| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 研究课题背景介绍 | 第9-31页 |
| 1.1 结核病与结核分枝杆菌 | 第9-23页 |
| 1.1.1 结核病 | 第9页 |
| 1.1.2 结核分枝杆菌的生物特征 | 第9-10页 |
| 1.1.3 结核分枝杆菌在宿主细胞内的生命活动 | 第10-11页 |
| 1.1.4 结核病的治疗 | 第11-13页 |
| 1.1.5 抗结核药物 | 第13-23页 |
| 1.2 研究理论和方法 | 第23-31页 |
| 1.2.1 分子动力学模拟的基本原理 | 第23-26页 |
| 1.2.2 结合自由能计算 | 第26-27页 |
| 1.2.3 分子动力学模拟在结核分枝杆菌耐药机制研究中的应用 | 第27-29页 |
| 1.2.4 本论文的研究意义简介 | 第29-31页 |
| 第二章 结核分枝杆菌对抗结核药物利福平耐药性发生分子机制的分子动力学模拟研究 | 第31-45页 |
| 2.1 研究背景介绍 | 第31-32页 |
| 2.2 理论与方法 | 第32-34页 |
| 2.2.1 模型搭建 | 第32-33页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟 | 第33页 |
| 2.2.3 分析结果 | 第33-34页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第34-44页 |
| 2.3.1 同源模建 | 第34-35页 |
| 2.3.2 体系平衡的监测和结构柔性的对比 | 第35-37页 |
| 2.3.3 利福平与RNA聚合酶β-亚单位的相互作用机制 | 第37-38页 |
| 2.3.4 野生型与突变体之间的MM-GBSA结合自由能比较 | 第38-40页 |
| 2.3.5 RNA聚合酶突变体对利福平耐药的分子机制 | 第40-44页 |
| 2.4 结论 | 第44-45页 |
| 第三章 结核分枝杆菌对抗结核类似药物异烟肼与乙硫异烟胺产生耐药的计算研究 | 第45-60页 |
| 3.1 研究背景介绍 | 第45-47页 |
| 3.2 理论与方法 | 第47-49页 |
| 3.2.1 模型搭建 | 第47-48页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第48页 |
| 3.2.3 分析结果 | 第48页 |
| 3.2.4 残基相互作用网络分析方法介绍 | 第48-49页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第49-58页 |
| 3.3.1 体系平衡的检测 | 第49页 |
| 3.3.2 MM-GBSA结合自由能分析 | 第49-51页 |
| 3.3.3 INH-NAD与野生型enoyc-Acp还原酶的相互作用特征 | 第51-53页 |
| 3.3.4 残基网络分析 | 第53-54页 |
| 3.3.5 突变体系对异烟肼产生耐药的分子机制 | 第54-58页 |
| 3.4 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-73页 |
| 附录 | 第73-78页 |
| 在学期间的研究成果 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
