| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-12页 |
| 1 绪论 | 第12-24页 |
| ·肽的定量构效关系研究进展 | 第12-16页 |
| ·定量构效关系研究概述 | 第12-14页 |
| ·肽的定量构效关系研究概述 | 第14-16页 |
| ·肽的定量构效关系研究面临的挑战 | 第16页 |
| ·蛋白质的结构与功能预测研究进展 | 第16-19页 |
| ·蛋白质的二级结构预测研究概述 | 第17-19页 |
| ·蛋白质的二级结构预测面临的挑战 | 第19页 |
| ·启动子的结构与功能预测研究进展 | 第19-22页 |
| ·启动子的预测研究概述 | 第20-21页 |
| ·启动子的预测面临的挑战 | 第21-22页 |
| ·本文的研究思路与主要内容 | 第22-24页 |
| 2 生物序列表征体系的构建 | 第24-32页 |
| ·广义氨基酸信息因子分析标度 | 第24-29页 |
| ·氨基酸的性质参数选择 | 第24-25页 |
| ·因子分析 | 第25-29页 |
| ·广义碱基性质得分 | 第29-32页 |
| ·碱基的性质参数选择 | 第29-30页 |
| ·主成分分析 | 第30-32页 |
| 3 定量构效关系与模式识别建模方法及分析技术 | 第32-46页 |
| ·多元线性回归 | 第32-33页 |
| ·主成分分析与因子分析 | 第33-35页 |
| ·主成分分析 | 第33-34页 |
| ·因子分析 | 第34-35页 |
| ·偏最小二乘回归 | 第35-36页 |
| ·支持向量机 | 第36-39页 |
| ·支持向量分类机 | 第37-38页 |
| ·支持向量回归机 | 第38-39页 |
| ·支持向量机的参数选择 | 第39页 |
| ·人工神经网络 | 第39-40页 |
| ·遗传算法 | 第40-41页 |
| ·聚类分析与线性判别分析 | 第41-42页 |
| ·方差分析 | 第42-43页 |
| ·模型的评价与验证 | 第43-45页 |
| ·软件实现 | 第45-46页 |
| 4 广义氨基酸信息因子分析标度用于肽的定量构效关系研究 | 第46-80页 |
| ·苦味二肽的定量构效关系研究 | 第46-50页 |
| ·血管紧张素转化酶抑制剂的定量构效关系研究 | 第50-53页 |
| ·阳离子抗菌肽的定量构效关系研究 | 第53-61页 |
| ·人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析 | 第61-67页 |
| ·HLA-A~*0201 限制性T 细胞表位的定量构效关系研究 | 第67-73页 |
| ·人类1 型双载蛋白SH3 结构域亲和肽的定量构效关系研究. | 第73-79页 |
| ·小结 | 第79-80页 |
| 5 广义氨基酸信息因子分析标度用于蛋白质结构与功能关系研究 | 第80-102页 |
| ·碱性螺旋-环-螺旋蛋白分类 | 第80-86页 |
| ·蛋白质的β-转角结构预测 | 第86-90页 |
| ·G 蛋白偶联受体家族分类 | 第90-94页 |
| ·高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别 | 第94-101页 |
| ·小结 | 第101-102页 |
| 6 广义碱基性质得分用于启动子的结构与功能关系研究 | 第102-112页 |
| ·大肠杆菌启动子的结构与启动强度关系研究 | 第102-109页 |
| ·人类基因启动子预测 | 第109-111页 |
| ·小结 | 第111-112页 |
| 7 结论与展望 | 第112-116页 |
| ·结论 | 第112-115页 |
| ·展望 | 第115-116页 |
| 致谢 | 第116-118页 |
| 参考文献 | 第118-134页 |
| 附录 | 第134-147页 |
| A. 作者在攻读博士学位期间发表的论文及参与的相关科研工作 | 第134-136页 |
| B. 天然氨基酸的 335 种性质参数的因子分析载荷与变量共同度 | 第136-142页 |
| C. 5 种碱基的 41 种性质参数的主成分分析载荷 | 第142-143页 |
| D. 高致病性禽流感病毒血凝素蛋白识别所用数据集 | 第143-147页 |
| E. 中英文缩写一览表 | 第147页 |
