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风湿性心脏病关联基因的筛选鉴定与表达分析

摘要第4-5页
Abstract第5页
第1章 绪论第9-20页
    1.1 课题背景及研究的目的和意义第9-10页
        1.1.1 课题背景及来源第9-10页
        1.1.2 研究的目的及意义第10页
    1.2 风湿性心脏病的研究进展第10-13页
        1.2.1 风湿性心脏病临床表现第10页
        1.2.2 风湿性心脏病的发病机制第10-11页
        1.2.3 风湿性心脏病的流行病学研究第11-12页
        1.2.4 风湿性心脏病的分子生物学研究第12-13页
    1.3 转录组测序技术研究进展第13-16页
        1.3.1 转录组的概念第13页
        1.3.2 转录组测序技术的原理及优势第13-15页
        1.3.3 转录组测序技术的应用及面临的挑战第15-16页
    1.4 TPT1基因的研究进展第16-18页
        1.4.1 TPT1基因序列信息第16页
        1.4.2 TCTP蛋白的表达情况第16-17页
        1.4.3 TCTP蛋白的结构和功能第17-18页
    1.5 主要研究内容及技术路线第18-20页
        1.5.1 主要研究内容第18-19页
        1.5.2 技术路线第19-20页
第2章 实验材料与方法第20-37页
    2.1 实验材料第20-22页
        2.1.1 实验材料、菌株及质粒载体第20页
        2.1.2 实验试剂与试剂盒第20-21页
        2.1.3 实验仪器与常用网站、软件第21-22页
    2.2 实验方法第22-37页
        2.2.1 组织的获取第22-23页
        2.2.2 总RNA提取、逆转录及实时定量PCR第23-25页
        2.2.3 载玻片的处理第25-26页
        2.2.4 HE染色第26页
        2.2.5 RNA探针的制备第26-29页
        2.2.6 组织石蜡切片制备第29-30页
        2.2.7 组织冰冻切片制备第30-31页
        2.2.8 切片荧光原位杂交第31-32页
        2.2.9 荧光免疫组织化学第32页
        2.2.10 Western Blot第32-34页
        2.2.11 甲基化分析第34-37页
第3章 基于RNA-seq数据分析结果的风湿性心脏病关联基因的筛选与鉴定第37-46页
    3.1 引言第37页
    3.2 患者信息第37-38页
    3.3 瓣膜病组与风湿性心脏病组病理特点变化观察第38-39页
    3.4 RNA-seq数据分析和基因筛选第39-43页
        3.4.1 RNA-seq数据检测质量第39页
        3.4.2 分析瓣膜病组和风湿性心脏病组样本基因表达差异第39-40页
        3.4.3 瓣膜病组和风湿性心脏病组样本差异表达基因数量第40-41页
        3.4.4 瓣膜病组和风湿性心脏病组差异表达基因交集基因分类第41页
        3.4.5 瓣膜病组和风湿性心脏病组差异表达基因交集部分GO功能注释第41-42页
        3.4.6 根据RNA-seq数据结果初步选择候选基因第42-43页
    3.5 候选基因表达实验验证第43-44页
        3.5.1 SCARNA21、ACTA1、TRO基因差异水平鉴定第43页
        3.5.2 UBAP2L、SNORD9、TNNT3基因差异表达水平第43-44页
        3.5.3 TPT1基因差异表达水平第44页
    3.6 讨论第44-45页
    3.7 本章小结第45-46页
第4章 TPT1基因在瓣膜病组和风湿性心脏病组样本中的差异表达分析第46-54页
    4.1 引言第46页
    4.2 TPT1 RNA探针合成第46-47页
    4.3 荧光原位杂交分析TPT1的表达情况第47-49页
        4.3.1 荧光原位杂交分析TPT1在瓣膜病组和风湿性心脏病组的表达第47-48页
        4.3.2 荧光原位杂交分析TPT1在成体小鼠心脏组织的表达第48-49页
    4.4 荧光免疫组化分析TPT1在瓣膜病组和风湿性心脏病组样本中的表达41第49-50页
    4.5 Western Blot分析TPT1在瓣膜病组和风湿性心脏病组样本中的表达第50-51页
    4.6 甲基化修饰调控与TPT1表达的关系第51-52页
    4.7 讨论第52-53页
    4.8 本章小结第53-54页
结论第54-55页
展望第55-56页
参考文献第56-62页
附录一第62-63页
附录二第63-65页
致谢第65页

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