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对虾白斑病毒的侵染机制及其特异性单链抗体基因研究

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-16页
第一章 对虾白斑综合症病毒研究进展第16-32页
   ·前言第16页
   ·白斑综合症病毒的病毒粒子结构和基因组结构第16-19页
     ·对虾白斑综合症概况第16页
     ·白斑综合症病毒粒子的形态学第16-18页
     ·白斑综合症病毒的基因组结构第18-19页
   ·白斑综合症病毒的分类学地位第19页
   ·白斑综合症病毒对宿主的感染和流行病学第19-21页
     ·白斑综合症病毒感染的宿主范围第19-20页
     ·白斑综合症病毒的组织嗜性第20页
     ·WSSV的组织病理学和细胞病理学第20页
     ·白斑综合症病毒感染的过程、感染方式与感染模型第20-21页
   ·白斑综合症病毒的结构蛋白及其功能研究第21-26页
     ·WSSV的主要囊膜蛋白第22-23页
       ·VP28第22页
       ·VP26(p22)第22-23页
       ·VP19第23页
     ·WSSV的主要核衣壳蛋白第23-24页
       ·VP24第23-24页
       ·VP15第24页
     ·其他已经鉴定的结构蛋白第24-25页
       ·VP35第24-25页
       ·VP466第25页
       ·VP281第25页
       ·胶原蛋白第25页
     ·WSSV结构蛋白的糖基化修饰研究第25-26页
   ·WSSV的转录和复制相关的蛋白第26-27页
   ·WSSV启动子序列特征第27页
   ·对虾白斑病毒基因组的比较第27-28页
   ·WSSV与细胞凋亡第28-29页
   ·WSSV的检测第29-31页
     ·PCR检测第29-30页
     ·核酸杂交检测第30页
     ·用特异性抗体检测WSSV第30-31页
     ·其他检测技术第31页
   ·结语与展望第31-32页
第二章 综述:噬菌体展示技术第32-64页
   ·噬菌体展示技术的基本原理第32-37页
     ·丝状噬菌体的生物学特征第32-34页
     ·丝状噬菌体的生活周期第34-35页
     ·噬菌体展示的基本原理第35-37页
   ·其他噬菌体展示系统第37-40页
     ·T4噬菌体展示系统第37-38页
     ·λ噬菌体展示系统第38-40页
     ·T7噬菌体展示系统第40页
   ·噬菌体展示文库的构建第40-42页
     ·噬菌体展示多肽文库的构建第41页
     ·噬菌体展示抗体文库的构建第41-42页
   ·噬菌体展示文库的筛选方法第42-46页
     ·以分子为筛选靶标第42-43页
       ·以单一蛋白质为筛选靶标第42-43页
       ·以核酸为筛选靶标第43页
       ·以复合分子为筛选靶标第43页
     ·以细胞作为筛选靶标第43-44页
     ·以组织或器官作为筛选靶标第44页
     ·一些新的筛选方法第44-46页
       ·以DNA为基础的筛选方法(DNA-based selection)第44-45页
       ·反复淘洗和封闭法(interactive panning and blocking, IPAB)第45页
       ·选择性感染噬菌体法(selectively infective phage, SIP)第45页
       ·亲和力捕获筛选法(selection by avidity capture, SAC)第45-46页
   ·噬菌体展示系统的应用第46-56页
     ·噬菌体抗体库技术与抗体工程第46-49页
     ·蛋白质工程第49-53页
       ·酶工程第50-51页
       ·新蛋白质的发现和蛋白质的改造第51-53页
         ·新受体和配体的发现第51-52页
         ·蛋白质的定向设计和空间结构改造第52-53页
         ·蛋白质之间的互作研究第53页
     ·用于新药筛选和疾病的诊断治疗第53-56页
       ·用作诊断试剂的开发第54页
       ·用于传染病和肿瘤的防治第54-55页
       ·用作疾病的基因治疗载体第55页
       ·用于疫苗的开发和研制第55-56页
   ·噬菌体展示系统的拓展——其他表面展示系统第56-62页
     ·杆状病毒表面展示系统第56-59页
     ·细菌表面展示系统第59-60页
     ·酵母表面展示系统第60-61页
     ·体外展示技术第61-62页
       ·共价展示技术(covalentdisplay technique, CDT)第61-62页
       ·多聚体展示技术(polysome display)第62页
       ·RNA-多肽融合系统(RNA-peptide fusions)第62页
   ·结语第62-63页
   ·本论文的研究背景和研究目的第63-64页
第三章 研究方法第64-73页
