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基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒兰群体遗传结构及遗传多样性研究

摘要第3-5页
abstract第5-7页
第1章 引言第11-20页
    1.1 寒兰概况第11-13页
        1.1.1 寒兰生物学和生态学特征第11页
        1.1.2 寒兰研究历史及现状第11-13页
    1.2 遗传多样性第13-16页
        1.2.1 遗传多样性概述第13-14页
        1.2.2 遗传多样性的研究方法第14-16页
            1.2.2.1 形态学水平第14页
            1.2.2.2 细胞学水平第14-15页
            1.2.2.3 生化水平第15页
            1.2.2.4 分子水平第15-16页
    1.3 内转录间隔区(ITS)及叶绿体基因组(cpDNA)分子标记在兰科植物中的应用第16-18页
        1.3.1 内转录间隔区(ITS)结构及特点第16-17页
        1.3.2 叶绿体基因组(cpDNA)结构及特点第17页
        1.3.3 ITS和cp DNA分子标记在兰科植物中的应用第17-18页
    1.4 本研究的内容及意义第18-19页
    1.5 技术路线图第19-20页
第2章 材料与方法第20-29页
    2.1 实验材料第20-23页
        2.1.1 实验材料采集第20-21页
        2.1.2 主要试剂及仪器第21-22页
        2.1.3 主要溶液及配制方法第22-23页
    2.2 实验方法第23-29页
        2.2.1 寒兰基因组DNA的提取与检测第23页
            2.2.1.1 基因组DNA的提取第23页
            2.2.1.2 基因组DNA的检测第23页
        2.2.2 PCR扩增第23-27页
            2.2.2.1 引物筛选第23-26页
            2.2.2.2 ITS-PCR反应体系的建立第26页
            2.2.2.3 cpDNA-PCR反应体系的建立第26-27页
            2.2.2.4 PCR产物的电泳和测序第27页
        2.2.3 数据分析第27-29页
            2.2.3.1 ITS和cp DNA序列分析第27页
            2.2.3.2 遗传多样性分析第27页
            2.2.3.3 单倍型网络图分析第27页
            2.2.3.4 单倍型聚类分析第27-28页
            2.2.3.5 遗传结构分析第28页
            2.2.3.6 中性检验及失配分布分析第28页
            2.2.3.7 遗传距离与地理距离相关性分析第28-29页
第3章 结果与分析第29-53页
    3.1 DNA提取与PCR扩增产物电泳结果第29-30页
    3.2 ITS序列分析第30-45页
        3.2.1 ITS序列特征第30-36页
        3.2.2 ITS单倍型分布与网络图第36-39页
        3.2.3 遗传多样性分析第39页
        3.2.4 单倍型聚类分析第39-42页
        3.2.5 遗传结构分析第42页
        3.2.6 居群动态分析第42-43页
        3.2.7 地理距离与遗传距离相关性检验第43-45页
    3.3 cpDNA序列分析第45-53页
        3.3.1 cpDNA序列特征第45页
        3.3.2 cpDNA单倍型分布与网络图第45-48页
        3.3.3 遗传多样性分析第48-49页
        3.3.4 单倍型聚类分析第49-51页
        3.3.5 遗传结构分析第51页
        3.3.6 居群动态分析第51-53页
第4章 讨论第53-57页
    4.1 序列特征第53页
    4.2 遗传多样性第53-54页
    4.3 遗传结构第54-55页
    4.4 寒兰资源的保护第55-57页
第5章 小结与展望第57-60页
    5.1 小结第57-58页
    5.2 展望第58-60页
致谢第60-61页
参考文献第61-66页
附录A第66-68页
攻读学位期间的研究成果第68页

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