| 提要 | 第1-8页 |
| 第1章 可溶性鸟苷酸环化酶的结构和生物学功能 | 第8-24页 |
| ·NO-CGMP 信号转导系统（THE NO/CGMP SIGNALING PATHWAY） | 第8-9页 |
| ·SGC 的亚型与结构特征 | 第9-11页 |
| ·SGC 的激活因子 | 第11-13页 |
| ·一氧化氮 | 第11-12页 |
| ·一氧化碳 | 第12-13页 |
| ·SGC 的光谱学结构分析 | 第13-15页 |
| ·sGC 的UV-visible 光谱 | 第14-15页 |
| ·sGC 的共振拉曼光谱 | 第15页 |
| ·本文的立题依据及工作重点 | 第15-16页 |
| 参考文献 | 第16-24页 |
| 第2章 SGC 的血红素结合域同源模型的构建 | 第24-33页 |
| ·SGC 同源类似蛋白的结构与功能分析 | 第25-27页 |
| ·氧结合的Tt H-NOX | 第25-26页 |
| ·高同源性的Ns H-NOX | 第26-27页 |
| ·SGC 血红素结合域的同源模建 | 第27-30页 |
| ·sGC 血红素结构域同源模型的构建与评估 | 第27-29页 |
| ·分子动力学对sGC 血红素结构域模型的平衡 | 第29-30页 |
| 参考文献 | 第30-33页 |
| 第3章 H-NOX 结构域气体迁移通路的分子动力学研究 | 第33-53页 |
| ·分子动力学模拟气体迁移通路方法 | 第36-40页 |
| ·Conjugate Peak Refinement Algorithm （CPR） | 第36-38页 |
| ·Implicit Ligand Sampling（ILS） | 第38-40页 |
| ·Locally Enhanced Sampling Molecular Dynamics（LES MD） | 第40页 |
| ·LES MD 方法比较TT H-NOX 和NS H-NOX 气体迁移通路 | 第40页 |
| ·LES MD 方法 | 第40-41页 |
| ·LSE MD 体系准备 | 第41页 |
| ·LSE MD 的参数设置 | 第41-42页 |
| ·LES MD 的结果 | 第42-50页 |
| ·Tt H-NOX 和 Ns H-NOX 的结构比对 | 第42-44页 |
| ·Ns H-NOX 气体迁移通路模拟结果 | 第44-45页 |
| ·Tt H-NOX 气体迁移通路模拟结果 | 第45-46页 |
| ·Ns H-NOX 和 Tt H-NOX 对气体分子的区分机制讨论 | 第46-47页 |
| ·Ns H-NOX 和 Tt H-NOX 突变体的 LES MD 模拟 | 第47-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 第4章 配基分子与血红素模型配位作用的DFT 研究 | 第53-75页 |
| ·密度泛函理论(4)（DENSITY FUNCTIONAL THEORY，DFT) | 第53-55页 |
| ·分子轨道理论(5)（MOLECULAR ORBITAL THEORY） | 第55-58页 |
| ·晶体场理论(6) （CRYSTAL FIELD THEORY） | 第58-62页 |
| ·能级分裂 | 第59-60页 |
| ·高自旋和低自旋 | 第60-62页 |
| ·配位场理论(7)（LIGAND FIELD THEORY） | 第62-65页 |
| ·σ配位键 | 第62-63页 |
| ·π配位键 | 第63-65页 |
| ·D轨道电子计数法（D ELECTRON COUNT） | 第65-66页 |
| ·FEP (IM)-配基模型的DFT 研究 | 第66-74页 |
| ·DFT 的优化结果 | 第66-68页 |
| ·Fe(P)(Im)-配基最高占据成键轨道分析 | 第68-72页 |
| ·Fe(P)(Im)-配基的Raman 光谱计算 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-75页 |
| 第5章 结论 | 第75-77页 |
| 附录1 | 第77-96页 |
| 附录2 | 第96-106页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文及取得的科研成果 | 第106-108页 |
| 中文摘要 | 第108-111页 |
| ABSTRACT | 第111-114页 |
| 致谢 | 第114页 |
