| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-23页 |
| 1.1 蛋白质分子的结构 | 第9-16页 |
| 1.1.1 氨基酸的结构 | 第9-10页 |
| 1.1.2 蛋白质的结构层次 | 第10-13页 |
| 1.1.3 与蛋白质有关的数据库 | 第13-16页 |
| 1.2 蛋白质折叠类型的研究现状 | 第16-20页 |
| 1.3 Bromodomain蛋白的研究现状 | 第20-21页 |
| 1.4 课题来源及意义 | 第21-23页 |
| 第2章 Bromodomain-like折叠类型模板的设计 | 第23-43页 |
| 2.1 引言 | 第23页 |
| 2.2 材料 | 第23-25页 |
| 2.3 方法 | 第25-37页 |
| 2.3.1 家族模板的设计与生成 | 第25-28页 |
| 2.3.2 家族模板系统聚类图的建立及稳定性分析 | 第28-33页 |
| 2.3.3 基于系统聚类图的模板的选取标准和评价 | 第33-37页 |
| 2.4 结果及讨论 | 第37-42页 |
| 2.4.1 模板坐标提取方法的讨论 | 第37-39页 |
| 2.4.2 模板提取数量及参数约束的讨论 | 第39-40页 |
| 2.4.3 设计模板与天然模板的对比分析 | 第40-41页 |
| 2.4.4 模板的普适性与有效性分析 | 第41-42页 |
| 2.5 本章小结 | 第42-43页 |
| 第3章 基于设计模板的Bromodomain-like折叠类型综合分类方法 | 第43-57页 |
| 3.1 引言 | 第43页 |
| 3.2 材料和评估参数 | 第43-44页 |
| 3.2.1 实验集和独立检验集 | 第43页 |
| 3.2.2 模板信息及模板数据库 | 第43-44页 |
| 3.2.3 打分函数及评估参数 | 第44页 |
| 3.3 分类方法与结果讨论 | 第44-56页 |
| 3.3.1 基于单模板的分类方法及结果讨论 | 第44-47页 |
| 3.3.2 基于多模板的综合分类方法及结果讨论 | 第47-49页 |
| 3.3.3 综合分类方法的建立 | 第49-53页 |
| 3.3.4 分类方法的自洽检验与独立性检验 | 第53-56页 |
| 3.4 本章小结 | 第56-57页 |
| 结论与展望 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第65页 |
| 攻读硕士学位期间参加的科研项目 | 第65-67页 |
| 致谢 | 第67页 |