中文摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
缩略语表 | 第8-10页 |
第一部分 APOBEC3G/F-Vif相互作用的模型构建 | 第10-52页 |
前言 | 第10-17页 |
实验材料 | 第17-21页 |
·服务器 | 第17页 |
·软件 | 第17页 |
·细胞系 | 第17页 |
·试剂 | 第17-21页 |
实验方法 | 第21-28页 |
·A3G同源建模 | 第21-22页 |
·A3F_CTD同源建模 | 第22-23页 |
·Vif比较建模 | 第23-25页 |
·A3G-Vif限制性蛋白对接 | 第25页 |
·A3G-A3G相互作用模型的构建 | 第25-26页 |
·A3F CTD-Vif限制性蛋白对接 | 第26页 |
·生物发光共振能量转移(BRET)检测蛋白相互作用 | 第26页 |
·蛋白免疫印迹(Western Blot) | 第26-27页 |
·免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,Co-IP) | 第27-28页 |
实验结果和讨论 | 第28-51页 |
·A3G同源建模 | 第28-30页 |
·A3F_CTD同源建模 | 第30-32页 |
·Vif比较建模 | 第32-35页 |
·A3G-Vif限制性对接 | 第35-38页 |
·A3G二聚体模型的构建 | 第38-40页 |
·A3F_CTD-Vif限制性对接 | 第40-42页 |
·Vif结合A3G抑制A3G二聚体的形成 | 第42-44页 |
·A3G的结构域Tyrl24~Trpl27既参与到A3G-A3G的相互作用也参与到A3G-Vif的相互作用 | 第44-49页 |
·预测影响A3F-Vif相互作用的残基验证 | 第49-51页 |
实验结论 | 第51-52页 |
第二部分 基于A3G模型新型抗HIV-1药物的虚拟筛选 | 第52-64页 |
前言 | 第52-54页 |
实验材料 | 第54-56页 |
·服务器 | 第54页 |
·软件 | 第54页 |
·细胞系 | 第54页 |
·试剂 | 第54-56页 |
实验方法 | 第56-58页 |
·A3G与化合物IMB-26/IMB-35分子对接 | 第56页 |
·A3G-Vif相互作用抑制剂的虚拟筛选 | 第56-57页 |
·蛋白免疫印迹(Western Blot) | 第57页 |
·免疫共沉淀(Co-IP) | 第57-58页 |
实验结果与讨论 | 第58-63页 |
·A3G与活性化合物IMB-26和IMB-35分子对接 | 第58-60页 |
·针对A3G-Vif相互作用抑制剂的虚拟筛选 | 第60-61页 |
·4个小分子化合物抑制A3G-Vif的相互作用 | 第61-63页 |
实验结论 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-72页 |
已发表文章 | 第72-73页 |
致谢 | 第73页 |