| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 第一章 课题的提出和前人研究进展 | 第15-37页 |
| ·课题的提出 | 第15-16页 |
| ·前人研究进展 | 第16-36页 |
| ·柿属植物种质资源研究进展 | 第16-19页 |
| ·柿属植物的种类和分布 | 第16-17页 |
| ·柿的原产地和起源植物 | 第17页 |
| ·柿品种鉴定和亲缘关系 | 第17-19页 |
| ·种质资源研究中的分子标记概述 | 第19-21页 |
| ·SSR分子标记技术 | 第21-28页 |
| ·SSR引物开发途径 | 第22-27页 |
| ·数据库查询 | 第22-23页 |
| ·引物的转移扩增 | 第23页 |
| ·建立基因组文库 | 第23-24页 |
| ·与分子标记技术结合开发SSR引物 | 第24-27页 |
| ·利用RAPD方法筛选SSR | 第24-25页 |
| ·利用AFLP方法筛选SSR | 第25页 |
| ·利用ISSR方法筛选SSR | 第25-27页 |
| ·其他方法 | 第27页 |
| ·不同SSR引物分离方法评述 | 第27页 |
| ·SSR标记在果树中的应用 | 第27-28页 |
| ·构建遗传图谱 | 第28页 |
| ·种质鉴定及系谱分析 | 第28页 |
| ·遗传多样性分析 | 第28页 |
| ·基因的标定与标记辅助育种 | 第28页 |
| ·SRAP分子标记技术 | 第28-32页 |
| ·引物特征 | 第29页 |
| ·PCR扩增程序 | 第29-30页 |
| ·SRAP技术的应用 | 第30-31页 |
| ·种质鉴定和遗传多样性分析 | 第30页 |
| ·亲缘关系分析 | 第30-31页 |
| ·构建遗传连锁图 | 第31页 |
| ·基因连锁标记的寻找与基因定位 | 第31页 |
| ·比较基因组学研究 | 第31页 |
| ·SRAP技术和其它分子标记技术的比较 | 第31-32页 |
| ·基于反转录转座子的分子标记 | 第32-36页 |
| ·植物反转录转座子的类型 | 第32-33页 |
| ·反转录转座子分子标记的种类 | 第33-34页 |
| ·序列特异扩增多态性 | 第33页 |
| ·反转录转座子间扩增多态性 | 第33-34页 |
| ·反转录转座子—微卫星扩增多态性 | 第34页 |
| ·基于反转录转座子插入多态性 | 第34页 |
| ·反转录转座子分子标记的多态性 | 第34-35页 |
| ·基于反转录转座子的分子标记的应用 | 第35-36页 |
| ·遗传作图和重要农艺性状基因的标记 | 第35页 |
| ·生物多样性与系统进化研究 | 第35-36页 |
| ·种质鉴定 | 第36页 |
| ·研究目的和研究内容 | 第36-37页 |
| ·研究目的 | 第36页 |
| ·研究内容 | 第36-37页 |
| 第二章 柿属植物SSR分析技术的建立 | 第37-45页 |
| ·材料和方法 | 第37-39页 |
| ·材料 | 第37-38页 |
| ·DNA提取 | 第38页 |
| ·数据库查寻和引物设计 | 第38-39页 |
| ·SSR反应参数的优化 | 第39页 |
| ·SSR产物的检测 | 第39页 |
| ·结果与分析 | 第39-42页 |
| ·数据库搜寻和引物设计 | 第39-40页 |
| ·SSR技术体系的优化 | 第40-42页 |
| ·Mg~(2+)浓度 | 第40页 |
| ·dNTPs浓度 | 第40页 |
| ·引物浓度 | 第40-41页 |
| ·Taq酶浓度 | 第41页 |
| ·退火温度 | 第41页 |
| ·引物 | 第41-42页 |
| ·SSR反应体系的确立 | 第42页 |
| ·讨论 | 第42-45页 |
| ·SSR发掘程序和引物设计 | 第42-43页 |
| ·SSR技术体系的建立 | 第43页 |
| ·数据库查询方法的有效性 | 第43-45页 |
| 第三章 柿属植物SSR引物的分离 | 第45-59页 |
| ·材料和方法 | 第45-52页 |
| ·材料 | 第45页 |
| ·柿基因组DNA提取 | 第45页 |
| ·柿SSR标记的分离 | 第45-52页 |
| ·基于ISSR技术分离柿SSR | 第45-50页 |
| ·ISSR扩增 | 第45-46页 |
| ·ISSR产物克隆测序 | 第46-48页 |
| ·ISSR—PCR产物纯化 | 第46页 |
| ·ISSR—PCR产物克隆 | 第46页 |
| ·感受态细胞制备 | 第46-47页 |
| ·转化 | 第47页 |
| ·质粒DNA的提取 | 第47-48页 |
| ·阳性克隆检测 | 第48页 |
| ·测序与序列分析 | 第48页 |
| ·染色体步行 | 第48-50页 |
| ·基因组DNA的酶切 | 第48页 |
| ·接头的准备 | 第48-49页 |
| ·接头连接 | 第49页 |
| ·抑制PCR第一轮扩增 | 第49页 |