   ·质粒DNA的制备和纯化第64-65页
     ·质粒DNA的小量制备第64页
     ·质粒DNA的大量制备第64-65页
     ·DNA的溴化乙锭—氯化铯浮力密度梯度离心纯化第65页
   ·限制性酶消化反应第65页
   ·载体去磷酸化第65-66页
   ·从琼脂糖凝胶中回收DNA第66-67页
     ·玻璃奶法第66页
     ·低熔点琼脂糖法第66-67页
   ·DNA连接反应第67页
   ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第67-68页
     ·氯化钙法第67页
     ·电转化法第67-68页
   ·病毒的增殖、分离和提纯第68-69页
     ·毒源制备及病毒在螯虾中增殖第68页
     ·病毒的提取与纯化第68-69页
   ·原代虾细胞培养第69页
   ·噬菌体展示技术第69-71页
     ·文库的淘洗第69-70页
     ·文库噬菌体的拯救第70页
     ·ELISA和测序第70-71页
   ·空斑减少中和试验第71页
   ·膜蛋白的抽提第71-72页
   ·Western blot分析第72页
   ·激光共聚焦显微镜第72-73页
第四章 对虾的原代细胞培养及白斑病毒对原代细胞的感染第73-82页
   ·引言第73页
   ·材料与方法第73-75页
     ·材料第73页
     ·研究方法第73-75页
         ·毒源制备及病毒在螯虾中增殖第73-74页
       ·病毒的提取与纯化第74页
       ·原代虾细胞培养第74页
       ·TCID50测定第74-75页
       ·MTT法检测细胞存活第75页
       ·电镜负染第75页
       ·病毒感染细胞的超薄切片电镜观察第75页
   ·研究结果第75-80页
     ·类淋巴组织可成功地培养对虾原代细胞第75-76页
     ·TCID50法对病毒的滴定结果第76-77页
     ·MTT法滴定结果第77-79页
     ·电镜负染结果第79页
     ·细胞超薄切片显示病毒存在于感染细胞内第79-80页
   ·讨论第80-82页
第五章 囊膜蛋白VP28在WSSV感染中的功能鉴定第82-103页
   ·引言第82-84页
   ·材料第84-85页
     ·试剂第84页
     ·载体第84页
     ·引物第84-85页
     ·菌株和实验动物第85页
   ·试验方法第85-90页
     ·病毒的生产和纯化第85页
     ·重组质粒的构建第85-87页
     ·重组蛋白的表达和纯化第87页
     ·VP28多克隆抗体的制备第87-88页
     ·原代虾细胞培养第88页
     ·病毒感染实验第88页
     ·VP28-EGFP融合蛋白与细胞结合试验第88页
     ·膜蛋白的抽提和Western blot分析第88-89页
     ·激光共聚焦显微镜观察VP28-EGFP融合蛋白与细胞的结合第89页
     ·竞争性ELISA第89-90页
     ·病毒感染和抗体阻断试验第90页
   ·研究结果第90-99页
     ·重组表达质粒pET28+28和pET28+28G的鉴定第90-92页
     ·重组蛋白VP28和VP28-EGFP的表达和纯化第92-93页
     ·VP28与对虾细胞膜的结合能力与pH有关第93-95页
       ·VP28从细胞膜向细胞质的运输第95-97页
       ·VP28与WSSV竞争性结合对虾原代细胞第97-98页
       ·VP28多克隆抗体阻断了WSSV对细胞的感染第98-99页
   ·讨论第99-103页
第六章 与对虾白斑病毒特异性结合的噬菌体展示单链抗体的淘洗第103-116页
   ·引言第103-104页
   ·材料与方法第104-108页
     ·实验材料第104-105页
       ·病毒来源第104页
       ·试验动物第104页
       ·文库、质粒和菌体第104页
       ·试剂等材料第104-105页
     ·实验方法第105-108页
       ·病毒的增殖、分离和提纯第105页
       ·噬菌体抗体展示文库的扩增第105页
       ·将噬菌体展示文库转化成噬菌体形式第105页
       ·文库噬菌体的滴定第105-106页
       ·在免疫管中筛选(panning)第106页
       ·辅助噬菌体KM13的扩增、培养和滴定第106-107页
       ·文库噬菌体的拯救第107页
       ·单克隆phage ELISA第107-108页
       ·抗体基因片段的序列测定第108页
   ·结果第108-114页
     ·WSSV特异性抗体的亲和筛选第108-109页
     ·阳性噬菌体展示抗体的特异性评价第109页
     ·抗体的序列及其分析第109-114页
   ·讨论第114-116页
研究总结第116-118页
参考文献第118-140页
已发表和待发表的论文第140-141页
致谢第141-142页

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