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柑桔衰退病毒p25、p27和p20基因的克隆及生物信息学分析

摘要第1-8页
Abstract第8-16页
第一章 绪论第16-27页
   ·CTV 概述第16-21页
     ·CTV 分布及为害第16页
     ·CTV 分类地位第16页
     ·CTV 的理化特性第16-17页
     ·CTV 基因组第17-18页
     ·CTV 的进化第18-19页
     ·CTV 的寄主范围及寄主症状第19-20页
     ·CTV 的传播第20-21页
   ·CTV 的检测和防治第21-27页
     ·CTV 的检测第21-22页
     ·CTV 的防治第22-27页
第二章 CTV P25 基因的克隆及生物信息学分析第27-41页
   ·实验材料第27-29页
     ·仪器设备第27页
     ·病毒材料第27页
     ·载体第27页
     ·受体菌第27-28页
     ·试剂第28页
     ·试剂配制第28-29页
   ·实验方法第29-34页
     ·CTV 总核酸的提取第29页
     ·cDNA 模板的合成及p25 基因的扩增第29-30页
     ·RT-PCR 产物电泳第30页
     ·PCR 产物的回收第30页
     ·重组载体的构建第30-31页
     ·菌落PCR 鉴定阳性克隆第31-32页
     ·质粒DNA 提取第32页
     ·重组质粒的酶切鉴定第32-33页
     ·重组质粒的测序第33页
     ·p25 的序列分析及系统进化树构建第33页
     ·p25 等电点预测第33页
     ·p25 二级结构预测第33页
     ·p25 跨膜区分析第33-34页
   ·结果与分析第34-41页
     ·p25 基因的RT-PCR 的扩增第34页
     ·菌落PCR 鉴定阳性克隆第34-35页
     ·重组质粒酶切第35页
     ·重组质粒的测序第35页
     ·p25 核酸、氨基酸组成及序列分析第35-37页
     ·p25 进化树构建与分析第37-38页
     ·等电点预测第38页
     ·p25 二级结构预测结果第38-40页
     ·p25 跨膜区分析第40-41页
第三章 CTV P27 基因的克隆及生物信息学分析第41-52页
   ·实验材料第41-42页
     ·仪器设备第41页
     ·病毒材料第41页
     ·载体第41页
     ·受体菌第41页
     ·试剂第41页
     ·试剂配制第41-42页
   ·实验方法第42-45页
     ·CTV 总核酸的提取第42页
     ·cDNA 模板的合成及p27 的扩增第42-43页
     ·RT-PCR 产物电泳第43页
     ·PCR 产物的回收第43页
     ·重组载体的构建第43页
     ·菌落PCR 鉴定阳性克隆第43-44页
     ·质粒DNA 提取第44页
     ·重组质粒的酶切鉴定第44页
     ·重组质粒的测序第44页
     ·p27 的序列分析及系统进化树构建第44-45页
     ·p27 等电点预测第45页
     ·p27 二级结构预测第45页
     ·p27 跨膜区分析第45页
   ·结果与分析第45-52页
     ·p27 的RT-PCR 扩增第45-46页
     ·菌落PCR 鉴定阳性克隆第46页
     ·重组质粒酶切第46-47页
     ·重组质粒的测序第47页
     ·p27 核酸和氨基酸序列分析第47-48页
     ·p27 系统进化树构建及分析第48-49页
     ·等电点预测第49-50页
     ·p27 二级结构预测第50-51页
     ·p27 跨膜区分析第51-52页
第四章 CTV P20 基因的克隆及生物信息学分析第52-63页
   ·实验材料第52-53页
     ·仪器设备第52页
     ·病毒材料第52页
     ·载体第52页
     ·受体菌第52页
     ·试剂第52页
     ·试剂配制第52-53页
   ·实验方法第53-56页
     ·CTV 总核酸的提取第53页
     ·cDNA 模板的合成及p20 基因的扩增第53-54页
     ·RT-PCR 产物电泳第54页
     ·PCR 产物的回收第54页
     ·重组载体的构建第54页
     ·菌落PCR 鉴定阳性克隆第54-55页
     ·质粒DNA 提取第55页
     ·重组质粒的酶切鉴定第55页
     ·重组质粒的测序第55页
     ·p20 的序列分析及系统进化树构建第55-56页
     ·p20 等电点预测第56页
     ·p20 二级结构预测第56页
     ·p20 跨膜区分析第56页
   ·结果与分析第56-63页
     ·p20 的RT-PCR 扩增第56-57页
     ·菌落PCR 鉴定阳性克隆第57页
     ·重组质粒酶切第57-58页
     ·重组质粒的测序第58页
     ·p20 核酸、氨基酸组成及序列分析第58-59页
     ·p20 进化树构建与分析第59-60页
     ·等电点预测第60-61页
     ·p20 二级结构预测结果第61页
     ·p20 跨膜区分析第61-63页
第五章 结论与讨论第63-70页
   ·结论第63-65页
     ·p25、p27 和p20 基因的克隆第63页
     ·核酸序列碱基组成分析第63页
     ·序列相似性分析第63-64页
     ·氨基酸组成和等电点预测第64页
     ·p25、p27 和p20 的核苷酸序列及其氨基酸序列进化树构建第64页
     ·p25、p27 和p20 的二级结构预测第64页
     ·p25、p27 和p20 蛋白跨膜区分析第64-65页
   ·讨论第65-70页
参考文献第70-76页
致谢第76-77页
作者简历第77-78页
附录第78-92页

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