| ·抑制PCR第二轮扩增 | 第49页 |
| ·产物克隆测序和引物设计 | 第49-50页 |
| ·磁珠富集法分离柿SSR | 第50-52页 |
| ·基因组DNA酶切 | 第50页 |
| ·接头的准备 | 第50页 |
| ·接头的连接 | 第50-51页 |
| ·目的片段扩增 | 第51页 |
| ·杂交 | 第51页 |
| ·富集 | 第51-52页 |
| ·克隆、测序和引物设计 | 第52页 |
| ·结果和分析 | 第52-55页 |
| ·ISSR结合抑制PCR技术富集SSR | 第52-54页 |
| ·ISSR扩增和测序结果 | 第52页 |
| ·抑制PCR和SSR序列的获得 | 第52-54页 |
| ·磁珠富集法分离SSR | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-59页 |
| ·ISSR结合抑制PCR技术分离SSR标记方法的探讨 | 第55-57页 |
| ·磁珠富集法分离SSR标记方法的探讨 | 第57-58页 |
| ·引物的有用性 | 第58-59页 |
| 第四章 部分柿属植物亲缘关系的SSR分析 | 第59-69页 |
| ·材料和方法 | 第59-62页 |
| ·材料 | 第59页 |
| ·DNA提取 | 第59页 |
| ·SSR扩增 | 第59页 |
| ·SSR产物的检测 | 第59-62页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第59页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染程序 | 第59-62页 |
| ·玻璃板的准备 | 第59-61页 |
| ·制胶 | 第61页 |
| ·预电泳 | 第61页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第61页 |
| ·银染 | 第61-62页 |
| ·数据分析 | 第62页 |
| ·结果和分析 | 第62-66页 |
| ·SSR标记的多态性 | 第62-64页 |
| ·基于SSR标记的聚类分析 | 第64-66页 |
| ·讨论 | 第66-69页 |
| ·SSR分析电泳方式 | 第66-67页 |
| ·部分柿属植物种质间SSR聚类结果 | 第67-69页 |
| 第五章 部分柿属植物亲缘关系的SRAP分析 | 第69-79页 |
| ·材料和方法 | 第69-71页 |
| ·材料 | 第69页 |
| ·DNA提取与分离 | 第69页 |
| ·SRAP反应体系优化 | 第69-71页 |
| ·PCR扩增程序选择 | 第69-71页 |
| ·SRAP扩增所选用引物序列 | 第71页 |
| ·SRAP反应参数的优化 | 第71页 |
| ·SRAP产物的检测 | 第71页 |
| ·数据分析 | 第71页 |
| ·结果与分析 | 第71-76页 |
| ·柿属植物SRAP反应体系的建立 | 第71-73页 |
| ·Mg~(2+)浓度 | 第71-72页 |
| ·dNTPs浓度 | 第72页 |
| ·引物浓度 | 第72页 |
| ·Taq酶浓度 | 第72-73页 |
| ·SRAP反应体系的确立 | 第73页 |
| ·SRAP多态性分析 | 第73-74页 |
| ·29个样品的聚类分析 | 第74-75页 |
| ·主坐标分析 | 第75-76页 |
| ·讨论 | 第76-79页 |
| ·SRAP反应体系的优化 | 第76-77页 |
| ·基于SRAP标记的聚类分析 | 第77页 |
| ·SRAP标记及多态性 | 第77-79页 |
| 第六章 部分柿属植物亲缘关系的IRAP和REMAP分析 | 第79-87页 |
| ·材料和方法 | 第79-81页 |
| ·材料 | 第79页 |
| ·DNA提取 | 第79页 |
| ·引物设计 | 第79-80页 |
| ·PCR扩增及产物检测 | 第80-81页 |
| ·数据统计和聚类分析 | 第81页 |
| ·结果与分析 | 第81-84页 |
| ·IRAP和REMAP标记多态性 | 第81-82页 |
| ·相似系数和聚类分析 | 第82-84页 |
| ·讨论 | 第84-87页 |
| ·IRAP和REMAP分子标记技术在柿属植物中的应用 | 第84-85页 |
| ·部分柿属植物种质IRAP和REMAP聚类结果 | 第85-87页 |
| 第七章 总讨论 | 第87-92页 |
| ·柿属植物SSR引物开发 | 第87-88页 |
| ·部分柿属植物不同分子标记方法聚类分析结果 | 第88-90页 |
| ·不同聚类方法的比较 | 第90-91页 |
| ·金枣柿的分类地位 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-106页 |
| 附录 | 第106-130页 |
| 攻读博士学位期间发表论文 | 第130-131页 |
| 致谢 | 第131页 |
