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化学反应与结构优化过程中的微动力学研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第1章 绪论第12-17页
    1.1 金团簇表面催化反应动力学研究和配体层结构的快速搜索第13-14页
        1.1.1 金团簇简介及研究热点第13页
        1.1.2 纳米多孔金表面催化CO氧化反应的模拟仿真第13-14页
        1.1.3 硫醇基配体保护纳米团簇快速搜索算法及其应用第14页
    1.2 表面活性剂驱油效能的分子动力学研究第14-15页
        1.2.1 研究背景及简介第14-15页
        1.2.2 表面活性剂驱油效能的分子动力学模拟仿真第15页
    1.3 论文的主要工作第15-16页
    1.4 论文的结构第16-17页
第2章 基础理论与数值算法第17-52页
    2.1 密度泛函理论与数值求解方法第17-21页
        2.1.1 引言第17-18页
        2.1.2 密度泛函理论第18-20页
        2.1.3 密度泛函理论的数值求解第20-21页
    2.2 过渡态理论及其搜寻算法第21-32页
        2.2.1 引言第21-22页
        2.2.2 势能面第22-24页
        2.2.3 过渡态第24-27页
        2.2.4 基于反应物与产物结构的过渡态搜寻算法第27-29页
        2.2.5 同步转变方法第29-30页
        2.2.6 过渡态理论在晶格界面上催化反应中的应用第30-32页
    2.3 化学反应动力学的多尺度模型第32-37页
        2.3.1 研究背景、动机及前景第32-34页
        2.3.2 化学反应动力学数值模拟方法的发展和现状第34-37页
    2.4 基于图形同构理论的动力学蒙特卡罗算法第37-43页
        2.4.1 随机仿真算法的提出第37-39页
        2.4.2 SSA方法的理论基础及化学反应中的实施步骤第39-41页
        2.4.3 KMC的实现方法第41-42页
        2.4.4 图形同构理论第42-43页
        2.4.5 基于图形同构理论的KMC方法第43页
    2.5 分子力场理论第43-47页
        2.5.1 分子力场及其计算优势第44页
        2.5.2 分子力场构成与描述方法第44-46页
        2.5.3 常用分子力场的分类与区别第46页
        2.5.4 分子力场的局限第46-47页
    2.6 分子动力学方程的数值求解第47-50页
        2.6.1 Verlet算法第47-48页
        2.6.2 蛙跳(Leap-frog)算法第48-49页
        2.6.3 Velocity Verlet算法第49-50页
        2.6.4 时间步长的选择第50页
    2.7 元启发式算法第50-52页
        2.7.1 遗传算法第50-51页
        2.7.2 模拟退火算法第51-52页
第3章 纳米多孔金表面CO氧化反应的KMC数值模拟第52-78页
    3.1 催化反应微动力学研究现状第52-53页
    3.2 纳米多孔金表面催化反应微观模型及要解决的问题第53-56页
    3.3 晶格界面上发生的催化基元反应第56-58页
    3.4 算法实现第58-71页
        3.4.1 图形的导入第59-60页
        3.4.2 基元反应的数字矩阵表达第60-62页
        3.4.3 图形同构计算第62-64页
        3.4.4 晶格表面形貌的数字矩阵表达第64-70页
        3.4.5 算法流程第70-71页
    3.5 KMC模拟结果及分析第71-77页
        3.5.1 KMC模拟仿真实验条件第71页
        3.5.2 模拟仿真结果分析第71-75页
        3.5.3 实验结论第75-77页
    3.6 本章小结第77-78页
第4章 表面活性剂驱油效能的分子动力学模拟第78-102页
    4.1 表面活性剂第78-80页
        4.1.1 表面活性剂的分类与性质第78-79页
        4.1.2 表面活性剂的化学结构特点第79页
        4.1.3 表面活性剂的降粘机理第79-80页
    4.2 PCFF分子力场与LAMMPS求解器第80-85页
        4.2.1 PCFF分子力场第80-83页
        4.2.2 LAMMPS求解器第83-85页
    4.3 分子动力学在石油化学工业中的应用第85-86页
    4.4 表面活性剂作用下原油从岩石层剥离过程的分子动力学模拟第86-100页
        4.4.1 Si02基底表面的构建第86-87页
        4.4.2 仿真模型其他部分的构建第87-89页
        4.4.3 不含表面活性剂的静态水与油分子膜的相互作用第89-90页
        4.4.4 表面活性剂分子在油层剥离和水分子通道形成过程的作用第90-97页
        4.4.5 SiO_2基底表面极性对水分子通道形成的影响第97-99页
        4.4.6 水相流速对水分子通道形成的影响第99-100页
    4.5 本章小结第100-102页
第5章 硫醇配体保护金纳米团簇结构快速搜索算法及应用第102-134页
    5.1 硫醇配体保护金纳米团簇表面配体层最稳定构型的快速结构搜索方法第102-106页
    5.2 团簇和配体层能量的计算方法第106页
    5.3 两种用于快速搜索硫醇配体保护金纳米团簇表面最优配体取向构型的计算方法第106-116页
        5.3.1 基于L-J势的单粒子简化能量计算和配体构型搜索结构方法第107-111页
        5.3.2 遗传算法和分子力学结构优化和能量计算的杂化方法及其实现第111-116页
    5.4 Au_(38)(SR)_(20)团簇最稳定配体保护层的结构搜索及两种算法的效率比较第116-127页
        5.4.1 团簇结构第116-118页
        5.4.2 L-J排序法及其缺点第118-121页
        5.4.3 分子力学优化-遗传算法杂化计算方法实现及结果比较第121-126页
        5.4.4 四种配体稳定化能的比较第126页
        5.4.5 两类算法效率比较第126-127页
    5.5 Au_(22)(SR)_(18)团簇的全局结构搜索第127-132页
    5.6 本章小结第132-134页
第6章 总结与展望第134-138页
    6.1 总结第134-135页
    6.2 将来工作展望第135-138页
        6.2.1 密度泛函理论的数值计算第135-136页
        6.2.2 大尺度问题的KMC加速第136页
        6.2.3 性质更活跃的金属构成的反应基底的程序设计问题第136页
        6.2.4 LAMMPS软件与其他宏观尺度仿真软件的多尺度计算第136-138页
参考文献第138-145页
致谢第145-146页
附录A 基于图形同构理论的KMC流程图第146-147页
附录B 分子动力学算法流程图第147-148页
附录C 遗传算法和分子力学杂化方法第148-149页
附录D PCFF力场参数第149-157页
附录E 第四章补充数值实验结果第157-165页
附录F 单位换算及相关常数第165-166页
附录G 遗传算法与Forcite计算参数值第166-167页
个人简历、攻读学位期间发表论文目录第167页

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