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油菜多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(Bnpgip2-1)克隆、生物信息学分析与表达

摘要第1-8页
Abstract第8-9页
引言第9-24页
 一、油菜菌核病第9-15页
  (一) 病害症状与危害第9-10页
   1、症状第9-10页
   2、发生与危害第10页
  (二) 病菌及其致病机理第10-13页
   1、病菌第10-11页
   2、致病机理第11-13页
  (三) 油菜抗病及其机制第13-15页
   1、避病第13页
   2、形态结构抗性第13页
   3、酶活性变化第13-14页
   4、对草酸耐性第14页
   5、抗病组织病理学及生理生化第14-15页
  (四) 病害防治第15页
 二、植物抗病分子机制第15-19页
  (一) 植物抗病类型第16页
   1 与病原物亲和性互作抗病性第16页
   2 与病原物非亲和性互作抗病性第16页
  (二) 植物抗病基因第16-18页
  (三) 植物防卫基因第18-19页
  (四) 植物抗病信号传导第19页
 三、植物多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)基因及抗病功能第19-23页
  (一) pgip基因及其表达第20页
  (二) PGIP理化特性及其结构第20-21页
  (三) PGIP含量与分布第21页
  (四) PGIP抗病功能及其机制第21-22页
  (五) PGIP在植物抗病基因工程中的应用第22-23页
 四、油菜PGIP及其基因研究第23页
 五、本研究目的与意义第23-24页
材料与方法第24-41页
 一、供试植株第24页
 二、供试菌株第24页
  (一) 油菜菌核病菌第24页
  (二) 大肠杆菌第24页
 三、质粒载体第24页
 四、试剂和仪器第24-26页
  (一) 主要试剂第24-25页
  (二) 培养基第25页
   1、Luria-Bertani培养基(LB)第25页
   2、改良的Marcus培养基第25页
  (三) 主要仪器第25-26页
 五、常用溶液第26-28页
  (一) 提取基因组DNA所需溶液第26页
  (二) 核酸电泳缓冲液第26页
  (三) 提取质粒DNA的碱裂解缓冲液第26-27页
  (四) 制备大肠杆菌感受态细胞溶液第27页
  (五) 抗生素第27页
  (六) 诱导蛋白表达溶液第27页
  (七) 蛋白样品制备缓冲液第27页
  (八) SDS-PAGE所需溶液第27-28页
 六、油菜基因组DNA提取第28页
  (一) DNA提取(CTAB法)第28页
  (二) DNA浓度与纯度的测定第28页
 七、油菜Bnpgip2-1基因克隆第28-31页
  (一) 引物设计第28-29页
  (二) PCR扩增第29页
  (三) PCR产物回收第29页
  (四) 重组质粒构建第29-30页
  (五) 感受态细胞制备与转化第30页
   1、感受态细胞制备第30页
   2、转化第30页
  (六) 重组质粒的提取与PCR验证第30-31页
   1、重组质粒提取(碱裂解法)第30-31页
   2、PCR验证第31页
  (七) 测序第31页
 八、油菜Bnpgip2-1基因的生物信息学分析第31-32页
  (一) 序列相似性比对第31页
  (二) ORF查找第31页
  (三) 蛋白质结构预测第31-32页
  (四) 蛋白质性质与功能分析第32页
 九、油菜Bnpgip2-1基因的原核表达第32-36页
  (一) 表达载体的构建第32-33页
   1 引物设计第32页
   2、PCR扩增第32-33页
   3、双酶切第33页
   4、连接第33页
  (二) 重组质粒转化第33-34页
  (三) PCR验证第34页
  (四) 表达产物SDS-PAGE检测第34-36页
   1、诱导条件筛选第34页
   2、细胞全蛋白样品的制备第34-35页
   3、SDS-PAGE分析第35-36页
 十、BnPGIP2-1对油菜菌核病菌PG抑制的测定第36-38页
  (一) BnPGIP2-1粗蛋白的提取第36-37页
   1、可溶性蛋白第36页
   2、包涵体型蛋白第36-37页
  (二) 病菌PG酶的提取第37页
  (三) BnPGIP2-1蛋白对病菌PG酶抑制的测定第37-38页
 十一、油菜Bnpgip2-1基因的诱导表达第38-41页
  (一) 病菌接种第38-39页
  (二) SA、JA处理第39页
  (三) 总RNA提取第39页
  (四) RT-PCR第39-41页
结果与分析第41-52页
 一、油菜Bnpgip2-1基因的克隆与生物信息学分析第41-48页
  (一) 油菜基因组DNA提取第41-42页
   1、基因组DNA提取第41-42页
   2、DNA浓度及纯度测定第42页
  (二) Bnpgip2-1基因克隆第42-43页
  (三) Bnpgip2-1生物信息学分析第43-48页
   1、ORF与序列相似性第43-44页
   2、蛋白质一级结构第44-45页
   3、蛋白质二级结构第45页
   4、蛋白质性质与功能第45-48页
 二、油菜Bnpgp2-1基因的原核表达第48-50页
  (一) 表达载体的构建第48-50页
  (二) 重组质粒转化第50页
  (三) PCR验证第50页
  (四) Bnpgip2-1基因的原核表达第50页
 三、BnPGIP2-1对油菜菌核病菌PG抑制测定第50-51页
 四、油菜Bnpgip2-1基因的诱导表达第51-52页
讨论第52-56页
 一、油菜Bnpgip2-1基因及其产物的特征第52页
 二、油菜Bnpgip2-1基因的表达第52-53页
 三、油菜Bnpgip2-1基因的功能第53-54页
 四、Bnpgip2-1基因在油菜抗病育种中的利用第54-56页
参考文献第56-64页
附录一第64-65页
附录二 表达载体pET-28a((+)质粒图谱第65-66页
致谢第66-67页

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