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基于二代测序技术的遗传性痉挛性截瘫一家系突变情况的研究

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-9页
第1章 前言第9-14页
第2章 研究对象与实验材料第14-22页
   ·研究对象第14-17页
   ·实验材料第17-22页
     ·主要试剂第17-18页
     ·主要实验设备和仪器第18-20页
     ·主要生物医学应用软件第20页
     ·主要生物信息学数据库第20-22页
第3章 研究方法第22-50页
   ·全血基因组DNA样本的提取及质量检测第22-23页
     ·全血基因组DNA样本的提取第22页
     ·DNA质量检测第22-23页
   ·HSP相关致病基因全外显子测序第23-38页
     ·文库构建第24-31页
     ·文库杂交反应第31-34页
     ·杂交后文库扩增第34-36页
     ·Illumina Hiseq 2500高通量测序第36页
     ·生物信息处理分析第36-38页
   ·全外显子组测序第38-47页
     ·Ion AmpliSeqTM外显子组文库制备第38-41页
     ·模板阳性ISPs制备第41-44页
     ·芯片处理及上机测序第44-47页
     ·生物信息处理分析第47页
   ·Sanger测序验证第47-50页
     ·引物设计合成第47页
     ·PCR扩增与PCR产物纯化第47-49页
     ·DNA测序分析目标片段第49-50页
第4章 结果第50-65页
   ·原始数据概况第50-58页
     ·HSP相关致病基因全外显子测序第50-51页
     ·全外显子组测序第51-58页
     ·Sanger测序第58页
   ·突变分析第58-65页
     ·HSP相关致病基因全外显子测序第58-59页
     ·全外显子组测序第59-65页
第5章 讨论第65-72页
   ·HSP和HSP-TCC第65-67页
   ·一代测序和二代测序第67-69页
   ·NBPF1和AHI1基因第69-72页
第6章 结论第72-73页
   ·结论第72页
   ·进一步工作的方向第72-73页
致谢第73-74页
参考文献第74-78页
附表第78-92页
攻读学位期间的研究成果第92-93页
综述第93-102页
 参考文献第99-102页

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