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缺水胁迫下玉米基因表达谱分析

中文摘要第1-3页
英文摘要第3-7页
第一章 前言第7-13页
   ·影响玉米产量的生物和非生物因素第7页
   ·提高和改良玉米抗逆能力的措施和方法第7-8页
   ·表达序列标签(EST)第8-9页
   ·cDNA微阵列第9-11页
   ·植物在缺水胁迫下的分子应答第11-12页
   ·本研究的目的第12-13页
第二章 材料与方法第13-28页
   ·材料第13-15页
     ·玉米品种第13页
     ·菌株与质粒第13页
     ·抗生素配制及其使用浓度第13页
     ·培养基和主要试剂第13-15页
   ·方法第15-28页
     ·玉米的生长和胁迫处理第15-16页
     ·光合作用参数的测定第16页
     ·RNA抽提第16页
     ·cDNA文库的构建第16-18页
     ·cDNA文库的鉴定第18页
     ·质粒提取第18-19页
     ·cDNA序列测定第19-20页
     ·EST序列的生物信息学分析第20-22页
     ·cDNA阵列的制备第22-23页
     ·cDNA阵列探针的准备第23-24页
     ·cDNA阵列杂交和数据提取第24-26页
     ·系统聚类Hierarchical clustering及K-means均值聚类第26-27页
     ·实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR)分析第27-28页
第三章 结果和分析第28-76页
   ·cDNA文库构建和大规模EST测序第28-30页
     ·总RNA的提取第28页
     ·双链cDNA的合成和分离第28-29页
     ·cDNA文库的质量鉴定第29页
     ·大规模提取质粒第29-30页
     ·质粒测序第30页
   ·EST序列生物信息学分析第30-35页
     ·基本统计分析第30-31页
     ·功能注释第31-33页
     ·高丰度表达基因第33页
     ·功能分类第33-35页
   ·缺水胁迫下玉米表达谱的cDNA阵列检测研究第35-76页
     ·cDNA阵列杂交探针的制备第35-36页
     ·缺水胁迫下对玉米形态及叶片光合特性的影响第36-38页
       ·叶片形态和根系长度第36-37页
       ·缺水胁迫处理对玉米叶片光合特性的影响第37-38页
     ·杂交信号分析第38-40页
     ·差异表达基因的鉴定和荧光定量PCR验证第40-41页
     ·叶和根在缺水胁迫下表达谱比较第41-50页
     ·缺水胁迫下不同功能类别基因的应答第50-54页
       ·叶中功能基因的应答第50-51页
       ·根中功能基因的应答第51-54页
     ·缺水胁迫下多种表达谱意味着多重的信号转导途径第54-62页
     ·复水后叶中基因表达谱第62页
     ·光合作用相关基因应答第62-64页
     ·信号转导相关基因应答第64-68页
       ·叶中信号转导相关基因应答第65-67页
       ·根中信号转导相关基因应答第67-68页
     ·缺水胁迫下物质能量代谢第68-70页
       ·叶内物质能量代谢第68-69页
       ·根内物质能量代谢第69-70页
     ·缺水胁迫下与防御相关的细胞屏障代谢第70-71页
       ·叶内相关基因表达第70-71页
       ·根内相关基因表达第71页
     ·缺水胁迫下其它基因的应答第71-76页
       ·叶中基因应答第71-73页
       ·根中基因应答第73-76页
第四章 讨论第76-89页
   ·cDNA文库第76-77页
     ·文库特点第76页
     ·cDNA文库的质量第76-77页
   ·cDNA阵列制作的一个重要的技术细节第77-78页
   ·水分胁迫及复水对玉米幼苗光合特性以及光合相关基因的影响第78-79页
     ·玉米幼苗光合特性第78-79页
     ·叶和根中光合相关基因变化第79页
   ·叶和根在缺水胁迫下表达谱比较第79-82页
     ·叶和根中基因表达基本情况第79-80页
     ·叶和根中不同功能类别基因的应答第80-82页
     ·叶和根信号转导相关基因第82页
     ·缺水胁迫下表达谱模式第82页
   ·结论第82-83页
 参考文献第83-89页
附录第89-102页
 补充表1 荧光定量PCR的引物序列第89-90页
 补充表2 叶中三个时期上下调基因第90-97页
 补充表3 根中三个时期上下调基因第97-102页
本论文所用缩写词及中文对照第102-103页
致谢第103-104页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第104页

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