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基于iTRAQ技术的罗伯茨绿僵菌分生孢子和菌丝比较蛋白质组研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
文献综述第10-20页
    1.蛋白质组学研究主要技术方法第15-18页
    2.本研究的目的与意义第18-20页
1.引言第20-23页
2.材料与方法第23-36页
    2.1 材料第23-26页
        2.1.1 供试菌株第23页
        2.1.2 主要实验试剂和试剂盒第23-24页
        2.1.3 主要培养基及溶液,抗生素的配置第24页
        2.1.4 主要仪器设备第24-26页
        2.1.5 主要使用软件第26页
    2.2 实验流程图第26页
    2.3 供试菌株孢悬液的制备及菌株培养第26-27页
        2.3.1 PDA固体培养基准备第27页
        2.3.2 罗伯茨绿僵菌分生孢子孢悬液制备第27页
    2.4 蛋白质制备及浓度测定第27-28页
        2.4.1 总蛋白提取第27-28页
        2.4.2 蛋白质浓度的测定第28页
    2.5 SDS-PAGE凝胶电泳操作步骤第28-29页
    2.6 iTRAQ标记及强阳离子交换柱(SCX)分离实验第29-30页
    2.7 液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)实验第30页
    2.8 生物信息学分析第30-32页
        2.8.1 质谱数据收集与分析第30-31页
        2.8.2 蛋白质功能分类第31-32页
    2.9 定量Real-time RT-PCR实验验证差异表达蛋白第32-36页
        2.9.1 引物设计第32-33页
        2.9.2 罗伯茨绿僵菌菌丝和分生孢子RNA提取及质量验证第33-34页
        2.9.3 罗伯茨绿僵菌RNA反转录实验第34-35页
        2.9.4 罗伯茨绿僵菌荧光定量PCR实验第35-36页
3.结果与分析第36-51页
    3.1 1d纯菌丝和10d成熟分生孢子显微图第36页
    3.2 蛋白质电泳结果第36-37页
    3.3 定量蛋白质样品信息统计第37-38页
    3.4 蛋白质鉴定结果分析第38-43页
        3.4.1 肽段匹配误差第38-39页
        3.4.2 蛋白质鉴定基本信息第39-40页
        3.4.3 蛋白质相对分子质量分布第40-41页
        3.4.4 肽段序列长度分布第41页
        3.4.5 肽段序列覆盖度第41-42页
        3.4.6 鉴定肽段数量分布第42-43页
    3.5 鉴定到的所有蛋白质COG注释分类分析第43-44页
    3.6 蛋白质定量结果分析第44-48页
        3.6.1 差异蛋白定量信息统计第44-45页
        3.6.2 差异蛋白的GO富集分析第45-46页
        3.6.3 差异蛋白的Pathway富集分析第46-48页
    3.7 其他的关键差异表达蛋白(DEPs)分析第48-49页
    3.8 定量Real-time RT-PCR验证分析差异表达蛋白第49-51页
4.讨论第51-54页
    4.1 与绿僵菌中已报道的蛋白种类比较第51-52页
    4.2 与其他丝状真菌中已报道的差异表达蛋白比较第52页
    4.3 显著差异表达蛋白的关键KEGG通路富集分析第52-54页
5.结论第54-55页
参考文献第55-60页
附录第60-76页
致谢第76-77页
个人简介第77页

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