |
2.2.6 DCTN家族基因的功能注释 | 第19-20页 |
2.2.7 DCTN家族基因的KEGG通路分析 | 第20-21页 |
2.3 DCTN基因家族在SKCM中的生存分析 | 第21-23页 |
2.3.1 临床数据指标的生存分析 | 第21页 |
2.3.2 DCTN基因的高低表达分组 | 第21-22页 |
2.3.3 DCTN基因家族的各个基因单因素生存分析 | 第22页 |
2.3.4 多因素生存分析(Cox回归模型) | 第22页 |
2.3.5 SKCM各肿瘤分期中基因表达量的差异分析 | 第22-23页 |
2.3.6 联合生存分析(Joint-effects analysis) | 第23页 |
2.3.7 列线图(Nomogram) | 第23页 |
2.4 对影响预后的DCTN家族基因的机制探究 | 第23-25页 |
2.4.1 GSEA的概述 | 第23-24页 |
2.4.2 GSEA的数据文件准备及分析 | 第24-25页 |
2.5 数据录入与统计分析 | 第25-26页 |
第3部分 结果 | 第26-157页 |
3.1 纳入病例 | 第26页 |
3.2 DCTN家族基因在正常各器官组织中的表达量 | 第26页 |
3.3 DCTN家族基因在皮肤癌组织和皮肤正常组织中表达的差异 | 第26-27页 |
3.4 DCTN家族基因以及相关基因的共表达 | 第27页 |
3.5 DCTN家族基因在SKCM中表达量层面的相关性 | 第27-33页 |
3.6 DCTN家族基因的GO和 KEGG富集分析结果 | 第33-35页 |
3.7 SKCM患者的临床基线资料生存分析结果 | 第35-37页 |
3.8 DCTN家族基因的生存分析 | 第37-46页 |
3.8.1 DCTN家族基因高低分组及差异性检验结果 | 第37-38页 |
3.8.2 DCTN家族单因素生存分析和多因素生存分析 | 第38-40页 |
3.8.3 DCTN2、DCTN5和DCTN6在各肿瘤分期中的表达差异 | 第40-41页 |
3.8.4 联合生存分析 | 第41-44页 |
3.8.5 列线图 | 第44-46页 |
3.9 GSEA分析结果 | 第46-49页 |
3.10 GSEA详细结果表格 | 第49-157页 |
第4部分 讨论 | 第157-166页 |
第5部分 结论 | 第166页 |
第6部分 参考文献 | 第166-181页 |
综述 基于TCGA(The Cancer Genome Atlas)和多组学数据的皮肤黑色素瘤研究进展 | 第181-203页 |
第1部分 皮肤黑色素瘤的临床资料 | 第181-189页 |
第2部分 TCGA和多组学数据的应用 | 第189-193页 |
第3部分 展望 | 第193页 |
第4部分 参考文献 | 第193-203页 |
致谢 | 第203-205页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第205页 |