| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 引言 | 第13-23页 |
| 0.1 热休克蛋白Hsp70研究概况 | 第13-17页 |
| 0.1.1 Hsp70的分类及基本特性 | 第13-14页 |
| 0.1.2 Hsp70的作用机制及功能 | 第14-16页 |
| 0.1.3 Hsp70对淀粉样蛋白沉积疾病的调节作用 | 第16-17页 |
| 0.2 酵母细胞质Hsp70研究概况 | 第17-19页 |
| 0.2.1 酵母细胞质中Hsp70的分类及基本特性 | 第17-18页 |
| 0.2.2酵母细胞中Ssa1对酵母朊病毒[PSI+]繁殖的影响 | 第18-19页 |
| 0.3 计算生物学研究概况 | 第19-22页 |
| 0.3.1 计算生物学简介 | 第19-20页 |
| 0.3.2 分子动力学模拟简介 | 第20-21页 |
| 0.3.3 拉伸分子动力学模拟简介 | 第21-22页 |
| 0.4 研究目的和意义 | 第22-23页 |
| 第一章 Ssa1蛋白NBD点突变体对ADP相互作用的分子动力学模拟研究 | 第23-38页 |
| 1.1 研究背景 | 第23-24页 |
| 1.2 计算方法 | 第24-26页 |
| 1.2.1 模型构建 | 第24页 |
| 1.2.2 分子动力学模拟 | 第24-25页 |
| 1.2.3 拉伸分子动力学模拟 | 第25页 |
| 1.2.4 分析方法 | 第25-26页 |
| 1.3 结果与讨论 | 第26-36页 |
| 1.3.1 分子动力学模拟中稳定性与波动性分析 | 第26-28页 |
| 1.3.2 分子动力学模拟中ADP与NBD相互作用分析 | 第28-29页 |
| 1.3.3 拉伸动力学模拟中的最适初始参数 | 第29-30页 |
| 1.3.4 拉伸动力学模拟中ADP从NBD解离过程的相互作用能量分析 | 第30-33页 |
| 1.3.5 拉伸动力学模拟ADP从NBD解离过程中重要作用残基分析 | 第33-36页 |
| 1.4 小结 | 第36-38页 |
| 第二章 分子动力学模拟Ssa1蛋白NBD点突变体与ADP相互作用体系的验证与应用 | 第38-45页 |
| 2.1 研究背景 | 第38-39页 |
| 2.2 计算方法 | 第39-40页 |
| 2.2.1 模型构建 | 第39页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟 | 第39页 |
| 2.2.3 拉伸分子动力学模拟 | 第39-40页 |
| 2.2.4 分析方法 | 第40页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第40-44页 |
| 2.3.1 T36突变体分子动力学模拟中稳定性确定 | 第40-41页 |
| 2.3.2 拉伸过程中的ADP与NBD之间相互作用能量分析 | 第41-43页 |
| 2.3.3 拉伸过程中的ADP与NBD之间重要作用残基分析 | 第43-44页 |
| 2.4 小结 | 第44-45页 |
| 第三章 Ssa1蛋白NBD点突变体对ATP相互作用的动力学模拟研究 | 第45-55页 |
| 3.1 研究背景 | 第45页 |
| 3.2 计算方法 | 第45-47页 |
| 3.2.1 模型构建 | 第45-46页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第46页 |
| 3.2.3 拉伸分子动力学模拟 | 第46-47页 |
| 3.2.4 分析方法 | 第47页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第47-54页 |
| 3.3.1 分子动力学模拟中稳定性与波动性分析 | 第47-48页 |
| 3.3.2 拉伸过程中最适拉伸速度与弹簧系数确定 | 第48-49页 |
| 3.3.3 拉伸过程中的ATP与NBD之间相互作用能量分析 | 第49-52页 |
| 3.3.4 ATP与NBD结合时起重要作用的残基分析 | 第52-54页 |
| 3.4 小结 | 第54-55页 |
| 结论与展望 | 第55-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文情况 | 第64页 |
