| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-24页 |
| 1.1 DNA条形码 | 第10-12页 |
| 1.1.1 DNA条形码概述 | 第10-11页 |
| 1.1.2 DNA条形码原理及操作流程 | 第11页 |
| 1.1.3 DNA条形码数据库及分子标记 | 第11-12页 |
| 1.2 新一代测序技术 | 第12-15页 |
| 1.2.1 新一代测序技术的出现 | 第12-13页 |
| 1.2.2 新一代测序技术简介 | 第13-15页 |
| 1.3 DNA复合条形码技术——DNA条形码技术与高通量测序技术的结合 | 第15-22页 |
| 1.3.1 DNA复合条形码技术概述 | 第15-16页 |
| 1.3.2 DNA复合条形码技术的流程 | 第16-17页 |
| 1.3.3 DNA复合条形码技术的分子标记 | 第17-18页 |
| 1.3.4 DNA复合条形码技术的多样本同时测序 | 第18页 |
| 1.3.5 DNA复合条形码技术的测序数据分析 | 第18-19页 |
| 1.3.6 DNA复合条形码技术研究现状 | 第19-22页 |
| 1.4 土壤动物概述 | 第22页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第22-24页 |
| 第2章 研究方法 | 第24-42页 |
| 2.1 实验设备与试剂 | 第24-26页 |
| 2.1.1 实验设备 | 第24-25页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第25页 |
| 2.1.3 实验试剂配制 | 第25-26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-30页 |
| 2.2.1 样本的采集 | 第26页 |
| 2.2.2 中小型土壤动物的分离 | 第26-27页 |
| 2.2.3 总DNA的提取 | 第27-28页 |
| 2.2.4 PCR扩增 | 第28-30页 |
| 2.2.5 PCR产物的测序 | 第30页 |
| 2.3 数据处理与分析 | 第30-42页 |
| 2.3.1 软件及数据库 | 第30-31页 |
| 2.3.2 序列数据fastq格式 | 第31-32页 |
| 2.3.3 参考序列集的整理 | 第32-33页 |
| 2.3.4 序列的分类学注释 | 第33-39页 |
| 2.3.5 分类学注释结果的分析 | 第39-42页 |
| 第3章 结果与分析 | 第42-64页 |
| 3.1 总DNA质量检测 | 第42-43页 |
| 3.1.1 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第42页 |
| 3.1.2 超微量核酸分析仪检测 | 第42-43页 |
| 3.2 18SrRNA基因分析结果 | 第43-51页 |
| 3.2.1 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第43页 |
| 3.2.2 序列的质量控制 | 第43-44页 |
| 3.2.3 OTU的聚类及代表序列选取 | 第44-45页 |
| 3.2.4 稀释曲线 | 第45-46页 |
| 3.2.5 物种组成 | 第46-47页 |
| 3.2.6 α多样性分析 | 第47页 |
| 3.2.7 β多样性分析 | 第47-49页 |
| 3.2.8 样本聚类 | 第49-50页 |
| 3.2.9 系统发育树 | 第50-51页 |
| 3.3 COI基因分析结果 | 第51-58页 |
| 3.3.1 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第51页 |
| 3.3.2 序列的质量控制 | 第51-52页 |
| 3.3.3 OTU的聚类及代表序列选取 | 第52页 |
| 3.3.4 稀释曲线 | 第52-53页 |
| 3.3.5 物种组成 | 第53-54页 |
| 3.3.6 α多样性 | 第54页 |
| 3.3.7 β多样性 | 第54-56页 |
| 3.3.8 样本聚类 | 第56-57页 |
| 3.3.9 系统发育树 | 第57-58页 |
| 3.4 总结果 | 第58-64页 |
| 3.4.1 稀释曲线 | 第58-59页 |
| 3.4.2 两个分子标记的共有类群 | 第59-60页 |
| 3.4.3 物种组成 | 第60-61页 |
| 3.4.4 α多样性分析 | 第61页 |
| 3.4.5 β多样性分析 | 第61-62页 |
| 3.4.6 样本聚类 | 第62-64页 |
| 第4章 讨论与结论 | 第64-68页 |
| 参考文献 | 第68-78页 |
| 附录 | 第78-92页 |
| 致谢 | 第92-94页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第94页 |