| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-21页 |
| ·生物发光及其研究背景 | 第13-15页 |
| ·生物发光介绍 | 第13-14页 |
| ·研究背景介绍 | 第14-15页 |
| ·生物发光的化学研究概况 | 第15-17页 |
| ·生物发光的化学研究起源 | 第15-16页 |
| ·近 100 年间生物发光的化学研究进展 | 第16-17页 |
| ·未来生物发光中的化学研究方向与应用 | 第17-18页 |
| ·论文课题研究目的及内容 | 第18-21页 |
| 第二章 理论基础与计算方法 | 第21-39页 |
| ·薛定谔方程及三个基本近似 | 第22-27页 |
| ·闭壳层分子的 HFR 方程 | 第24-26页 |
| ·开壳层分子的 HFR 方程 | 第26-27页 |
| ·密度泛函理论 | 第27-29页 |
| ·组态相互作用 | 第29-30页 |
| ·量子力学和分子力学结合方法 | 第30-33页 |
| ·能量表达式 | 第30-31页 |
| ·减法方案 | 第31-32页 |
| ·加法方案 | 第32-33页 |
| ·针对 QM/MM 的优化方法 | 第33-35页 |
| ·溶剂效应 | 第35-39页 |
| 第三章 氧化腔肠素发光机理的动力学模拟与量化计算研究 | 第39-51页 |
| ·引言 | 第39-41页 |
| ·计算方法 | 第41-42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-48页 |
| ·吸收光谱 | 第42-43页 |
| ·发射光谱 | 第43-47页 |
| ·发光体特性 | 第47-48页 |
| ·本章小结 | 第48-51页 |
| 第四章 水母发光蛋白微环境：氨基酸与显性水分子对氧化腔肠素光谱性质的影响作用 | 第51-61页 |
| ·引言 | 第51-53页 |
| ·计算方法 | 第53-54页 |
| ·结果与讨论 | 第54-59页 |
| ·吸收光谱与氢键分析 | 第54-56页 |
| ·荧光光谱 | 第56-57页 |
| ·电荷分布与 NBO 分析 | 第57-59页 |
| ·本章小结 | 第59-61页 |
| 第五章 萤火虫氧化荧光素类似物电子光谱和发光效率的理论研究 | 第61-73页 |
| ·引言 | 第61-63页 |
| ·计算方法 | 第63页 |
| ·结果与讨论 | 第63-70页 |
| ·分子基态与激发态几何优化 | 第63-64页 |
| ·电子吸收光谱 | 第64-66页 |
| ·轨道分析 | 第66-68页 |
| ·发射光谱 | 第68-70页 |
| ·本章小结 | 第70-73页 |
| 第六章 氨基荧光素，氧化荧光素荧光性质的 TD DFT 研究 | 第73-89页 |
| ·引言 | 第73-74页 |
| ·计算方法 | 第74-75页 |
| ·结果与讨论 | 第75-86页 |
| ·萤火虫荧光素氨基类似物性质 | 第75-77页 |
| ·氨基氧化荧光素类似物性质 | 第77-86页 |
| ·本章小结 | 第86-89页 |
| 参考文献 | 第89-115页 |
| 作者简介 | 第115-117页 |
| 攻读博士学位期间发表和完成的论文 | 第117-119页 |
| 致谢 | 第119页 |
