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五种抗菌肽的设计、原核表达和抗菌作用机理研究

内容提要第4-9页
第1章 文献综述第9-35页
    1.1 抗菌肽的来源及分类第10-11页
    1.2 抗菌肽的结构第11-14页
    1.3 抗菌肽的活性相关参数第14-17页
        1.3.1 抗菌肽的构象第15页
        1.3.2 电荷第15-16页
        1.3.3 两亲性和疏水力矩第16-17页
        1.3.4 疏水性第17页
        1.3.5 极角第17页
    1.4 抗菌肽的分子设计第17-22页
        1.4.1 替换、移动或去除氨基酸残基第18-19页
        1.4.2 增加正电荷含量第19页
        1.4.3 片段拼接法设计杂合肽第19-20页
        1.4.4 截取和修饰天然抗菌肽中的活性结构域第20页
        1.4.5 超短肽的设计第20-21页
        1.4.6 环肽设计第21页
        1.4.7 计算机辅助设计抗菌肽第21页
        1.4.8 自组装抗菌肽设计第21-22页
    1.5 抗菌肽的重组表达第22-25页
        1.5.1 硫氧还原蛋白(Thioredoxin)和谷胱甘肽转移酶(GST)标签融合表达第22-23页
        1.5.2 SUMO 标签融合表达第23页
        1.5.3 促凝聚表达标签融合表达第23页
        1.5.4 自我裂解载体融合表达第23-24页
        1.5.5 信号肽标签融合表达第24页
        1.5.6 His-tag 标签融合表达第24-25页
        1.5.7 串联表达第25页
    1.6 抗菌肽的细胞膜作用机理第25-28页
        1.6.1 “桶板”模型第26页
        1.6.2 “毯式”模型第26-27页
        1.6.3 “环形孔”(虫孔) 模型第27页
        1.6.4 “凝聚”模型第27-28页
    1.7 抗菌肽胞内作用机制第28-32页
        1.7.1 与核酸结合,阻断 DNA 复制和 RNA 合成第29-30页
        1.7.2 影响蛋白质合成第30-31页
        1.7.3 阻碍细菌正常分裂第31页
        1.7.4 抑制胞内酶活性第31-32页
        1.7.5 抗菌肽与细菌细胞壁的作用第32页
    1.8 课题立项依据及研究内容第32-35页
第2章 抗菌肽 A20L 的 Ub-tag 和 SUMO1/2/3/4-tag 融合表达及作用机理研究第35-63页
    2.1 序言第35-38页
    2.2 实验材料与设备第38-40页
        2.2.1 实验材料第38-39页
        2.2.2 实验仪器第39-40页
    2.3 实验方法第40-48页
        2.3.1 Ub-A20L 和 SUMO1/2/3/4-A20L 蛋白的基因序列合成第40-42页
        2.3.2 引物设计与 PCR 扩增第42-44页
        2.3.3 PCR 片段、pET 28b+和 pHUE 质粒双酶切及连接第44页
        2.3.4 大肠杆菌感受态细胞(DH 5α、Transetta (DE3))的制备第44-45页
        2.3.5 重组质粒 pET 28b+-SUMO 1/2/3/4-A20L 和 pHUE-A20L 的转化和筛选第45页
        2.3.6 重组质粒 pET 28b+-SUMO 1/2/3/4-A20L 和 pHUE-A20L 的提取与鉴定第45-46页
        2.3.7 Ub-A20L 和 SUMO 1/2/3/4-A20L 融合蛋白的诱导表达第46页
        2.3.8 Ub-A20L 和 SUMO 1/2/3/4-A20L 融合蛋白的纯化第46页
        2.3.9 Ub-A20L 和 SUMO 1/2/3/4-A20L 融合蛋白的酶切第46-47页
        2.3.10 园二色光谱测定 A20L 的二级结构第47页
        2.3.11 抗菌肽 A20L 的 MIC 测定第47页
        2.3.12 抗菌肽 A20L 的 MHC 测定第47页
        2.3.13 细菌细胞外膜渗透性实验第47-48页
        2.3.14 细菌细胞内膜渗透性实验第48页
        2.3.15 色氨酸荧光实验第48页
    2.4 实验结果第48-59页
        2.4.1 重组质粒 pHUE-A20L 和 pET 28b+-SUMO 1/2/3/4-A20L 的构建第48-50页
