摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-9页 |
第1章 前言 | 第9-14页 |
第2章 研究对象与实验材料 | 第14-22页 |
·研究对象 | 第14-17页 |
·实验材料 | 第17-22页 |
·主要试剂 | 第17-18页 |
·主要实验设备和仪器 | 第18-20页 |
·主要生物医学应用软件 | 第20页 |
·主要生物信息学数据库 | 第20-22页 |
第3章 研究方法 | 第22-50页 |
·全血基因组DNA样本的提取及质量检测 | 第22-23页 |
·全血基因组DNA样本的提取 | 第22页 |
·DNA质量检测 | 第22-23页 |
·HSP相关致病基因全外显子测序 | 第23-38页 |
·文库构建 | 第24-31页 |
·文库杂交反应 | 第31-34页 |
·杂交后文库扩增 | 第34-36页 |
·Illumina Hiseq 2500高通量测序 | 第36页 |
·生物信息处理分析 | 第36-38页 |
·全外显子组测序 | 第38-47页 |
·Ion AmpliSeqTM外显子组文库制备 | 第38-41页 |
·模板阳性ISPs制备 | 第41-44页 |
·芯片处理及上机测序 | 第44-47页 |
·生物信息处理分析 | 第47页 |
·Sanger测序验证 | 第47-50页 |
·引物设计合成 | 第47页 |
·PCR扩增与PCR产物纯化 | 第47-49页 |
·DNA测序分析目标片段 | 第49-50页 |
第4章 结果 | 第50-65页 |
·原始数据概况 | 第50-58页 |
·HSP相关致病基因全外显子测序 | 第50-51页 |
·全外显子组测序 | 第51-58页 |
·Sanger测序 | 第58页 |
·突变分析 | 第58-65页 |
·HSP相关致病基因全外显子测序 | 第58-59页 |
·全外显子组测序 | 第59-65页 |
第5章 讨论 | 第65-72页 |
·HSP和HSP-TCC | 第65-67页 |
·一代测序和二代测序 | 第67-69页 |
·NBPF1和AHI1基因 | 第69-72页 |
第6章 结论 | 第72-73页 |
·结论 | 第72页 |
·进一步工作的方向 | 第72-73页 |
致谢 | 第73-74页 |
参考文献 | 第74-78页 |
附表 | 第78-92页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第92-93页 |
综述 | 第93-102页 |
参考文献 | 第99-102页 |