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烟粉虱—豇豆轻斑驳病毒—寄主植物互作及植物防御机制研究

摘要第4-6页
abstract第6-8页
英文缩略表第9-13页
第一章 前言第13-27页
    1.1 烟粉虱第13-14页
    1.2 烟粉虱传播的植物病毒第14-16页
        1.2.1 豇豆轻斑驳病毒第15-16页
            1.2.1.1 豇豆轻斑驳病毒的分类地位第15页
            1.2.1.2 豇豆轻斑驳病毒的分布第15页
            1.2.1.3 豇豆轻斑驳病毒的危害第15-16页
            1.2.1.4 豇豆轻斑驳病毒与媒介昆虫烟粉虱互作的研究现状第16页
    1.3 植物、植物病毒和介体昆虫的互作第16-18页
    1.4 RNA测序在昆虫和植物上的应用第18-21页
        1.4.1 RNA测序简介第18-19页
        1.4.2 RNA测序技术原理第19-20页
        1.4.3 转录组学在昆虫和植物上的应用第20-21页
    1.5 本研究目的和研究内容第21-23页
        1.5.1 研究目的第21页
        1.5.2 主要内容第21-23页
    附表图第23-27页
第二章 B烟粉虱种群及接种豇豆轻斑驳病毒方法的建立第27-35页
    2.1 材料与方法第28-31页
        2.1.1 烟粉虱样本的采集第28页
        2.1.2 烟粉虱隐种的鉴定第28-29页
            2.1.2.1 烟粉虱总DNA的提取方法第28页
            2.1.2.2 MtCO1SCAR标记鉴定烟粉虱隐种第28-29页
            2.1.2.3 MtCO1基因测序方法对烟粉虱隐种鉴定第29页
        2.1.3 CPMMV的人工接种及鉴定第29-30页
            2.1.3.1 人工摩擦接种CPMMV第29页
            2.1.3.2 CPMMV的RT-PCR鉴定第29-30页
        2.1.4 主要试剂第30页
        2.1.5 主要仪器第30-31页
    2.2 结果与分析第31页
        2.2.1 MtCO1测序、SCAR方法鉴定烟粉虱隐种结果第31页
        2.2.2 感染CPMMV菜豆的发病症状第31页
        2.2.3 CPMMV的PCR鉴定第31页
    2.3 讨论第31-33页
    附图第33-35页
第三章 CPMMV侵染菜豆对于B烟粉虱寄主选择和产卵偏好性的影响第35-41页
    3.1 材料与方法第36-37页
        3.1.1 室内烟粉虱种群和寄主植物第36页
        3.1.2 供试病毒第36页
        3.1.3 带毒菜豆植株的获取第36页
        3.1.4 B烟粉虱对健康和CPMMV感染的菜豆寄主选择性测定第36-37页
        3.1.5 数据分析第37页
    3.2 结果与分析第37页
    3.3 讨论第37-39页
    附图第39-41页
第四章 CPMMV侵染菜豆对B烟粉虱生物学特性的影响第41-47页
    4.1 材料与方法第41-42页
        4.1.1 室内B烟粉虱种群和寄主植物第41页
        4.1.2 供试病毒第41页
        4.1.3 健康和带毒菜豆植株的获取第41-42页
        4.1.4 B烟粉虱在健康和CPMMV感染植株上生物学特性的比较第42页
        4.1.5 数据分析第42页
    4.2 结果与分析第42页
    4.3 讨论第42-44页
    附图第44-47页
第五章 CPMMV侵染菜豆对B烟粉虱内共生菌数量的影响第47-53页
    5.1 材料与方法第48-49页
        5.1.1 B烟粉虱种群和寄主植物第48页
        5.1.2 试验设计第48页
        5.1.3 烟粉虱DNA提取及内共生菌的检测第48页
        5.1.4 荧光定量PCR试验第48-49页
        5.1.5 数据处理第49页
    5.2 结果第49-50页
        5.2.1 B烟粉虱种群内生菌的鉴定第49页
        5.2.2 CPMMV侵染菜豆对B烟粉虱原生和次生共生菌数量的影响第49-50页
    5.3 讨论第50-51页
    附图第51-53页
第六章 植物防御相关基因在CPMMV与菜豆互作不同时期的表达第53-67页
    6.1 材料与方法第53-56页
        6.1.1 供试病毒第53页
        6.1.2 带毒菜豆植株的获取第53-54页
        6.1.3 RNA提取及cDNA合成第54页
        6.1.4 植物防御基因选择及引物设计第54-55页
        6.1.5 荧光定量PCR第55-56页
        6.1.6 数据处理第56页
    6.2 结果第56页
        6.2.1 候选基因的验证第56页
        6.2.2 植物防卫基因的表达第56页
    6.3 讨论第56-59页
    附表图第59-67页
第七章 RNA-seq表达谱研究CPMMV与菜豆的互作机制第67-106页
    7.1 材料与方法第68-70页
        7.1.1 供试病毒第68页
        7.1.2 带毒菜豆植株的获取第68页
        7.1.3 RNA抽提与Illumina测序第68页
        7.1.4 RNA-Seq数据分析流程第68-70页
            7.1.4.1 RNA-Seq原始数据处理第69页
            7.1.4.2 与参考序列的比对第69页
            7.1.4.3 基因功能注释及相关生物学意义的阐释第69-70页
    7.2 结果与分析第70-82页
        7.2.1 测序数据质量情况汇总第70页
        7.2.2 差异表达基因的统计第70-72页
        7.2.3 GO分析第72-74页
        7.2.4 差异基因表达水平聚类分析第74-75页
        7.2.5 差异表达基因的代谢途径(Pathway)富集分析第75-82页
    7.3 讨论第82-87页
    附表图第87-106页
第八章 全文总结第106-111页
    8.1 全文主要结论第106-109页
    8.2 创新之处第109-110页
    8.3 下一步研究设想第110-111页
参考文献第111-128页
致谢第128-129页
作者简历第129-130页

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