        2.4.2 pET 28b+-SUMO 1/2/3/4-A20L 和 pHUE-A20L 融合蛋白的表达及纯化第50-53页
        2.4.3 抗菌肽 A20L 的二级结构第53-54页
        2.4.4 抗菌肽 A20L 的抗菌活性与溶血活性第54-55页
        2.4.5 抗菌肽 A20L 膜渗透性第55-56页
        2.4.6 抗菌肽与脂质体相互作用第56-59页
    2.5 讨论第59-61页
    2.6 小结第61-63页
第3章 XPF-St7 来源 α-螺旋抗菌肽的生物信息学设计及作用机理研究第63-79页
    3.1 序言第63页
    3.2 实验材料第63-64页
    3.3 实验方法第64-67页
        3.3.1 α-螺旋抗菌肽的分子设计第64页
        3.3.2 抗菌肽 XPF2 的合成第64页
        3.3.3 pHUE-XPF4 和 pHUE-XPF6 质粒的构建第64-65页
        3.3.4 Ub-XPF4、Ub-XPF6 融合蛋白的表达、纯化及酶切第65-66页
        3.3.5 XPF2、XPF4 和 XPF6 的 MIC 测定第66页
        3.3.6 XPF2、XPF4 和 XPF6 的 MHC 测定第66页
        3.3.7 XPF2、XPF4 和 XPF6 的二级结构测定第66页
        3.3.8 XPF2、XPF4 和 XPF6 的细菌外膜渗透性实验第66-67页
        3.3.9 XPF2、XPF4 和 XPF6 的细菌内膜渗透性实验第67页
        3.3.10 XPF2、XPF4 和 XPF6 与 DNA 的结合实验第67页
    3.4 结果第67-76页
        3.4.1 XPF-St7 衍生肽的分子设计第67-70页
        3.4.2 Ub-XPF4 和 Ub-XPF4 的表达、纯化和酶切第70-72页
        3.4.3 MIC 和 MHC 测定结果第72-73页
        3.4.4 圆二色谱测定结果第73-74页
        3.4.5 膜渗透性实验结果第74-75页
        3.4.6 XPF2、XPF4 和 XPF6 与基因组 DNA 相互作用结果第75-76页
    3.5 讨论第76-77页
    3.6 小结第77-79页
第4章 抗菌肽 AN5-1 的原核表达及双靶点作用机制研究第79-99页
    4.1 序言第79页
    4.2 试剂及实验设备第79页
    4.3 实验方法第79-84页
        4.3.1 pHUE-AN5-1 质粒的构建第79-80页
        4.3.2 Ub-AN5-1 融合蛋白的表达、纯化及酶切第80-81页
        4.3.3 AN5-1 的 MIC 测定第81页
        4.3.4 AN5-1 的 MHC 测定第81页
        4.3.5 AN5-1 的园二色谱实验第81页
        4.3.6 AN5-1 的细菌外膜渗透性实验第81-82页
        4.3.7 AN5-1 细菌内膜渗透性实验第82页
        4.3.8 AN5-1 与基因组 DNA 相互作用的凝胶阻滞分析第82-83页
        4.3.9 AN5-1 与基因组 DNA 相互作用紫外光谱分析第83页
        4.3.10 AN5-1 与 EB 竞争性结合 DNA 的荧光光谱第83-84页
        4.3.11 AN5-1-基因组 DNA 相互作用圆二色光谱分析第84页
    4.4 结果第84-96页
        4.4.1 Ub-AN5-1 的表达,纯化和酶切第84-87页
        4.4.2 AN5-1 抗菌活性与溶血活性第87页
        4.4.3 AN5-1 二级结构第87-88页
        4.4.4 AN5-1 膜渗透性第88-90页
        4.4.5 AN5-1 与基因组 DNA 的凝胶阻滞分析第90页
        4.4.6 AN5-1AN5-1 与基因组 DNA 结合的紫外光谱第90-91页
        4.4.7 AN5-1 与 EB 竞争性结合基因组 DNA 的荧光光谱第91-94页
        4.4.8 AN5-1-基因组 DNA 相互作用圆二色光谱第94-96页
    4.5 讨论第96-97页
    4.6 小结第97-99页
参考文献第99-113页
附录第113-127页
在学期间所取得的成果第127-129页
致谢第129-131页
中文摘要第131-132页
Abstract第132-133页

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