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毕赤酵母HXT和MIG基因对于AOX1启动子的碳源阻遏功能

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第1章 文献综述第13-22页
   ·毕赤酵母AOX1启动子碳源阻遏第13-16页
     ·毕赤酵母表达系统第13-14页
       ·毕赤酵母表达系统的发展及其优点第13页
       ·毕赤酵母表达系统的主要问题第13-14页
     ·酵母中碳源阻遏现象第14页
     ·毕赤酵母AOX1启动子的调控第14-16页
   ·碳源阻遏机制第16-20页
     ·酿酒酵母中葡萄糖抑制的信号转导途径第16-18页
     ·Mig1介导的碳源阻遏机制第18-20页
   ·毕赤酵母过氧化物酶体自噬第20-21页
   ·本课题的研究背景及意义第21-22页
第2章 己糖运载体编码基因PpHXT1和PpHXT2的功能鉴定第22-37页
   ·前言第22页
   ·实验材料第22-23页
     ·菌株和质粒第22页
     ·培养基和培养条件第22-23页
     ·分子生物学试剂第23页
   ·实验方法第23-25页
     ·毕赤酵母总蛋白的提取第23页
     ·AOX酶活以及SDS-PAGE/Western blotting分析第23-24页
     ·毕赤酵母总RNA的提取第24页
     ·反转录PCR制备cDNA第24页
     ·实时定量PCR测定基因PpHXT1和PpHXT2转录水平第24页
     ·酿酒酵母醋酸锂转化法第24-25页
     ·蓝色荧光标记过氧化物酶体菌株的构建第25页
   ·结果与讨论第25-36页
     ·PpHXT1和PpHXT2基因序列的生物信息学分析第25-28页
       ·己糖运载体PpHxt1和PpHxt2二维结构分析第25-27页
       ·毕赤酵母PpHxt1和PpHxt2进化分析第27-28页
     ·酿酒酵母异源回补实验第28-29页
       ·异源表达质粒pZP10和pZP20的构建第28-29页
       ·毕赤酵母己糖运载体表达质粒回补酿酒酵母hxt-null菌株第29页
     ·葡萄糖浓度对于PpHXT1和PpHXT2转录水平的调控第29-31页
     ·毕赤酵母Δhxt1和Δhxt2突变株的生长特性第31-32页
     ·Δhxt1和Δhxt2突变株在毕赤酵母己糖代谢过程中的作用第32-33页
     ·PpHXT1和PpHXT2在AOX1启动子碳源阻遏中的作用第33-34页
       ·PpHXT1的敲除使果糖和葡萄糖可以诱导AOX1的表达第33页
       ·果糖和葡萄糖诱导AOX1表达酶活的定量测定第33页
       ·AOX1蛋白的Western blotting检测第33-34页
     ·果糖和葡萄糖诱导AOX1表达发生在转录水平第34-36页
   ·小结第36-37页
第3章 Δatg30Δhxt1菌株的构建以及糖诱导分析第37-49页
   ·前言第37页
   ·实验材料第37页
   ·实验方法第37-39页
     ·FM 4-64标记液泡第37页
     ·毕赤酵母GFP表达菌株的构建第37-38页
     ·毕赤酵母GFP单拷贝表达菌株的筛选第38页
     ·流式细胞仪检测GFP表达量第38-39页
   ·结果与讨论第39-47页
     ·Δatg30Δhxt1双敲除菌株的构建第39-41页
       ·PpHXT1敲除载体的构建第39页
       ·PpHXT1敲除片段的获得第39-40页
       ·Δatg30Δhxt1双敲除菌株筛选及PCR验证第40-41页
     ·载体pP-GFP和pP-GS的构建第41-42页
     ·绿色荧光蛋白表达菌株的筛选第42页
     ·Δhxt1-GFP,Δhxt1-GFP-SKL,Δatg30Δhxt1-GFP-SKL菌株GFP拷贝数的测定第42-45页
     ·可利用果糖或葡萄糖诱导AOX1启动子表达GFP的毕赤酵母菌株第45-47页
       ·PpATG30基因的敲除对于毕赤酵母过氧化物酶体自噬的影响第45-46页
       ·过氧化物酶体自噬在Δhxt1菌株AOX1启动子碳源阻遏中的作用第46-47页
   ·小结第47-49页
第4章 碳源阻遏因子编码基因PpMIG1和PpMIG2的克隆与序列分析第49-58页
   ·前言第49页
   ·实验材料第49页
   ·实验方法第49-51页
     ·MIG简并引物的设计第49页
