摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-10页 |
1 绪论 | 第10-24页 |
·引言 | 第10页 |
·东北虎相关概述 | 第10-11页 |
·东北虎简介 | 第10-11页 |
·东北虎生存保护现状 | 第11页 |
·cDNA文库相关概述 | 第11-18页 |
·cDNA文库简介 | 第11-12页 |
·几种常见的cDNA文库类型 | 第12-17页 |
·文库质量鉴定 | 第17页 |
·cDNA文库的应用 | 第17-18页 |
·表达序列标签相关概述 | 第18-21页 |
·表达序列标签概念与原理 | 第18-19页 |
·表达序列标签的应用 | 第19-21页 |
·生物信息学相关概述 | 第21-24页 |
·生物信息学概念 | 第21页 |
·生物信息学的产生 | 第21-22页 |
·生物信息学的主要步骤 | 第22页 |
·生物信息学的应用 | 第22-24页 |
2 东北虎脾脏组织cDNA文库的构建 | 第24-38页 |
·实验材料 | 第24-26页 |
·实验动物 | 第24页 |
·主要仪器设备 | 第24-25页 |
·主要试剂 | 第25页 |
·常用试剂配制 | 第25-26页 |
·实验方法 | 第26-32页 |
·Trizol试剂提取东北虎脾组织总RNA | 第26页 |
·cDNA第一链合成 | 第26-27页 |
·LD-PCR合成ds cDNA | 第27页 |
·蛋白酶K消化 | 第27-28页 |
·Sfil酶切 | 第28页 |
·CHROMA SPIN-400分选不同长度cDNA | 第28-29页 |
·cDNA连接载体 | 第29-30页 |
·噬菌体包装 | 第30页 |
·测定未扩增文库滴度以及重组率鉴定 | 第30-31页 |
·未扩增文库插入片段平均长度测定 | 第31页 |
·文库扩增 | 第31页 |
·扩增文库滴度测定 | 第31-32页 |
·实验结果 | 第32-36页 |
·东北虎脾脏总RNA提取 | 第32-33页 |
·双链cDNA合成 | 第33页 |
·cDNA分选 | 第33-34页 |
·连接反应比例确定 | 第34页 |
·cDNA文库质量鉴定 | 第34-36页 |
·讨论 | 第36-37页 |
·本章小结 | 第37-38页 |
3 EST序列生物信息学分析 | 第38-54页 |
·实验材料 | 第38页 |
·主要分析材料 | 第38页 |
·主要应用软件 | 第38页 |
·实验方法 | 第38-40页 |
·挑取克隆并测序 | 第38页 |
·测序结果初步处理 | 第38-39页 |
·EST序列的聚类拼接 | 第39页 |
·生物信息学分析 | 第39-40页 |
·实验结果 | 第40-53页 |
·EST序列测序结果统计 | 第40-41页 |
·EST长度分析总结 | 第41页 |
·注释基因总结 | 第41-42页 |
·PANTHER分类分析 | 第42-48页 |
·GOrilla分析 | 第48-49页 |
·PPINet分析 | 第49-51页 |
·KEGG分析 | 第51-53页 |
·讨论 | 第53页 |
·本章小结 | 第53-54页 |
结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
附录 | 第59-61页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第61-62页 |
致谢 | 第62-63页 |