| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-28页 |
| 1.1 植物的抗病机制 | 第13-20页 |
| 1.1.1 植物病原菌种类 | 第13页 |
| 1.1.2 植物先天免疫系统 | 第13-14页 |
| 1.1.3 植物的抗病机制 | 第14-16页 |
| 1.1.4 抗病相关植物激素 | 第16-19页 |
| 1.1.4.1 水杨酸 | 第17-18页 |
| 1.1.4.2 茉莉酸 | 第18-19页 |
| 1.1.4.3 乙烯 | 第19页 |
| 1.1.5 植物抗病信号通路 | 第19-20页 |
| 1.2 香蕉枯萎病研究进展 | 第20-22页 |
| 1.2.1 香蕉枯萎病及其危害 | 第20-21页 |
| 1.2.2 香蕉抗枯萎病机理研究 | 第21-22页 |
| 1.3 RNA-Seq研究进展 | 第22-25页 |
| 1.4 DGE测序的原理 | 第25-27页 |
| 1.5 技术路线 | 第27-28页 |
| 第二章 Foc TR4侵染香蕉后病程的观察及香蕉根系生理变化 | 第28-39页 |
| 2.1 引言 | 第28页 |
| 2.2 材料与方法 | 第28-31页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第28页 |
| 2.2.2 病原菌的培养和收集 | 第28页 |
| 2.2.3 香蕉枯萎病菌的病程观察 | 第28-29页 |
| 2.2.4 试验中的测定方法 | 第29-31页 |
| 2.2.5 数据统计 | 第31页 |
| 2.3 结果与分析 | 第31-37页 |
| 2.3.1 香蕉枯萎病发病症状 | 第31-33页 |
| 2.3.2 Foc TR4侵染香蕉根系的组织病理学观察 | 第33-35页 |
| 2.3.3 Foc TR4侵染香蕉根系的生理生化变化 | 第35-37页 |
| 2.4 讨论 | 第37-38页 |
| 2.4.1 在组织病理学水平上研究Foc TR4侵染香蕉的过程 | 第37页 |
| 2.4.2 从生理生化水平上研究Foc TR4侵染香蕉过程中重要酶活性变化 | 第37-38页 |
| 2.5 小结 | 第38-39页 |
| 第三章 香蕉根系转录组的获得与分析 | 第39-52页 |
| 3.1 引言 | 第39页 |
| 3.2 材料与方法 | 第39-40页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第39页 |
| 3.2.2 实验仪器 | 第39页 |
| 3.2.3 实验试剂 | 第39-40页 |
| 3.3 实验方法 | 第40-44页 |
| 3.3.1 香蕉根系总RNA提取 | 第40-41页 |
| 3.3.2 总RNA质量检测 | 第41页 |
| 3.3.3 Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer检测 | 第41-42页 |
| 3.3.4 转录组文库的构建方法 | 第42-43页 |
| 3.3.5 组装 | 第43页 |
| 3.3.6 数据分析 | 第43-44页 |
| 3.4 实验结果 | 第44-49页 |
| 3.4.1 总RNA质量检测结果 | 第44-46页 |
| 3.4.2 测序数据组装的结果 | 第46-47页 |
| 3.4.3 组装数据的功能注释结果 | 第47-48页 |
| 3.4.4 KEGG代谢途径注释 | 第48-49页 |
| 3.5 讨论 | 第49-51页 |
| 3.5.1 香蕉根系转录组文库组装分析 | 第49-50页 |
| 3.5.2 香蕉根系转录组基因注释分析 | 第50-51页 |
| 3.6 小结 | 第51-52页 |
| 第四章 Foc TR4侵染香蕉根系不同时间的DGE分析 | 第52-90页 |
| 4.1 引言 | 第52页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第52-57页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第52页 |
| 4.2.2 实验仪器 | 第52页 |
| 4.2.3 实验试剂 | 第52页 |
| 4.2.4 实验方法 | 第52-57页 |
| 4.2.4.1 DGE的实验方法 | 第52-53页 |
| 4.2.4.2 生物信息学分析 | 第53-54页 |
| 4.2.4.3 差异基因表达筛选方法 | 第54-55页 |
| 4.2.4.4 GO功能显著性富集分析 | 第55页 |
| 4.2.4.5 荧光定量实验方法 | 第55-57页 |
