围产期奶牛脂肪肝抗性的全基因组关联分析
| 中文摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 引言 | 第10-22页 |
| 1.1 奶牛脂肪肝研究进展 | 第10-18页 |
| 1.1.1 奶牛脂肪肝的分类 | 第11-12页 |
| 1.1.2 奶牛脂肪肝病因的研究进展 | 第12-14页 |
| 1.1.3 奶牛脂肪肝特征及病理研究进展 | 第14-16页 |
| 1.1.4 脂肪肝的防治 | 第16-18页 |
| 1.2 SNP技术的研究进展 | 第18页 |
| 1.2.1 SNP简介 | 第18页 |
| 1.2.2 SNP作为分子标记的的优点 | 第18页 |
| 1.3 全基因组关联分析 | 第18-21页 |
| 1.3.1 GWAS试验设计及其统计分析方法 | 第19-20页 |
| 1.3.2 全基因组关联分析在牛中的应用 | 第20-21页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-25页 |
| 2.1 围产期奶牛脂肪肝发病情况及采样时间确定 | 第22页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第22页 |
| 2.1.2 测定仪器和试剂 | 第22页 |
| 2.1.3 试验方法 | 第22页 |
| 2.1.4 数据分析 | 第22页 |
| 2.2 奶牛脂肪肝性状全基因组关联分析 | 第22-25页 |
| 2.2.1 试验动物 | 第22页 |
| 2.2.2 测定仪器和试剂 | 第22-23页 |
| 2.2.3 试验方法 | 第23页 |
| 2.2.4 数据处理 | 第23-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-39页 |
| 3.1 围产期奶牛脂肪肝发病情况及采样时间的确定 | 第25-27页 |
| 3.2 奶牛脂肪肝性状全基因组关联分析 | 第27-39页 |
| 3.2.1 生化数据分析 | 第27-29页 |
| 3.2.2 个体和SNP质量控制 | 第29-31页 |
| 3.2.3 主成分分析 | 第31-32页 |
| 3.2.4 全基因组关联分析显著性阈值的确定 | 第32-33页 |
| 3.2.5 全基因组关联分析的结果 | 第33-39页 |
| 4 讨论 | 第39-45页 |
| 4.1 奶牛脂肪肝表型数据的准确性 | 第39-41页 |
| 4.2 围产期奶牛脂肪肝发病情况及采样时间的确定 | 第41页 |
| 4.3 芯片密度 | 第41-42页 |
| 4.4 群体结构和多重检验的校正 | 第42-43页 |
| 4.5 显著性位点及相关基因 | 第43-45页 |
| 5 结论 | 第45页 |
| 下一步研究计划 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-58页 |
| 附录 | 第58-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
