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人BMPR2基因5侧翼序列的结构与功能研究

中文摘要第1-6页
Abstract第6-9页
目录第9-13页
第一部分 研究背景第13-27页
   ·人BMPR2基因及编码蛋白分子生物学第13-14页
   ·BMPR-Ⅱ所在的信号转导通路第14-16页
   ·BMPR2基因突变与肺动脉高压(Pulmonary arterial hypertension,PAH)第16-21页
   ·BMPR2基因的表达与肿瘤第21-23页
   ·BMPs及BMPRs与骨的形成与再生第23页
   ·BMPR-Ⅱ与胚胎发育和器官形成第23-25页
   ·BMPR2基因表达调控的研究现状及本课题的意义第25-27页
第二部分 人BMPR2基因转录起始位点的确定及5′前导序列的生物信息学分析第27-57页
   ·材料第27-29页
     ·主要仪器和设备第27页
     ·质粒、菌株、细胞株第27页
     ·主要试剂第27-28页
     ·培养基及溶液配方第28-29页
   ·方法第29-37页
     ·A549细胞的培养及收集第29页
     ·总RNA的提取第29-30页
     ·RNA完整性的鉴定第30页
     ·RNA的纯度及含量测定第30页
     ·人BMPR2基因转录起始位点的预测第30-32页
     ·RT-PCR对人BMPR2基因mRNA 5′端的步移第32-34页
     ·5′ RACE精确定位人BMPR2基因的转录起始位点第34-36页
     ·RT-PCR验证RACE结果第36-37页
     ·人BMPR2基因5′-前导序列的生物信息学分析第37页
   ·结果第37-49页
     ·RNA的鉴定第37页
     ·人BMPR2基因转录起始位点预测第37-38页
     ·RT-PCR对人BMPR2基因cDNA5′端的步移第38-39页
     ·5′ RACE对人BMPR2基因转录起始位点的精确定位第39-42页
     ·RT-PCR验证RACE结果第42-44页
     ·5′前导序列的生物信息学分析第44-49页
   ·讨论第49-56页
     ·确定转录起始位点方法的选择第49-50页
     ·关于转录起始位点的预测第50-51页
     ·关于5′ RACE第51-53页
     ·人BMPR2基因5′前导序列的结构第53-56页
   ·本部分小结第56-57页
第三部分 人BMPR2基因5′侧翼序列的转录调控功能第57-91页
   ·材料第58-60页
     ·菌种、载体和细胞系第58-59页
     ·主要试剂第59页
     ·主要仪器第59-60页
   ·方法第60-74页
     ·人BMPR2基因5′侧翼大片段的克隆第60-67页
     ·人BMPR2基因5′侧翼缺失体片段报告载体的构建第67-70页
     ·细胞培养、转染及瞬时表达第70-71页
     ·双萤光素酶试验第71-72页
     ·人BMPR2基因5′侧翼重复序列簇集区及启动序列嵌合体报告质粒的构建第72-74页
     ·人BMPR2基因5′侧翼重复序列簇集区与启动序列嵌合体报告质粒的萤光素酶实验第74页
   ·结果第74-83页
     ·人BMPR2基因5′侧翼大片段的克隆第74-76页
     ·缺失体报告载体的构建第76-77页
     ·各缺失体片段驱动的萤光素酶活性第77-80页
     ·人BMPR2基因5′侧翼重复序列簇集区及启动序列嵌合体报告质粒的构建第80-82页
     ·嵌合体报告质粒的萤光素酶活性第82-83页
   ·讨论第83-90页
   ·本部分小结第90-91页
第四部分 人BMPR2基因近转录起始位点GC丰富区对SP1的反应第91-117页
   ·材料第91-92页
   ·方法第92-101页
     ·SP1真核表达载体pcDNA3.1(+)-SP1的构建第92-95页
     ·SP1对报告质粒pRL-TK及pGL3-Basic-S5(含人BMPR2启动子)的转录激活作用第95-97页
     ·潜在转录因子SP1结合位点突变体报告质粒的构建第97-99页
     ·突变体报告质粒的转染及萤光素酶实验第99页
     ·电泳迁移率变动分析(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)第99-101页
   ·结果第101-107页
     ·SP1真核表达载体的构建第101-103页
     ·SP1对启动子的激活作用第103-104页
     ·突变体报告质粒构建第104-106页
     ·突变对人BMPR2基因启动子活性的影响第106页
     ·电泳迁移率变动分析第106-107页
   ·讨论第107-116页
   ·本部分小结第116-117页
第五部分 人BMPR2基因5′前导序列中GGC三核苷酸重复的多态性检测及功能研究第117-148页
   ·材料第117-119页
     ·菌种、载体和细胞系第117页
     ·主要试剂第117-118页
     ·主要工作液配制第118-119页
     ·主要仪器第119页
   ·方法第119-135页
     ·GGC三核苷酸重复序列多态性检测第119-124页
     ·GGC三核苷酸重复序列突变报告质粒的构建及萤光素酶实验第124-126页
     ·GGC所在CpG岛甲基化状况的检测第126-130页
     ·荧光定量PCR检测BMPR2基因mRNA表达水平第130-135页
   ·结果第135-143页
     ·GGC三核苷酸重复序列的多态性第135-136页
     ·GGC三核苷酸重复序列突变报告质粒的构建及萤光素酶实验第136-138页
     ·BMPR2基因GGC重复所在CpG岛甲基化检测结果第138-140页
     ·荧光定量PCR检测BMPR2基因mRNA表达水平第140-143页
   ·讨论第143-147页
     ·关于GGC三核苷酸重复的多态性第143-144页
     ·GGC12野生型和突变体报告质粒的萤光素酶活性第144-145页
     ·关于BMPR2基因GGC重复区所在CpG岛甲基化状态与基因表达水平之间的关系第145-147页
   ·本部分小结第147-148页
全文总结及展望第148-150页
参考文献第150-169页
在学期间发表论文及参与课题第169-170页
致谢第170页

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