| 4.2.4.5.1 总RNA的提取 | 第55页 |
| 4.2.4.5.2 cDNA第一链的合成 | 第55-56页 |
| 4.2.4.5.3 荧光定量PCR的引物设计 | 第56-57页 |
| 4.2.4.5.4 荧光定量PCR的反应体系和反应程序 | 第57页 |
| 4.2.4.5.5 荧光定量PCR的定量方法 | 第57页 |
| 4.3 实验结果 | 第57-85页 |
| 4.3.1 DGE数据库测序结果 | 第57-58页 |
| 4.3.2 测序质量评估 | 第58-61页 |
| 4.3.3 测序饱和度分析 | 第61-62页 |
| 4.3.4 接种Foc TR4不同时期香蕉根系差异基因表达分析 | 第62-85页 |
| 4.3.4.1 差异表达基因的筛选 | 第62-63页 |
| 4.3.4.2 差异表达基因的鉴定 | 第63-66页 |
| 4.3.4.3 GO功能显著性富集分析 | 第66-68页 |
| 4.3.4.4 下调表达基因分析 | 第68-70页 |
| 4.3.4.5 KEGG功能显著性富集分析 | 第70-85页 |
| 4.4 讨论 | 第85-89页 |
| 4.4.1 DGE结果概述 | 第85-86页 |
| 4.4.2 代谢途径在香蕉易感枯萎病中的机制 | 第86-88页 |
| 4.4.3 香蕉易感Foc TR4的工作模型 | 第88-89页 |
| 4.5 小结 | 第89-90页 |
| 第五章 水杨酸在香蕉响应Foc TR4过程中的作用 | 第90-123页 |
| 5.1 引言 | 第90-91页 |
| 5.2 材料与方法 | 第91-92页 |
| 5.2.1 材料 | 第91-92页 |
| 5.2.2 主要仪器 | 第92页 |
| 5.2.3 试剂 | 第92页 |
| 5.3 方法 | 第92-97页 |
| 5.3.1 莽草酸途径和苯丙素生物合成途径关键酶基因表达的鉴定 | 第92-94页 |
| 5.3.2 水杨酸信号途径相关基因表达的鉴定 | 第94-96页 |
| 5.3.3 不同浓度SA处理病原菌 | 第96页 |
| 5.3.4 香蕉根系对水杨酸的敏感性 | 第96页 |
| 5.3.5 水杨酸含量的测定 | 第96页 |
| 5.3.5.1 水杨酸标准曲线的制备 | 第96页 |
| 5.3.5.2 香蕉根系中水杨酸的提取 | 第96页 |
| 5.3.5.3 水杨酸含量的测定 | 第96页 |
| 5.3.6 数据统计分析 | 第96-97页 |
| 5.4 结果与分析 | 第97-111页 |
| 5.4.1 全转录组条件下部分莽草酸途径和苯丙素合成途径相关基因的获得与分析 | 第97页 |
| 5.4.2 莽草酸途径基因在不同抗性的香蕉品种在响应Foc TR4中的表达分析 | 第97-100页 |
| 5.4.3 苯丙素合成途径基因在不同抗性的香蕉品种在响应Foc TR4中的表达分析 | 第100-105页 |
| 5.4.4 全转录组条件下水杨酸信号途径相关基因的获得与生物信息学分析 | 第105页 |
| 5.4.5 全转录组条件下水杨酸信号途径相关基因的获得与分析 | 第105-109页 |
| 5.4.6 不同抗性的香蕉品种响应Foc TR4侵染过程中SA含量的变化 | 第109-111页 |
| 5.4.6.1 SA标准曲线的绘制 | 第109-110页 |
| 5.4.6.2 接种Foc TR4后香蕉根系水杨酸含量变化 | 第110-111页 |
| 5.5 外源水杨酸诱导香蕉抗枯萎病的作用效果及机理研究 | 第111-120页 |
| 5.5.1 水杨酸对Foc TR4生长特性的影响 | 第111-112页 |
| 5.5.2 水杨酸对香蕉幼苗的生长特性的影响 | 第112-113页 |
| 5.5.3 水杨酸预处理后挑战接种对香蕉抗病性的效果 | 第113-114页 |
| 5.5.4 水杨酸预处理后挑战接种对香蕉内源水杨酸的影响 | 第114-115页 |
| 5.5.5 水杨酸预处理后挑战接种对莽草酸途径关建酶基因表达的影响 | 第115-117页 |
| 5.5.6 水杨酸预处理后挑战接种对苯丙素合成途径关建酶基因表达的影响 | 第117-119页 |
| 5.5.7 水杨酸预处理后挑战接种对水杨酸信号途径相关基因表达的影响 | 第119-120页 |
| 5.6 讨论 | 第120-122页 |
| 5.6.1 水杨酸含量在早期受到抑制是香蕉易感枯萎病的原因 | 第120-121页 |
| 5.6.2 外源水杨酸与香蕉的抗病性 | 第121-122页 |
| 5.7 小结 | 第122-123页 |
| 总结 | 第123-124页 |
| 参考文献 | 第124-143页 |
| 发表论文 | 第143-144页 |
| 致谢 | 第144页 |
