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东北虎脾cDNA文库构建及EST序列生物信息学分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
1 绪论第10-24页
   ·引言第10页
   ·东北虎相关概述第10-11页
     ·东北虎简介第10-11页
     ·东北虎生存保护现状第11页
   ·cDNA文库相关概述第11-18页
     ·cDNA文库简介第11-12页
     ·几种常见的cDNA文库类型第12-17页
     ·文库质量鉴定第17页
     ·cDNA文库的应用第17-18页
   ·表达序列标签相关概述第18-21页
     ·表达序列标签概念与原理第18-19页
     ·表达序列标签的应用第19-21页
   ·生物信息学相关概述第21-24页
     ·生物信息学概念第21页
     ·生物信息学的产生第21-22页
     ·生物信息学的主要步骤第22页
     ·生物信息学的应用第22-24页
2 东北虎脾脏组织cDNA文库的构建第24-38页
   ·实验材料第24-26页
     ·实验动物第24页
     ·主要仪器设备第24-25页
     ·主要试剂第25页
     ·常用试剂配制第25-26页
   ·实验方法第26-32页
     ·Trizol试剂提取东北虎脾组织总RNA第26页
     ·cDNA第一链合成第26-27页
     ·LD-PCR合成ds cDNA第27页
     ·蛋白酶K消化第27-28页
     ·Sfil酶切第28页
     ·CHROMA SPIN-400分选不同长度cDNA第28-29页
     ·cDNA连接载体第29-30页
     ·噬菌体包装第30页
     ·测定未扩增文库滴度以及重组率鉴定第30-31页
     ·未扩增文库插入片段平均长度测定第31页
     ·文库扩增第31页
     ·扩增文库滴度测定第31-32页
   ·实验结果第32-36页
     ·东北虎脾脏总RNA提取第32-33页
     ·双链cDNA合成第33页
     ·cDNA分选第33-34页
     ·连接反应比例确定第34页
     ·cDNA文库质量鉴定第34-36页
   ·讨论第36-37页
   ·本章小结第37-38页
3 EST序列生物信息学分析第38-54页
   ·实验材料第38页
     ·主要分析材料第38页
     ·主要应用软件第38页
   ·实验方法第38-40页
     ·挑取克隆并测序第38页
     ·测序结果初步处理第38-39页
     ·EST序列的聚类拼接第39页
     ·生物信息学分析第39-40页
   ·实验结果第40-53页
     ·EST序列测序结果统计第40-41页
     ·EST长度分析总结第41页
     ·注释基因总结第41-42页
     ·PANTHER分类分析第42-48页
     ·GOrilla分析第48-49页
     ·PPINet分析第49-51页
     ·KEGG分析第51-53页
   ·讨论第53页
   ·本章小结第53-54页
结论第54-55页
参考文献第55-59页
附录第59-61页
攻读学位期间发表的学术论文第61-62页
致谢第62-63页

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