| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 第1章 绪论 | 第9-29页 |
| 1.1 森林生态系统 | 第9-10页 |
| 1.2 神农架——我国典型亚热带森林生态系统 | 第10页 |
| 1.3 土壤微生物 | 第10-13页 |
| 1.3.1 土壤微生物对土壤肥力形成与演变具有重要指征作用 | 第11页 |
| 1.3.2 土壤微生物作用对温室气体排放与控制具有重要意义 | 第11-13页 |
| 1.3.3 土壤微生物作用对污染物形态转化与控制具有重要意义 | 第13页 |
| 1.4 微生物地理学 | 第13-22页 |
| 1.4.1 微生物地理学定义与发展现状 | 第13-14页 |
| 1.4.2 微生物地理学研究内容 | 第14-17页 |
| 1.4.3 微生物生物地理学主要理论 | 第17-21页 |
| 1.4.4 微生物地理学研究意义 | 第21-22页 |
| 1.5 土壤微生物群落研究方法 | 第22-27页 |
| 1.5.1 土壤微生物量研究方法 | 第22-23页 |
| 1.5.2 土壤微生物多样性研究方法 | 第23-27页 |
| 1.6 研究目标、内容与技术路线 | 第27-29页 |
| 1.6.1 研究目标 | 第27页 |
| 1.6.2 研究内容 | 第27-28页 |
| 1.6.3 技术路线 | 第28-29页 |
| 第2章 研究区域概况与研究方法 | 第29-42页 |
| 2.1 研究区域概况——神农架自然保护区 | 第29页 |
| 2.2 实验设计与取样 | 第29-30页 |
| 2.2.1 实验设计 | 第29-30页 |
| 2.2.2 样品采集 | 第30页 |
| 2.3 土壤理化性质与植被参数的测定 | 第30-31页 |
| 2.3.1 土壤理化性质的测定 | 第30-31页 |
| 2.3.2 植被参数的测定 | 第31页 |
| 2.4 土壤样品的功能基因芯片与高通量测序分析 | 第31-36页 |
| 2.4.1 土壤DNA的提取及纯化 | 第31-33页 |
| 2.4.2 基因芯片技术 | 第33-34页 |
| 2.4.3 Illumina测序技术 | 第34-35页 |
| 2.4.4 GeoChip以及Illumina数据预处理 | 第35-36页 |
| 2.5 统计分析 | 第36-42页 |
| 2.5.1 微生物群落结构统计分析 | 第36-38页 |
| 2.5.2 微生物与环境相互作用 | 第38-39页 |
| 2.5.3 微生物网络互作研究 | 第39-42页 |
| 第3章 神农架林线微生物群落结构 | 第42-62页 |
| 3.1 引言 | 第42页 |
| 3.2 研究方法 | 第42-43页 |
| 3.2.1 试验设计与土壤样品采集 | 第42-43页 |
| 3.2.2 土壤理化性质与植被参数测定 | 第43页 |
| 3.2.3 数据获得及分析方法 | 第43页 |
| 3.3 结果与分析 | 第43-59页 |
| 3.3.1 神农架林线处不同林带土壤理化性质的差异 | 第43-44页 |
| 3.3.2 神农架林线处不同林带微生物群落结构的差异 | 第44-47页 |
| 3.3.3 神农架林线处不同林带微生物物种类群的对比 | 第47-48页 |
| 3.3.4 神农架林线处不同林带微生物功能基因组成的对比 | 第48-55页 |
| 3.3.5 神农架林线处不同林带微生物网络结构差异 | 第55页 |
| 3.3.6 神农架林线处微生物群落结构的控制因子 | 第55-59页 |
| 3.4 讨论 | 第59-61页 |
| 3.5 小结 | 第61-62页 |
| 第4章 神农架不同阔叶林微生物群落结构 | 第62-80页 |
| 4.1 引言 | 第62-63页 |
| 4.2 研究方法 | 第63页 |
| 4.2.1 试验设计与土壤样品采集 | 第63页 |
| 4.2.2 土壤理化性质与植被参数测定 | 第63页 |
| 4.2.3 数据获得及分析方法 | 第63页 |
| 4.3 结果与分析 | 第63-77页 |
| 4.3.1 神农架不同阔叶林土壤理化性质的差异 | 第63-67页 |
| 4.3.2 神农架不同阔叶林微生物群落结构的差异 | 第67-68页 |
| 4.3.3 神农架不同阔叶林微生物物种组成的差异 | 第68-69页 |
| 4.3.4 神农架阔叶林微生物群落结构的控制因子 | 第69-71页 |
| 4.3.5 神农架不同阔叶林微生物网络结构差异 | 第71-74页 |
| 4.3.6 微生物C循环基因的变化 | 第74-75页 |
| 4.3.7 微生物N相关基因的变化 | 第75-77页 |
| 4.4 讨论 | 第77-78页 |
| 4.5 小结 | 第78-80页 |
| 第5章 神农架微生物群落结构沿海拔梯度分布 | 第80-98页 |
| 5.1 引言 | 第80-81页 |
| 5.2 研究方法 | 第81-82页 |
| 5.2.1 试验设计与土壤样品采集 | 第81页 |
| 5.2.2 土壤理化性质与植被参数测定 | 第81页 |
| 5.2.3 数据获得及分析方法 | 第81-82页 |
| 5.3 研究结果 | 第82-94页 |
| 5.3.1 神农架土壤理化性质沿海拔变化情况 | 第82-86页 |
| 5.3.2 微生物群落结构随海拔梯度变化规律 | 第86-89页 |
| 5.3.3 广布种与稀有种 | 第89-92页 |
| 5.3.4 生态理论模型与中性理论模型 | 第92页 |
| 5.3.5 微生物物种、功能基因组成与环境因子的关系 | 第92-94页 |
| 5.4 讨论 | 第94-96页 |
| 5.4.1 微生物物种组成地理分布格局 | 第94-95页 |
| 5.4.2 物种特征能否反映功能特征？ | 第95-96页 |
| 5.4.3 微生物地理学分布：从物种组成到功能基因 | 第96页 |
| 5.5 小结 | 第96-98页 |
| 第6章 结论与建议 | 第98-101页 |
| 6.1 主要结论 | 第98-99页 |
| 6.2 创新点 | 第99-100页 |
| 6.3 建议 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-118页 |
| 致谢 | 第118-120页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第120页 |
