| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-8页 |
| 引言 | 第8-10页 |
| 一、rasP21简介 | 第8页 |
| 二、rasP21在细胞内的循环机制 | 第8-9页 |
| 三、研究背景 | 第9页 |
| 四、缩写 | 第9-10页 |
| 材料和方法 | 第10-15页 |
| 一、PDB数据库简介 | 第10-11页 |
| 二、MSMS软件使用方法 | 第11-12页 |
| 三、Swiss PDB Viewer软件介绍 | 第12-13页 |
| 四、计算脚本数据来源 | 第13-15页 |
| 分析和讨论 | 第15-40页 |
| 一、GTP结合形式的rasP21的三维结构分析 | 第15-17页 |
| 1、rasP21的三维结构 | 第15-16页 |
| 2、核苷酸的微环境 | 第16页 |
| 3、核苷酸口袋中的Mg~(2+)和水分子 | 第16-17页 |
| 二、RasGAP对GTP水解的影响 | 第17-26页 |
| 1、RasGAP的结构 | 第17页 |
| 2、RasGAP作用下，rasP21的结构变化 | 第17-21页 |
| (1) 分子和分子内空洞的表面积，体积变化 | 第17-18页 |
| (2) 二级结构的变化 | 第18-19页 |
| (3) 氨基酸残基的位移 | 第19-20页 |
| (4) 可及性的变化 | 第20页 |
| (5) 柔性的变化 | 第20-21页 |
| 3、RasGAP和rasP21的相互作用 | 第21-26页 |
| (1) 疏水相互作用以及氢键 | 第21页 |
| (2) 静电相互作用 | 第21-22页 |
| (3) 静电场对GTP水解的影响 | 第22-23页 |
| (4) 关于作用位点和关键残基 | 第23-24页 |
| (5) RasGAP催化下rasP21的GTP水解的模型 | 第24-25页 |
| (6) 其他的小G蛋白的GAP | 第25-26页 |
| 三、Sos的作用 | 第26-40页 |
| 1、Sos形成的静电场 | 第26页 |
| 2、rasP21主链骨架的变化 | 第26页 |
| 3、rasP21二级结构的变化 | 第26-27页 |
| 4、核苷酸附近的静电场 | 第27页 |
| 5、GDP／GTP进入核苷酸口袋的方式 | 第27-28页 |
| 6、其他的GEF | 第28-40页 |
| 结论 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-43页 |
| 工作期间发表论文 | 第43-44页 |
| 致谢 | 第44页 |