| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| 1 长江三角洲白山羊笔料毛概况 | 第10-12页 |
| 1.1 山羊笔料毛 | 第10页 |
| 1.2 长江三角洲白山羊笔料毛生产 | 第10-11页 |
| 1.3 长江三角洲白山羊种质资源的研究与保护现状 | 第11-12页 |
| 2 羊毛纤维及毛囊的结构特点 | 第12-16页 |
| 2.1 羊毛纤维及毛囊的基本结构 | 第12-15页 |
| 2.2 长江三角洲白山羊毛纤维结构特点 | 第15页 |
| 2.3 影响毛囊生长发育的因素 | 第15-16页 |
| 3 RNA-Seq技术发展及应用 | 第16-18页 |
| 3.1 测序技术的发展 | 第16-17页 |
| 3.2 RNA-Seq技术优势 | 第17-18页 |
| 4 冷冻切片技术的发展及应用 | 第18页 |
| 5 SSCP技术发展及应用 | 第18-20页 |
| 6 本研究的目的与意义 | 第20-21页 |
| 第二章 长江三角洲白山羊皮肤组织转录组分析 | 第21-43页 |
| 1 引言 | 第21页 |
| 2 材料与试剂 | 第21-24页 |
| 2.1 试验样品的准备 | 第21页 |
| 2.2 主要仪器设备 | 第21-22页 |
| 2.3 主要试剂 | 第22-23页 |
| 2.4 试剂的配制 | 第23页 |
| 2.5 引物设计及合成 | 第23-24页 |
| 3 试验方法 | 第24-29页 |
| 3.1 皮肤组织总RNA提取及检测 | 第24-25页 |
| 3.1.1 皮肤组织总RNA的提取 | 第24页 |
| 3.1.2 RNA的完整性检测 | 第24-25页 |
| 3.2 cDNA文库的建立及验证 | 第25页 |
| 3.3 上机测序 | 第25-26页 |
| 3.4 数据过滤 | 第26页 |
| 3.5 数据处理 | 第26-27页 |
| 3.5.1 转录组从头拼接 | 第26页 |
| 3.5.2 Unigene的功能注释 | 第26页 |
| 3.5.3 Unigene的eggNOG分析 | 第26页 |
| 3.5.4 Unigene表达量及差异表达基因分析 | 第26-27页 |
| 3.5.5 差异表达基因的GO功能显著性富集分析 | 第27页 |
| 3.5.6 差异表达基因的代谢通路显著富集分析 | 第27页 |
| 3.6 转录组数据库的验证 | 第27-29页 |
| 3.6.1 皮肤组织总RNA提取及检测 | 第27页 |
| 3.6.2 反转录合成cDNA第一条链 | 第27-28页 |
| 3.6.3 引物特异性检测 | 第28页 |
| 3.6.3.1 PCR产物扩增 | 第28页 |
| 3.6.3.2 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第28页 |
| 3.6.4 荧光定量PCR | 第28-29页 |
| 3.7 优质笔料毛性状重要基因的筛选 | 第29页 |
| 4 实验结果 | 第29-41页 |
| 4.1 RNA浓度与完整性检测 | 第29页 |
| 4.2 转录组序列组装及基因功能注释结果 | 第29-30页 |
| 4.2.1 从头拼接结果 | 第30页 |
| 4.2.2 基因功能注释结果 | 第30页 |
| 4.3 Unigene的eggNOG分析 | 第30-31页 |
| 4.4 差异表达基因 | 第31-34页 |
| 4.5 差异表达基因GO功能显著性富集分析 | 第34-35页 |
| 4.6 差异表达基因代谢通路显著性富集分析 | 第35-38页 |
| 4.7 影响优质笔料毛性状重要基因及通路的筛选 | 第38-39页 |
| 4.8 荧光定量试验结果 | 第39-41页 |
| 4.8.1 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第39页 |
| 4.8.2 基因溶解曲线 | 第39-41页 |
| 4.8.3 基因相对表达量结果 | 第41页 |
| 5 讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 MAP3K1基因多态性分析 | 第43-50页 |
| 1 引言 | 第43页 |
| 2 材料与试剂 | 第43-44页 |
| 2.1 试验样品的准备 | 第43页 |
| 2.2 主要仪器设备 | 第43页 |
| 2.3 主要试剂 | 第43页 |
| 2.4 试剂的配制 | 第43-44页 |
| 3 试验方法 | 第44-47页 |
| 3.1 基因组DNA的提取及检测 | 第44-45页 |
| 3.2 可能的SNP位点筛选 | 第45页 |
| 3.3 引物设计 | 第45页 |
| 3.4 引物特异性检测 | 第45-46页 |
| 3.4.1 PCR产物扩增 | 第45-46页 |
| 3.4.2 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第46页 |
| 3.5 PCR-SSCP检测 | 第46-47页 |
| 3.5.1 PCR产物扩增 | 第46页 |
| 3.5.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第46页 |
| 3.5.3 聚丙烯酰胺凝胶染色 | 第46-47页 |
| 3.5.4 基因型的判定 | 第47页 |
| 4 结果 | 第47-49页 |
| 4.1 PCR产物琼脂糖凝胶电泳图 | 第47-48页 |
| 4.2 PCR产物聚丙烯酰胺凝胶电泳图 | 第48-49页 |
| 5 讨论 | 第49-50页 |
| 第四章 长江三角洲白山羊皮肤毛囊结构的观察 | 第50-56页 |
| 1 引言 | 第50页 |
| 2 材料与试剂 | 第50-51页 |
| 2.1 试验样品的准备 | 第50页 |
| 2.2 主要仪器设备 | 第50页 |
| 2.3 主要试剂和耗材 | 第50页 |
| 2.4 试剂的配制 | 第50-51页 |
| 2.5 软件 | 第51页 |
| 3 试验方法 | 第51-52页 |
| 3.1 冰冻切片的制作 | 第51页 |
| 3.2 切片的HE染色 | 第51页 |
| 3.3 切片的观察和拍照 | 第51-52页 |
| 3.4 初级毛囊密度计算 | 第52页 |
| 4 实验结果 | 第52-55页 |
| 4.1 皮肤纵切切片的观察 | 第52-53页 |
| 4.2 皮肤横切切片的观察与初级毛囊密度计算 | 第53-55页 |
| 5 讨论 | 第55-56页 |
| 全文结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 附录 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文 | 第69-70页 |