| 中文摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-12页 |
| 目录 | 第12-17页 |
| 符号说明 | 第17-19页 |
| 第一章 前言 | 第19-48页 |
| 第一节 植物多倍体研究进展 | 第19-24页 |
| ·多倍体研究起源 | 第19-20页 |
| ·植物多倍体的产生和分类 | 第20-22页 |
| ·植物多倍化后的生理形态变化 | 第22-24页 |
| 第二节 多倍化引起的基因组结构变化 | 第24-31页 |
| ·染色体重排与DNA片段排除 | 第24-27页 |
| ·多倍体转座子激活 | 第27-28页 |
| ·多倍体基因组间互动 | 第28-29页 |
| ·多倍体基因组大小变化 | 第29页 |
| ·多倍体基因表达变化 | 第29-31页 |
| 第三节 多倍化引起的表观遗传学变化 | 第31-36页 |
| ·植物基因组DNA甲基化 | 第32页 |
| ·植物DNA甲基化的建立和维持 | 第32-34页 |
| ·植物DNA甲基化与生长发育 | 第34-36页 |
| ·植物多倍化与DNA甲基化 | 第36页 |
| 第四节 植物多倍化与非编码RNA | 第36-40页 |
| ·植物中的siRNA和miRNA | 第37-38页 |
| ·miRNA与植物生长发育 | 第38-39页 |
| ·植物多倍化与小RNA | 第39-40页 |
| 第五节 多倍化与杂种优势 | 第40-41页 |
| ·杂种优势 | 第40页 |
| ·杂种优势的遗传模型 | 第40-41页 |
| ·多倍体优势与杂种优势 | 第41页 |
| 第六节 杨树研究的进展 | 第41-46页 |
| ·概述 | 第41-42页 |
| ·主要用途 | 第42页 |
| ·杨树育种 | 第42-43页 |
| ·杨树分子生物学研究 | 第43-46页 |
| 第七节 立题依据与研究内容 | 第46-48页 |
| ·立题依据及意义 | 第46-47页 |
| ·研究内容 | 第47-48页 |
| 第二章 黑杨三倍体叶片不同发育时期DNA甲基化动态分析 | 第48-69页 |
| 第一节 实验材料 | 第48页 |
| 第二节 实验原理与方法 | 第48-56页 |
| ·基因组DNA提取 | 第48-49页 |
| ·MSAP分析 | 第49-51页 |
| ·Southern杂交 | 第51-53页 |
| ·总RNA提取 | 第53-54页 |
| ·实时定量PCR | 第54-56页 |
| 第三节 结果分析 | 第56-66页 |
| ·黑杨三倍体与二倍体基因组结构分析 | 第56页 |
| ·黑杨三倍体不同发育时期MSAP分析 | 第56-58页 |
| ·黑杨三倍体叶片不同发育时期DNA甲基化水平分析 | 第58-60页 |
| ·黑杨三倍体叶片发育不同时期DNA甲基化模式变化分析 | 第60-63页 |
| ·黑杨三倍体DNA甲基化片段回收、测序 | 第63页 |
| ·黑杨三倍体叶片发育中甲基转移酶及去甲基化酶表达分析 | 第63-66页 |
| 第四节 讨论 | 第66-69页 |
| 第三章 黑杨三倍体叶片基因表达初步分析 | 第69-82页 |
| 第一节 实验材料 | 第69页 |
| 第二节 实验方法 | 第69-72页 |
| ·RNA提取 | 第69页 |
| ·芯片杂交与数据分析 | 第69-70页 |
| ·实时定量PCR | 第70-72页 |
| 第三节 结果与分析 | 第72-80页 |
| ·表达谱芯片结果概述 | 第72页 |
| ·黑杨叶片差异表达基因的染色体分布 | 第72-75页 |
| ·黑杨三倍体叶片差异表达基因GO分类 | 第75-77页 |
| ·黑杨三倍体生长素、油菜素内酯合成活跃 | 第77-78页 |
| ·差异基因定量PCR分析 | 第78-80页 |
| 第四节 讨论 | 第80-82页 |
| 第四章 黑杨三倍体不同组织基因表达分析 | 第82-106页 |
| 第一节 实验材料 | 第82页 |
| 第二节 实验方法 | 第82-85页 |
| ·RNA提取 | 第82页 |
| ·芯片杂交及数据分析 | 第82-85页 |
| 第三节 结果分析 | 第85-101页 |
| ·芯片分析概述 | 第85-86页 |
| ·黑杨三倍体及二倍体组织共表达基因分析 | 第86页 |
| ·黑杨三倍体不同组织差异表达基因 | 第86-89页 |
| ·黑杨三倍体不同组织差异表达基因GO分类分析 | 第89-99页 |
| ·黑杨三倍体各组织表达上调基因GO分类比较 | 第99-100页 |
| ·黑杨三倍体不同组织部分基因定量PCR分析 | 第100页 |
| ·黑杨三倍体基因表达与甲基化 | 第100-101页 |
| 第四节 讨论 | 第101-106页 |
| ·PCD过程对黑杨三倍体速生性状形成的影响 | 第102-103页 |
| ·转录因子差异表达与黑杨三倍体生长发育 | 第103-106页 |
| 第五章 黑杨三倍体差异表达基因克隆与转基因功能验证 | 第106-125页 |
| 第一节 实验材料 | 第106页 |
| 第二节 实验方法 | 第106-111页 |
| ·基因克隆及载体构建 | 第106-107页 |
| ·重组质粒转化感受态细胞 | 第107-109页 |
| ·拟南芥转基因及筛选 | 第109-110页 |
| ·转基因拟南芥DNA、RNA提取及定量验证 | 第110-111页 |
| 第三节 结果与分析 | 第111-123页 |
| ·黑杨三倍体部分差异表达基因克隆 | 第111-118页 |
| ·转基因载体构建与转基因 | 第118-121页 |
| ·转基因植株表型鉴定 | 第121-123页 |
| 第四节 讨论 | 第123-125页 |
| 第六章 黑杨sRNA测序及miRNA表达分析 | 第125-146页 |
| 第一节 实验材料 | 第125页 |
| 第二节 实验方法 | 第125-130页 |
| ·杨树sRNA测序分析 | 第125-126页 |
| ·miRNA定量分析 | 第126-128页 |
| ·靶基因预测及定量分析 | 第128-129页 |
| ·新预测miRNA前体克隆及定量分析 | 第129-130页 |
| 第三节 结果与分析 | 第130-143页 |
| ·黑杨sRNA的Solexa测序分析 | 第130-134页 |
| ·黑杨新miRNA预测 | 第134-137页 |
| ·黑杨叶片和茎发育过程中miRNA表达趋势分析 | 第137-140页 |
| ·miRNA靶基因预测与表达分析 | 第140-143页 |
| 第四节 讨论 | 第143-146页 |
| 第七章 结论与展望 | 第146-149页 |
| ·结论 | 第146-148页 |
| ·展望 | 第148-149页 |
| 参考文献 | 第149-166页 |
| 致谢 | 第166-167页 |
| 个人简历 | 第167-168页 |
