| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-30页 |
| 1.1 植物病原真菌基因组研究进展 | 第13-14页 |
| 1.2 基因水平转移(HorizontalGeneTransfer,HGT) | 第14-17页 |
| 1.3 微生物的扩张蛋白类似物(expansin-likeprotein) | 第17-18页 |
| 1.4 病程相关蛋白1类似物(PR1-likeprotein) | 第18-22页 |
| 1.5 植物识别病原菌的入侵模型(InvasionModel) | 第22-25页 |
| 1.6 苹果树腐烂病及其病菌生物学的研究进展 | 第25-29页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第29-30页 |
| 第二章 苹果树腐烂病菌的基因组测序分析 | 第30-70页 |
| 2.1 引言 | 第30页 |
| 2.2 材料和方法 | 第30-33页 |
| 2.2.1 供试菌株 | 第30页 |
| 2.2.2 光学图谱构建 | 第30-31页 |
| 2.2.3 基因组测序及组装 | 第31页 |
| 2.2.4 基因预测和注释 | 第31页 |
| 2.2.5 交配型的鉴定及分析 | 第31-32页 |
| 2.2.6 基因家族分析 | 第32页 |
| 2.2.7 转录组和RT-qPCR分析 | 第32页 |
| 2.2.8 基因家族功能注释 | 第32页 |
| 2.2.9 次生代谢相关基因(簇)的鉴定和分析 | 第32-33页 |
| 2.2.10 水平转移基因的鉴定 | 第33页 |
| 2.2.11 腐烂菌植物蛋白类似物的鉴定 | 第33页 |
| 2.3 结果与分析 | 第33-67页 |
| 2.3.1 V.mali基因组的基本特征 | 第33-42页 |
| 2.3.2 V.mali对苹果树皮环境的适应性分析 | 第42-46页 |
| 2.3.3 致病相关基因的比较基因组分析 | 第46-57页 |
| 2.3.4 关键致病相关基因的预测分析及鉴定 | 第57-67页 |
| 2.4 讨论 | 第67-70页 |
| 第三章 Expansin-like蛋白VmEXLX1被植物识别的机制 | 第70-84页 |
| 3.1 引言 | 第70页 |
| 3.2 材料和方法 | 第70-72页 |
| 3.2.1 供试菌株与植物材料 | 第70页 |
| 3.2.2 生物信息分析 | 第70页 |
| 3.2.3 腐烂菌遗传转化 | 第70页 |
| 3.2.4 农杆菌介导的烟草瞬时转化 | 第70-71页 |
| 3.2.5 H_2O_2、胼胝质的检测和台盼蓝染色 | 第71页 |
| 3.2.6 荧光观察 | 第71页 |
| 3.2.7 蛋白提取及westernblot | 第71页 |
| 3.2.8 互作靶标的鉴定 | 第71-72页 |
| 3.2.9 双分子荧光互补(BiFC)和免疫共沉淀(CoIP) | 第72页 |
| 3.2.10 核盘菌接种本氏烟 | 第72页 |
| 3.3 结果与分析 | 第72-82页 |
| 3.3.1 VmEXLX1可能被寄主识别 | 第72页 |
| 3.3.2 VmEXLX1能诱导植物防卫反应 | 第72-75页 |
| 3.3.3 VmEXLX1定位于植物细胞膜 | 第75页 |
| 3.3.4 VmEXLX1被本氏烟NbSRLK1识别 | 第75-78页 |
| 3.3.5 NbSRLK1能诱导细胞死亡和防卫反应 | 第78-79页 |
| 3.3.6 NbSRLK1促进VmEXLX1的降解 | 第79-80页 |
| 3.3.7 VmEXLX1促进NbSRLK1诱导的细胞死亡 | 第80页 |
| 3.3.8 苹果SRLK可以识别VmEXLX | 第80-82页 |
| 3.4 讨论 | 第82-84页 |
| 第四章 VmPR1c被植物Skp1降解后激发免疫反应 | 第84-101页 |
| 4.1 引言 | 第84页 |
| 4.2 材料和方法 | 第84-85页 |
| 4.2.1 供试菌株与植物材料 | 第84页 |
| 4.2.2 生物信息分析 | 第84页 |
| 4.2.3 腐烂菌遗传转化 | 第84页 |
| 4.2.4 酵母双杂交(Y2H) | 第84页 |
| 4.2.5 其它 | 第84-85页 |
| 4.3 结果与分析 | 第85-99页 |
| 4.3.1 VmPR1c是主要的致病因子 | 第85-87页 |
| 4.3.3 VmPR1c诱导植物防卫反应 | 第87-88页 |
| 4.3.4 VmPR1c定位于植物细胞核 | 第88-90页 |
| 4.3.5 VmPR1c诱导的细胞死亡与其降解有关 | 第90-94页 |
| 4.3.6 苹果Skp1识别并促进VmPR1c的降解及其诱导的细胞死亡 | 第94-95页 |
| 4.3.7 脯氨酸和α-helix结构影响VmPR1c的降解 | 第95-99页 |
| 4.4 讨论 | 第99-101页 |
| 第五章 结论及展望 | 第101-103页 |
| 5.1 结论 | 第101-102页 |
| 5.2 展望 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-118页 |
| 致谢 | 第118-120页 |
| 作者简介 | 第120-121页 |
