中医临床表型与基因型集成与分析研究
致谢 | 第5-6页 |
摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-9页 |
1 引言 | 第12-19页 |
1.1 研究背景 | 第12-16页 |
1.1.1 研究现状 | 第13-14页 |
1.1.2 平台数据和主要方法 | 第14-16页 |
1.2 问题提出及研究意义 | 第16-17页 |
1.3 本章小结 | 第17-19页 |
2 数据整合处理与语义集成 | 第19-33页 |
2.1 症状术语的整合处理 | 第19-23页 |
2.1.1 集成术语系统 | 第22页 |
2.1.2 通用表型本体 | 第22-23页 |
2.1.3 专用表型本体 | 第23页 |
2.2 医学术语的规范化处理 | 第23-24页 |
2.3 关系数据的整合处理 | 第24-32页 |
2.3.1 症状与疾病关系 | 第27-28页 |
2.3.2 疾病与基因关系 | 第28页 |
2.3.3 症状与基因关系 | 第28-30页 |
2.3.4 疾病与化学成分关系 | 第30页 |
2.3.5 副作用与药物关系 | 第30页 |
2.3.6 药物与靶点蛋白关系 | 第30-31页 |
2.3.7 副作用与靶点蛋白关系 | 第31页 |
2.3.8 基因与基因关系 | 第31页 |
2.3.9 症状相似疾病的药物治疗 | 第31-32页 |
2.4 本章小结 | 第32-33页 |
3 中医临床表型与基因型数据平台的设计与实现 | 第33-55页 |
3.1 系统介绍 | 第33-37页 |
3.1.1 系统概述及架构 | 第33-37页 |
3.1.2 开发环境 | 第37页 |
3.2 系统表结构设计 | 第37-44页 |
3.2.1 部分关系表表结构 | 第38-41页 |
3.2.2 部分系统功能表结构 | 第41-44页 |
3.3 系统功能介绍及展示 | 第44-54页 |
3.3.1 注册登录及系统界面 | 第44-46页 |
3.3.2 数据查询功能界面 | 第46-49页 |
3.3.3 数据审核功能界面 | 第49-54页 |
3.4 本章小结 | 第54-55页 |
4 表型与基因型相关验证性分析研究 | 第55-72页 |
4.1 相关分析方法 | 第55-58页 |
4.1.1 模块划分方法 | 第55-57页 |
4.1.2 相似性计算方法 | 第57-58页 |
4.1.3 相关性系数 | 第58页 |
4.2 疾病分类的富集分析 | 第58-63页 |
4.2.1 GO富集分析 | 第59-60页 |
4.2.2 基于模块划分的分析方法 | 第60-61页 |
4.2.3 基于相似疾病的分析方法 | 第61页 |
4.2.4 富集数据准确性实验 | 第61-63页 |
4.3 症状关联分析研究 | 第63-71页 |
4.3.1 症状微观机理探究 | 第63-65页 |
4.3.2 疾病语义相似性与症状相似性相关分析 | 第65-67页 |
4.3.3 同类疾病症状探究 | 第67-68页 |
4.3.4 副作用形成机理探究 | 第68-71页 |
4.4 本章小结 | 第71-72页 |
5 结论与展望 | 第72-75页 |
5.1 工作总结 | 第72-73页 |
5.2 未来工作 | 第73-75页 |
参考文献 | 第75-81页 |
作者简历 | 第81-83页 |
学位论文数据集 | 第83页 |