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养殖刺参早期发育阶段菌群结构演替及潜在益生菌的筛选

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-11页
引言第15-16页
第一章 文献综述第16-22页
    1.1 刺参肠道菌群与养殖环境菌群结构研究进展第16-18页
        1.1.1 刺参肠道菌群的研究进展第16-17页
        1.1.2 刺参养殖环境菌群的研究进展第17-18页
    1.2 微生物菌群的主要研究方法第18-19页
        1.2.1 传统微生物培养法第18页
        1.2.2 变性梯度凝胶电泳技术第18页
        1.2.3 RFLP技术第18-19页
        1.2.4 高通量测序技术第19页
    1.3 水产养殖用益生菌作用机理及种类第19-20页
    1.4 益生菌在刺参养殖中的应用第20-22页
第二章 养殖刺参早期发育阶段体内可培养细菌的菌群特征及其与环境菌群相关性分析第22-36页
    2.1 材料与方法第23-24页
        2.1.1 早期发育阶段养殖刺参样品的采集及处理第23页
        2.1.2 菌株的分离、纯化与保藏第23-24页
        2.1.3 细菌16SrDNA序列测定第24页
        2.1.4 数据分析第24页
    2.2 结果与分析第24-33页
        2.2.1 幼体不同发育期体内及环境可培养细菌的定量分析第24-26页
        2.2.2 不同发育期消化道及养殖系统可培养优势菌的分离及鉴定..第26-31页
        2.2.3 不同发育期幼体体内菌群与环境菌群相关性分析第31-33页
    2.3 讨论第33-36页
第三章 应用高通量测序技术分析养殖刺参早期发育阶段菌群结构演替及其与环境菌群相关性分析第36-50页
    3.1 材料与方法第36-38页
        3.1.1 早期发育阶段养殖刺参样品的采集第36页
        3.1.2 样品处理与保存第36-37页
        3.1.3 细菌总DNA的提取、扩增及高通量测序第37页
        3.1.4 数据处理与分析第37-38页
    3.2 结果与分析第38-46页
        3.2.1 刺参早期发育各阶段消化道菌群多样性分析第38-39页
        3.2.2 刺参早期发育各阶段不同样本菌群OTUs比较分析第39-41页
        3.2.3 刺参幼体菌群与环境菌群的物种相对丰度分析(门水平)第41-43页
        3.2.4 刺参幼体菌群与环境菌群的物种相对丰度分析(科水平)第43-45页
        3.2.5 刺参幼体菌群与环境菌群的相关性分析第45-46页
    3.3 讨论第46-50页
        3.3.1 刺参早期发育各阶段幼体菌群结构及其演替第47-49页
        3.3.2 刺参早期发育各阶段幼体菌群与环境菌群的相关性分析第49-50页
第四章 潜在益生菌的筛选及其对刺参生长、消化、非特异性免疫反应的影响第50-65页
    4.1 材料与方法第50-54页
        4.1.1 菌株来源第50页
        4.1.2 培养基及牛津杯孔平板的制作第50-51页
        4.1.3 拮抗菌的筛选第51页
        4.1.4 拮抗菌产酶能力测定第51页
        4.1.5 潜在益生菌的安全性评价第51-52页
        4.1.6 潜在益生菌的鉴定第52-53页
        4.1.7 潜在益生菌的使用效果评价第53-54页
    4.2 结果与分析第54-63页
        4.2.1 拮抗菌的筛选第54-55页
        4.2.2 拮抗菌的产酶能力测定第55-56页
        4.2.3 拮抗菌的安全性评价第56-57页
        4.2.4 生理生化鉴定第57-58页
        4.2.5 系统发育分析第58页
        4.2.6 特基拉芽孢杆菌YB-ZS5-D的使用效果评价第58-63页
    4.3 讨论第63-65页
小结第65-67页
参考文献第67-74页
攻读硕士学位期间研究成果第74-75页
致谢第75页

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