摘要 | 第5-8页 |
ABSTRACT | 第8-11页 |
引言 | 第15-16页 |
第一章 文献综述 | 第16-22页 |
1.1 刺参肠道菌群与养殖环境菌群结构研究进展 | 第16-18页 |
1.1.1 刺参肠道菌群的研究进展 | 第16-17页 |
1.1.2 刺参养殖环境菌群的研究进展 | 第17-18页 |
1.2 微生物菌群的主要研究方法 | 第18-19页 |
1.2.1 传统微生物培养法 | 第18页 |
1.2.2 变性梯度凝胶电泳技术 | 第18页 |
1.2.3 RFLP技术 | 第18-19页 |
1.2.4 高通量测序技术 | 第19页 |
1.3 水产养殖用益生菌作用机理及种类 | 第19-20页 |
1.4 益生菌在刺参养殖中的应用 | 第20-22页 |
第二章 养殖刺参早期发育阶段体内可培养细菌的菌群特征及其与环境菌群相关性分析 | 第22-36页 |
2.1 材料与方法 | 第23-24页 |
2.1.1 早期发育阶段养殖刺参样品的采集及处理 | 第23页 |
2.1.2 菌株的分离、纯化与保藏 | 第23-24页 |
2.1.3 细菌16SrDNA序列测定 | 第24页 |
2.1.4 数据分析 | 第24页 |
2.2 结果与分析 | 第24-33页 |
2.2.1 幼体不同发育期体内及环境可培养细菌的定量分析 | 第24-26页 |
2.2.2 不同发育期消化道及养殖系统可培养优势菌的分离及鉴定.. | 第26-31页 |
2.2.3 不同发育期幼体体内菌群与环境菌群相关性分析 | 第31-33页 |
2.3 讨论 | 第33-36页 |
第三章 应用高通量测序技术分析养殖刺参早期发育阶段菌群结构演替及其与环境菌群相关性分析 | 第36-50页 |
3.1 材料与方法 | 第36-38页 |
3.1.1 早期发育阶段养殖刺参样品的采集 | 第36页 |
3.1.2 样品处理与保存 | 第36-37页 |
3.1.3 细菌总DNA的提取、扩增及高通量测序 | 第37页 |
3.1.4 数据处理与分析 | 第37-38页 |
3.2 结果与分析 | 第38-46页 |
3.2.1 刺参早期发育各阶段消化道菌群多样性分析 | 第38-39页 |
3.2.2 刺参早期发育各阶段不同样本菌群OTUs比较分析 | 第39-41页 |
3.2.3 刺参幼体菌群与环境菌群的物种相对丰度分析(门水平) | 第41-43页 |
3.2.4 刺参幼体菌群与环境菌群的物种相对丰度分析(科水平) | 第43-45页 |
3.2.5 刺参幼体菌群与环境菌群的相关性分析 | 第45-46页 |
3.3 讨论 | 第46-50页 |
3.3.1 刺参早期发育各阶段幼体菌群结构及其演替 | 第47-49页 |
3.3.2 刺参早期发育各阶段幼体菌群与环境菌群的相关性分析 | 第49-50页 |
第四章 潜在益生菌的筛选及其对刺参生长、消化、非特异性免疫反应的影响 | 第50-65页 |
4.1 材料与方法 | 第50-54页 |
4.1.1 菌株来源 | 第50页 |
4.1.2 培养基及牛津杯孔平板的制作 | 第50-51页 |
4.1.3 拮抗菌的筛选 | 第51页 |
4.1.4 拮抗菌产酶能力测定 | 第51页 |
4.1.5 潜在益生菌的安全性评价 | 第51-52页 |
4.1.6 潜在益生菌的鉴定 | 第52-53页 |
4.1.7 潜在益生菌的使用效果评价 | 第53-54页 |
4.2 结果与分析 | 第54-63页 |
4.2.1 拮抗菌的筛选 | 第54-55页 |
4.2.2 拮抗菌的产酶能力测定 | 第55-56页 |
4.2.3 拮抗菌的安全性评价 | 第56-57页 |
4.2.4 生理生化鉴定 | 第57-58页 |
4.2.5 系统发育分析 | 第58页 |
4.2.6 特基拉芽孢杆菌YB-ZS5-D的使用效果评价 | 第58-63页 |
4.3 讨论 | 第63-65页 |
小结 | 第65-67页 |
参考文献 | 第67-74页 |
攻读硕士学位期间研究成果 | 第74-75页 |
致谢 | 第75页 |