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独行菜种子转录组及低温萌发表达谱分析

摘要第1-4页
Abstract第4-8页
1 绪论第8-15页
   ·低温对种子萌发的影响第8-9页
     ·低温对种子的萌发至关重要第8页
     ·植物应答低温胁迫的转录因子研究第8-9页
     ·植物应答低温胁迫与植物激素信号的交互作用第9页
   ·影响植物种子萌发的因素第9-13页
     ·种子萌发的重要性第9-10页
     ·影响植物种子萌发的环境因素第10页
     ·脱落酸对种子萌发的调控作用第10-11页
     ·赤霉素对种子萌发的调控作用第11-12页
     ·其他植物激素对种子萌发的调控作用第12页
     ·转录因子对种子萌发的调控作用第12-13页
   ·独行菜对低温适应性特征的研究第13页
   ·本研究的目的和意义第13-15页
2 独行菜种子转录组的测序及分析第15-31页
   ·材料与方法第15页
     ·材料第15页
   ·方法第15-18页
     ·25℃处理不同时间对独行菜种子低温萌发的影响第15-16页
     ·独行菜种子总RNA的提取第16-17页
     ·独行菜种子转录组的测序和组装第17-18页
     ·独行菜种子转录组Unigene功能注释及分析第18页
     ·独行菜种子转录组SSR位点分析第18页
     ·独行菜种子转录组SNP特征分析第18页
   ·结果与分析第18-29页
     ·25℃处理不同时间对独行菜种子打破低温萌发停滞的影响第18-19页
     ·独行菜种子总RNA质量的检测第19-20页
     ·独行菜种子转录组的测序和组装第20-21页
     ·Unigenes的功能注释第21-22页
     ·GO与KOG分类分析第22-24页
     ·KEGG注释分析第24-25页
     ·转录因子的注释及分类第25-26页
     ·独行菜种子转录组SSR位点分析第26-28页
     ·独行菜种子转录组SNP特征分析第28-29页
   ·小结第29-31页
3 独行菜种子低温萌发数字基因表达谱的构建和分析第31-39页
   ·材料与方法第31页
     ·材料第31页
   ·方法第31-32页
     ·独行菜种子低温萌发时期DGE测序第31页
     ·DEG测序数据的分析第31-32页
     ·差异表达基因GO与KEGG富集分析第32页
   ·结果与分析第32-37页
     ·DGE测序数据的分析第32页
     ·独行菜种子低温萌发期差异表达基因分析第32-33页
     ·差异表达基因GO与KEGG富集分析第33-35页
     ·ABA,GA合成代谢和信号转导基因的表达第35-37页
     ·差异上调表达转录因子的家族分类第37页
   ·小结第37-39页
4 LaAP2、LaDREB和LaBBX转录因子的分子克隆第39-55页
   ·材料与方法第40页
     ·试验材料第40页
     ·主要试剂第40页
   ·试验方法第40-44页
     ·全长cDNA基因的克隆第40-43页
     ·实时荧光定量PCR第43-44页
   ·结果与分析第44-53页
     ·LaAP2 cDNA全长的克隆及表达分析第44-48页
     ·LaDREB cDNA全长的克隆第48-51页
     ·LaBBX cDNA全长的克隆第51-53页
   ·小结第53-55页
5 结论第55-56页
参考文献第56-66页
在读期间发表的论文第66-67页
后记第67页

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