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胰岛β细胞脂毒性和糖脂毒性的系统生物学研究及DDX1的功能研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
中英文对照及英文缩写词表第10-15页
第一章 引言第15-32页
    1.1 糖尿病的分类第15-17页
        1.1.1 1型糖尿病第15-16页
        1.1.2 2型糖尿病第16页
        1.1.3 特殊类型糖尿病第16-17页
        1.1.4 妊娠型糖尿病第17页
    1.2 糖尿病的分子机制研究进展第17-20页
        1.2.1.1 型糖尿病的分子机制第17-18页
        1.2.2.2 型糖尿病的分子机制第18-20页
    1.3 糖脂毒性研究进展第20-23页
        1.3.1 糖脂毒性影响胰岛β细胞凋亡的机制研究第21-22页
        1.3.2 糖脂毒性对胰岛β细胞GSIS功能损伤的机制研究第22-23页
        1.3.3 糖脂毒性的系统生物学研究第23页
    1.4 胰岛素的合成与分泌研究进展第23-26页
    1.5 DDX家族蛋白及DDX1的研究进展第26-27页
    1.6 mRNA的可变剪切第27-29页
    1.7 系统生物学第29-30页
    1.8 本论文立题依据、研究内容及意义第30-32页
第二章 以INS1细胞为模型系统研究脂毒性和糖脂毒性对胰岛β细胞功能的影响第32-63页
    2.1 材料与方法第32-45页
        2.1.1 细胞培养及糖脂毒性模型的建立第33-34页
        2.1.2 增殖检测第34页
        2.1.3 凋亡检测第34页
        2.1.4 ELISA检测胰岛素含量第34-35页
        2.1.5 MAPS-seq第35-38页
        2.1.6 蛋白质组样品制备及检测第38-39页
        2.1.7 qRT-PCR第39-42页
        2.1.8 Western-blot第42页
        2.1.9 生物信息学分析转录组和蛋白组第42-43页
        2.1.10 Far1和Setd8高表达细胞系的构建第43页
        2.1.11 利用Crisper/Cas9体系构建Pkcδ敲除细胞系第43-44页
        2.1.12 统计学分析第44-45页
    2.2 实验结果第45-60页
        2.2.1 高脂和高糖高脂处理对INS1细胞表型的影响第45-47页
        2.2.2 转录组和蛋白质组结果第47-48页
        2.2.3 qRT-PCR结果第48页
        2.2.4 生物信息学分析转录组和蛋白质组第48-50页
        2.2.5 内质网应激通路变化第50-51页
        2.2.6 脂代谢第51-52页
        2.2.7 Far1高表达促进高脂导致的内质网应激第52-53页
        2.2.8 Pkcδ敲除抑制脂毒性第53-56页
        2.2.9 SETD8对胰岛β细胞增殖的影响第56-58页
        2.2.10 糖脂毒性与脂毒性的比较第58-59页
        2.2.11 分泌囊泡相关基因的变化第59-60页
    2.3 讨论第60-61页
    2.4 本章结论第61-63页
第三章 DDX1介导高脂抑制胰岛素的翻译第63-87页
    3.1 材料与方法第63-68页
        3.1.1 细胞培养第63页
        3.1.2 ChIRP第63-65页
        3.1.3 银染第65页
        3.1.4 免疫共沉淀第65页
        3.1.5 DDX1低表达和高表达稳定细胞系的构建第65-66页
        3.1.6 模拟磷酸化突变的DDX1高表达细胞系的构建第66页
        3.1.7 ELISA检测胰岛素第66页
        3.1.8 Clip-seq第66-67页
        3.1.9 新翻译蛋白检测第67页
        3.1.10 免疫荧光第67-68页
        3.1.11 高脂喂养及小鼠胰岛分离第68页
        3.1.12 统计学分析第68页
    3.2 实验结果第68-84页
        3.2.1 高脂处理抑制胰岛素的翻译第68-70页
        3.2.2 胰岛素mRNA结合蛋白DDX1的鉴定和验证第70-71页
        3.2.3 低表达和过表达DDX1对胰岛素翻译的影响第71-73页
        3.2.4 DDX1介导高脂抑制胰岛素翻译第73-74页
        3.2.5 高脂促进DDX1与胰岛素mRNA分子的解离及入核第74-77页
        3.2.6 高脂导致DDX1磷酸化抑制胰岛素翻译第77-78页
        3.2.7 DDX1相互作用蛋白的鉴定第78-79页
        3.2.8 Clip-seq鉴定DDX1相互作用的RNA分子种类与RNA结合位点第79-83页
        3.2.9 高脂喂养抑制小鼠胰岛β细胞胰岛素的翻译第83-84页
    3.3 讨论第84-85页
    3.4 本章结论第85-87页
第四章 DDX1对全基因组mRNA的可变剪接及表达量的影响第87-96页
    4.1 材料和方法第87-88页
        4.1.1 RNA-seq建库及测序第87页
        4.1.2 差异基因分析第87-88页
        4.1.3 可变剪接分析第88页
        4.1.4 ELISA检测胰岛素分泌第88页
        4.1.5 统计学分析第88页
    4.2 结果第88-94页
        4.2.1 DDX1对全基因组基因表达量的影响第88-89页
        4.2.2 DDX1选择性地调节基因表达第89-91页
        4.2.3 DDX1对全基因组mRNA可变剪接的影响第91-92页
        4.2.4 DDX1影响mRNA可变剪接机制的初步研究第92-93页
        4.2.5 DDX1对胰岛β细胞功能的影响第93-94页
    4.3 讨论第94页
    4.4 本章结论第94-96页
全文总结第96-98页
参考文献第98-112页
致谢第112-114页
博士期间学术成果第114-115页

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