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日本三角涡虫转录组、再生表达谱及小RNA谱的鉴定与分析

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
目录第8-11页
1 前言与介绍第11-21页
   ·再生第11页
   ·涡虫的再生第11-17页
   ·高通量测序第17-18页
   ·转录组测序第18-19页
   ·基因数字表达谱测序第19-20页
   ·small RNA测序第20-21页
2 高通量测序分析日本三角涡虫转录组第21-42页
     ·实验材料第21-22页
     ·实验动物第21页
     ·主要试剂第21页
     ·主要仪器第21-22页
     ·提RNA耗材的准备与处理第22页
     ·分析软件第22页
   ·实验方法与实验结果第22-31页
     ·三角涡虫不同发育阶段Total RNA的提取和鉴定第22-24页
     ·RNA-seq测序流程第24-25页
     ·生物信息学分析第25-31页
     ·两种涡虫的关系第31页
   ·结论与讨论第31-33页
     ·高通量转录组测序第31页
     ·功能性分析第31-33页
   ·附件第33-42页
3 高通量测序分析日本三角涡虫再生差异表达谱第42-77页
   ·实验材料第42页
     ·实验动物第42页
     ·主要试剂第42页
     ·主要仪器第42页
     ·提RNA耗材的准备与处理第42页
     ·分析软件第42页
   ·方法与结果第42-65页
     ·三角涡虫不同再生阶段Total RNA的提取和鉴定第42-44页
     ·测序实验流程第44-46页
     ·生物信息学分析第46-65页
   ·结论与讨论第65-68页
     ·DGE系统测序第65页
     ·DGEs的对比情况第65-66页
     ·DGE的差异性表达分析第66页
     ·差异性表达基因的功能性注释第66-67页
     ·涡虫再生相关基因第67-68页
   ·附件第68-77页
4 高通量测序分析日本三角涡虫小RNA再生差异表达谱第77-98页
   ·实验材料第77页
     ·实验动物第77页
     ·主要试剂第77页
     ·主要仪器第77页
     ·提RNA耗材的准备与处理第77页
     ·分析软件第77页
   ·实验方法与实验结果第77-96页
     ·三角涡虫不同发育阶段Total RNA的提取和鉴定第77-79页
     ·小RNA的高通量测序第79-80页
     ·生物信息学分析第80-96页
   ·结论与讨论第96-98页
     ·两个核苷酸的峰主要是miRNA和piRNA第96页
     ·日本三角涡虫sRNA的多样性第96页
     ·涡虫sRNA可能的功能第96-97页
     ·两类重要的miRNAs第97-98页
参考文献第98-105页
硕士期间发表文章第105-106页
个人简历第106-107页
致谢第107-108页

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