     ·简并PCR获得核心片段第49页
     ·运用Genome walking获得基因全长以及侧翼序列第49-50页
     ·基因序列分析和进化树的构建第50-51页
     ·大肠杆菌Top 10感受态细胞的制备及转化第51页
   ·结果与讨论第51-57页
     ·毕赤酵母MIG基因简并引物的设计第51页
     ·PpMIG1和PpMIG2基因核心片段的克隆第51-53页
     ·PpMIG1和PpMIG2基因全长以及侧翼序列的获得第53-54页
     ·毕赤酵母MIG基因序列分析第54-57页
   ·小结第57-58页
第5章 Δmig1和Δmig2菌株的构建第58-71页
   ·前言第58页
   ·实验材料第58-59页
   ·实验方法第59-61页
     ·毕赤酵母感受态制备及电穿孔转化第59-60页
     ·毕赤酵母基因组的抽提第60页
     ·引物设计以及PCR反应条件第60-61页
   ·结果与讨论第61-70页
     ·PpMIGI体外敲除片段的构建第61-64页
       ·载体pUC18Mi1 5’和pUC18Mi1 3’的构建第61-62页
       ·载体pUC18Mi1 5'-Ble的构建第62-63页
       ·载体pUC18Mi1 5'-ble-Mi1 3’的构建第63-64页
     ·毕赤酵母Δmig1敲除株的构建第64-66页
       ·PpMIG1敲除片段Mil 5'-ble-Mil 3’的获得第64页
       ·PpMIG1敲除片段电转毕赤酵母GS115感受态第64页
       ·毕赤酵母Δmig1敲除株的筛选及PCR验证第64-66页
     ·PpMIG2体外敲除片段的构建第66-68页
       ·载体pUC18Mi2 5’和pUC18Mi2 3’的构建第66页
       ·载体pUC18Mi2 5’-KAN的构建第66-67页
       ·载体pUC18Mi2 5'-KAN·Mi2 3’的构建第67-68页
     ·毕赤酵母Δmig2敲除株的构建第68-70页
       ·PpMIG2敲除片段Mi2 5'-KAN-Mi2 3’的获得第68-69页
       ·PpMIG2敲除片段电转毕赤酵母GS115感受态第69页
       ·毕赤酵母Δmig2敲除株的筛选及PCR验证第69-70页
   ·小结第70-71页
第6章 Δmig1Δmig2双敲除菌株的构建第71-77页
   ·前言第71页
   ·实验材料第71-72页
   ·实验方法第72-74页
     ·交配及双倍体的筛选第72-73页
     ·孢子的形成与分析第73-74页
   ·结果与讨论第74-76页
     ·Δmig1Δmig2双敲除菌株的PCR验证第74-75页
     ·4号菌株摇瓶扩大培养和再验证第75-76页
   ·小结第76-77页
第7章 碳源阻遏因子编码基因PpMIG1和PpMIG2的功能鉴定第77-86页
   ·前言第77页
   ·实验材料第77页
   ·实验方法第77页
   ·结果与讨论第77-85页
     ·PpMIG和PpMIG2的敲除在毕赤酵母葡萄糖阻遏中的作用第77页
     ·PpMIG1和PpMIG2在AOX1启动子碳源阻遏中的作用第77-79页
       ·PpMIG1和PpMIG2的敲除使果糖和葡萄糖可以诱导AOX1蛋白的表达第77-78页
       ·甘油诱导AOX1表达酶活的定量测定第78-79页
       ·AOX1蛋白的Western blotting检测第79页
     ·Δmig1Δmig2Δatg30三敲除菌株的构建第79-83页
       ·PpATG30敲除载体的构建第79-81页
       ·PpATG30敲除片段ATG30Up-hph-ATG30Down的获得第81-82页
       ·Δmig1Δmig2Δatg30三敲除菌株筛选及PCR验证第82-83页
     ·Δmig1Δmig2-GFP、Δmig1Δmig2-GFP-SKL和Δmig1Δmig2Δatg30-GFP-SKL单拷贝菌株筛选第83-84页
     ·过氧化物酶体自噬在Δmig1Δmig2菌株AOX1启动子碳源阻遏中的作用第84-85页
   ·小结第85-86页
第8章 结论与展望第86-88页
   ·结论第86-87页
   ·展望第87-88页
参考文献第88-93页
硕士期间的论文发表与专利申请第93-94页
致谢第94-95页
附录1 实验中所用菌株第95-96页

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