| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-11页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-10页 |
| 1.3 本文研究内容与结构安排 | 第10-11页 |
| 第二章 蛋白质折叠结构预测问题 | 第11-16页 |
| 2.1 蛋白质折叠结构问题 | 第11-12页 |
| 2.2 蛋白质二级结构预测 | 第12-13页 |
| 2.3 蛋白这折叠结构预测的模型——非格点 AB 模型 | 第13-14页 |
| 2.4 蛋白质数据库和算法并行化 | 第14-15页 |
| 2.5 本章小结 | 第15-16页 |
| 第三章 并行计算和网格技术 | 第16-28页 |
| 3.1 并行计算的相关知识 | 第16-19页 |
| 3.1.1 并行计算的形式 | 第16-17页 |
| 3.1.2 并行程序的设计模型 | 第17-18页 |
| 3.1.3 网格计算 | 第18-19页 |
| 3.2 网格平台的特点 | 第19-26页 |
| 3.2.1 网格的体系结构 | 第19-22页 |
| 3.2.2 网格的安全机制 | 第22-23页 |
| 3.2.3 网格的资源分配管理 | 第23-24页 |
| 3.2.4 网格的数据传输 | 第24-25页 |
| 3.2.5 基于网格的并行计算 | 第25-26页 |
| 3.3 基于 MPI 实现的网格编程接口 | 第26-27页 |
| 3.4 本章小结 | 第27-28页 |
| 第四章 蛋白质结构预测在网格平台上的研究 | 第28-37页 |
| 4.1 遗传退火算法 | 第28-30页 |
| 4.2 遗传退火算法并行模型 | 第30-31页 |
| 4.3 并行遗传退火算法的改进策略 | 第31-32页 |
| 4.4 蛋白质折叠问题在网格上的实现 | 第32-36页 |
| 4.4.1 问题的实现框架 | 第32-34页 |
| 4.4.2 关键问题的进一步实现 | 第34-36页 |
| 4.5 本章小结 | 第36-37页 |
| 第五章 实验结果与分析 | 第37-40页 |
| 5.1 实验环境 | 第37页 |
| 5.2 Fibonacci 蛋白质序列 | 第37页 |
| 5.3 实验结果对比 | 第37-39页 |
| 5.4 本章小结 | 第39-40页 |
| 第六章 总结与展望 | 第40-42页 |
| 6.1 总结 | 第40页 |
| 6.2 展望 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 附录 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 详细摘要 | 第47-52页 |