摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-7页 |
文献综述 | 第10-20页 |
1.蛋白质组学研究主要技术方法 | 第15-18页 |
2.本研究的目的与意义 | 第18-20页 |
1.引言 | 第20-23页 |
2.材料与方法 | 第23-36页 |
2.1 材料 | 第23-26页 |
2.1.1 供试菌株 | 第23页 |
2.1.2 主要实验试剂和试剂盒 | 第23-24页 |
2.1.3 主要培养基及溶液,抗生素的配置 | 第24页 |
2.1.4 主要仪器设备 | 第24-26页 |
2.1.5 主要使用软件 | 第26页 |
2.2 实验流程图 | 第26页 |
2.3 供试菌株孢悬液的制备及菌株培养 | 第26-27页 |
2.3.1 PDA固体培养基准备 | 第27页 |
2.3.2 罗伯茨绿僵菌分生孢子孢悬液制备 | 第27页 |
2.4 蛋白质制备及浓度测定 | 第27-28页 |
2.4.1 总蛋白提取 | 第27-28页 |
2.4.2 蛋白质浓度的测定 | 第28页 |
2.5 SDS-PAGE凝胶电泳操作步骤 | 第28-29页 |
2.6 iTRAQ标记及强阳离子交换柱(SCX)分离实验 | 第29-30页 |
2.7 液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)实验 | 第30页 |
2.8 生物信息学分析 | 第30-32页 |
2.8.1 质谱数据收集与分析 | 第30-31页 |
2.8.2 蛋白质功能分类 | 第31-32页 |
2.9 定量Real-time RT-PCR实验验证差异表达蛋白 | 第32-36页 |
2.9.1 引物设计 | 第32-33页 |
2.9.2 罗伯茨绿僵菌菌丝和分生孢子RNA提取及质量验证 | 第33-34页 |
2.9.3 罗伯茨绿僵菌RNA反转录实验 | 第34-35页 |
2.9.4 罗伯茨绿僵菌荧光定量PCR实验 | 第35-36页 |
3.结果与分析 | 第36-51页 |
3.1 1d纯菌丝和10d成熟分生孢子显微图 | 第36页 |
3.2 蛋白质电泳结果 | 第36-37页 |
3.3 定量蛋白质样品信息统计 | 第37-38页 |
3.4 蛋白质鉴定结果分析 | 第38-43页 |
3.4.1 肽段匹配误差 | 第38-39页 |
3.4.2 蛋白质鉴定基本信息 | 第39-40页 |
3.4.3 蛋白质相对分子质量分布 | 第40-41页 |
3.4.4 肽段序列长度分布 | 第41页 |
3.4.5 肽段序列覆盖度 | 第41-42页 |
3.4.6 鉴定肽段数量分布 | 第42-43页 |
3.5 鉴定到的所有蛋白质COG注释分类分析 | 第43-44页 |
3.6 蛋白质定量结果分析 | 第44-48页 |
3.6.1 差异蛋白定量信息统计 | 第44-45页 |
3.6.2 差异蛋白的GO富集分析 | 第45-46页 |
3.6.3 差异蛋白的Pathway富集分析 | 第46-48页 |
3.7 其他的关键差异表达蛋白(DEPs)分析 | 第48-49页 |
3.8 定量Real-time RT-PCR验证分析差异表达蛋白 | 第49-51页 |
4.讨论 | 第51-54页 |
4.1 与绿僵菌中已报道的蛋白种类比较 | 第51-52页 |
4.2 与其他丝状真菌中已报道的差异表达蛋白比较 | 第52页 |
4.3 显著差异表达蛋白的关键KEGG通路富集分析 | 第52-54页 |
5.结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-60页 |
附录 | 第60-76页 |
致谢 | 第76-77页 |
个人简介 | 第77页 |