基因调控网络差异性比对算法研究
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 课题背景与意义 | 第12-14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-19页 |
| 1.2.1 基因组学及基因调控网络重建研究概况 | 第14-16页 |
| 1.2.2 生物网络相似性比对研究概况 | 第16-17页 |
| 1.2.3 生物网络差异性比对研究概况 | 第17-19页 |
| 1.3 本文的主要研究内容和创新点 | 第19-20页 |
| 1.4 论文结构 | 第20-22页 |
| 第二章 网络比对相关概念和方法 | 第22-29页 |
| 2.1 网络比对问题描述 | 第22-23页 |
| 2.2 HGA算法概述 | 第23-26页 |
| 2.2.1 HGA算法介绍 | 第23-24页 |
| 2.2.2 网络比对相关评判标准 | 第24-26页 |
| 2.3 图元及图元向量 | 第26-28页 |
| 2.3.1 图元的基本概念 | 第26页 |
| 2.3.2 图元向量的基本概念 | 第26-28页 |
| 2.4 本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 核心差异子图算法KDS-DN | 第29-42页 |
| 3.1 KDS-DN算法总体框架 | 第29-30页 |
| 3.2 基因筛选和网络构建 | 第30-34页 |
| 3.2.1 基因芯片数据预处理 | 第30-32页 |
| 3.2.2 基因筛选与基因调控网络构建 | 第32-34页 |
| 3.3 网络比对及核心差异性基因选取 | 第34-36页 |
| 3.4 核心差异子图提取 | 第36-39页 |
| 3.4.1 核心差异子图提取规则 | 第36页 |
| 3.4.2 KDS-DN核心差异子图提取算法 | 第36-39页 |
| 3.5 结果评价 | 第39-41页 |
| 3.5.1 差异性评价方法 | 第39-40页 |
| 3.5.2 对比方法 | 第40-41页 |
| 3.6 本章小结 | 第41-42页 |
| 第四章 非小细胞癌核心差异子图分析实验 | 第42-58页 |
| 4.1 数据集及预处理 | 第43-44页 |
| 4.2 基因调控网络构建及比对结果 | 第44-46页 |
| 4.3 基因核心差异化计算结果 | 第46-48页 |
| 4.4 非小细胞癌核心差异子图 | 第48-52页 |
| 4.4.1 核心差异子图提取结果 | 第48-49页 |
| 4.4.2 功能模块分析 | 第49-51页 |
| 4.4.3 核心差异子图结果评价 | 第51-52页 |
| 4.5 GO富集分析 | 第52-55页 |
| 4.6 不同差异化网络比对算法比较 | 第55-56页 |
| 4.7 本章小结 | 第56-58页 |
| 第五章 结论与展望 | 第58-60页 |
| 5.1 结论 | 第58页 |
| 5.2 展望 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 作者在攻读硕士学位期间公开发表的论文 | 第67-68页 |
| 作者在攻读硕士学位期间所作的项目 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 附录 | 第71-77页 |
