| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-15页 |
| ·课题研究背景 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-12页 |
| ·研究内容与创新 | 第12-13页 |
| ·文章结构与安排 | 第13-15页 |
| 第二章 相关技术理论 | 第15-29页 |
| ·微阵列基因芯片技术和基因表达数据 | 第15-21页 |
| ·微阵列基因芯片技术原理 | 第16-18页 |
| ·微阵列基因芯片技术的数据挖掘 | 第18-20页 |
| ·基因表达数据常用的数据库 | 第20-21页 |
| ·基因调控网络的概念 | 第21-22页 |
| ·转录因子结合位点 | 第22页 |
| ·基因调控网络分析和重建 | 第22-25页 |
| ·基因调控网络分析 | 第23-24页 |
| ·基因调控网络重建 | 第24-25页 |
| ·状态空间方法 | 第25-27页 |
| ·变分贝叶斯学习 | 第27-29页 |
| 第三章 基于多源信息融合的动态基因调控网络构建 | 第29-37页 |
| ·动态基因网络构建 | 第29-30页 |
| ·数据准备和预处理 | 第30-31页 |
| ·实验方法设计 | 第31-33页 |
| ·基因表达时间序列的状态空间模型 | 第31-32页 |
| ·基于转录因子结合位点信息的先验分布 | 第32-33页 |
| ·实验结果分析 | 第33-37页 |
| ·隐状态数对网络的影响 | 第33页 |
| ·不加入结合位点信息与加入结合位点信息网络构建状况比较 | 第33-34页 |
| ·对已知基因关系的识别 | 第34-35页 |
| ·识别出的有生物学意义的网络 | 第35-37页 |
| 第四章 基于聚类技术的静态基因相互作用网络比较与分析 | 第37-50页 |
| ·静态基因网络构建 | 第37页 |
| ·聚类分析 | 第37-44页 |
| ·层次聚类（HLC） | 第38-40页 |
| ·K-MEANS 聚类（KMC） | 第40-41页 |
| ·模糊C-均值聚类 | 第41-42页 |
| ·相似性度量指标 | 第42-43页 |
| ·聚类结果分析函数 | 第43-44页 |
| ·聚类方法的比较 | 第44-50页 |
| ·聚类方法在YEAST SACCHAROMYCES CEREVISIAE 网络构建的比较研究 | 第44-48页 |
| ·脑疾病相关基因的比较结果 | 第48-50页 |
| 第五章 总结与展望 | 第50-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 攻硕期间取得的研究成果 | 第59-60页 |
