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鸡生长轴基因的SNPs分析及cGHR基因第八、九内含子的克隆测序研究

第一章 文献综述第1-32页
 1 禽类生长轴及其对生长发育的调控第14页
 2 鸡胰岛素样生长因子-1基因研究进展第14-20页
   ·鸡胰岛素样生长因子-1的分子发现第14-15页
   ·胰岛素样生长因子-1的作用机理第15-16页
   ·鸡胰岛素样生长因子-1的生物学功能第16-18页
   ·鸡胰岛素样生长因子-1基因结构及其定位第18-19页
   ·鸡胰岛素样生长因子-1基因遗传多样性研究第19-20页
 3 鸡生长激素基因研究进展第20-24页
   ·鸡生长激素的作用途径第20页
   ·鸡生长激素的结构第20-21页
   ·鸡生长激素的生物学功能第21-22页
   ·鸡生长激素的结合蛋白第22页
   ·鸡生长激素基因的研究现状第22-24页
   ·鸡生长激素基因多态性与生产性能的关系第24页
 4 鸡生长激素受体基因研究进展第24-27页
   ·鸡生长激素受体的结构第24-25页
   ·由生长激素受体介导的信号传导第25页
   ·鸡生长激素受体基因表达的研究第25-26页
   ·鸡生长激素受体基因的结构及其研究现状第26页
   ·鸡生长激素受体基因与矮小型鸡第26-27页
   ·鸡生长激素受体基因多态性与生产性能的关系第27页
 5 单核苷酸多态性(SNPs)概念及其检测方法第27-30页
   ·单核苷酸多态性的概念及其性质第28-29页
   ·单核苷酸多态性的检测方法第29-30页
 6 研究目标和技术路线第30-32页
第二章 鸡IGF-1基因5′端Pst Ⅰ位点的遗传多样性及其与部分生产性能的关系第32-45页
 1 材料与方法第32-35页
   ·实验动物第32页
   ·基因组DNA提取第32页
   ·DNA样品检测第32-33页
   ·引物设计第33页
   ·PCR扩增条件第33页
   ·酶切条件第33-34页
   ·PCR及酶切产物的检测第34页
   ·统计分析软件及数学模型第34-35页
 2 结果与分析第35-41页
   ·基因组DNA的提取结果第35页
   ·PCR产物的电泳结果第35-36页
   ·酶切产物的电泳结果第36页
   ·不同品种IGF-1基因的PCR-RFLP-Pst Ⅰ基因及基因型频率第36-39页
   ·不同品种IGF-1基因的PCR-RFLP-Pst Ⅰ基因遗传多样性分析第39-40页
   ·鸡IGF-1基因型与其体重的相关研究第40页
   ·鸡IGF-1基因型与其蛋用性状的相关研究第40-41页
 3 讨论第41-44页
   ·IGF-1基因的遗传多样性分析第41-42页
   ·IGF-1基因的多态信息含量和杂合度第42页
   ·性别与IGF-1基因型的关系第42-43页
   ·IGF-1基因对鸡生长的影响第43页
   ·IGF-1基因对鸡产蛋性能的影响第43-44页
 4 小结第44-45页
第三章 GH基因内含子1Msp Ⅰ位点的遗传多样性及其与部分生产性能的关系第45-54页
 1 材料与方法第45页
   ·实验动物第45页
   ·基因组DNA提取第45页
   ·引物设计第45页
   ·PCR扩增条件第45页
   ·酶切条件第45页
   ·统计分析软件及数学模型第45页
 2 结果与分析第45-50页
   ·PCR产物的电泳结果第45-46页
   ·酶切产物的电泳结果第46-47页
   ·不同品种GH基因的PCR-RFLP-Msp Ⅰ基因及基因型频率第47页
   ·不同品种GH基因的PCR-RFLP-Msp Ⅰ基因遗传多样性分析第47-49页
   ·鸡GH基因型与其体重的相关研究第49-50页
   ·鸡GH基因型与其蛋用性状的相关研究第50页
 3 讨论第50-52页
   ·GH基因的遗传多样性分析第50-51页
   ·GH基因对鸡生长的影响第51-52页
   ·GH基因对鸡产蛋性能的影响第52页
 4 小结第52-54页
第四章 GHR基因HindⅢ位点的遗传多样性研究第54-58页
 1 材料与方法第54页
   ·实验动物第54页
   ·基因组DNA提取第54页
   ·引物设计第54页
   ·PCR扩增条件第54页
   ·酶切条件第54页
 2 结果与分析第54-57页
   ·PCR产物的电泳结果第54-55页
   ·酶切产物的电泳结果第55页
   ·不同品种GHR基因的PCR-RFLP-HindⅢ基因及基因型频率第55-57页
 3 讨论第57页
 4 小结第57-58页
第五章 GHR基因第八、九内含子的克隆测序第58-64页
 1 材料与方法第58-61页
   ·DNA样品第58页
   ·获得内含子8、9未知序列的引物设计第58页
   ·内含子8、9PCR扩增条件第58-59页
   ·PCR产物的克隆测序第59-61页
   ·核苷酸序列分析及同源性分析软件第61页
 2 结果与分析第61-63页
   ·内含子8的扩增结果第61页
   ·内含子8的测序结果第61-62页
   ·内含子9的扩增结果第62页
   ·内含子9的测序结果第62-63页
   ·内含子8、内含子9序列同源性比较第63页
 3 讨论第63页
 4 小结第63-64页
第六章 GHR基因外显子10及3′UTR区SNPs的搜寻第64-77页
 1 材料与方法第64-65页
   ·实验样品第64页
   ·各引物的设计、合成及扩增区域第64-65页
   ·各引物的扩增条件第65页
   ·DHPLC的条件第65页
   ·测序第65页
   ·同源性比较的软件第65页
 2 结果与分析第65-74页
   ·引物1、2、3、4、5、6、7的扩增结果第66页
   ·DHPLC测定的结果第66-68页
   ·引物1、2、3、4、5、6、7测序结果及同源性比较第68-74页
   ·外显子10所编码的氨基酸第74页
   ·新发现的SNPs第74页
 3 讨论第74-75页
 4 小结第75-77页
第七章 GHR新等位基因[C/A(2907)]在全国24个家禽品种中的遗传多样性分析第77-81页
 1 材料与方法第77-78页
   ·实验动物第77页
   ·引物设计第77页
   ·PCR扩增条件第77-78页
   ·酶切条件第78页
 2 结果与分析第78-79页
   ·PCR产物的电泳结果第78页
   ·PCR产物酶切的电泳结果第78页
   ·GHR新基因座位[C/A(2907)]的基因分布第78-79页
 3 讨论第79-80页
 4 小结第80-81页
第八章 GHR新等位基因[G/A(2408)]在资源参考家系中与部分生长性状的关联分析第81-91页
 1 材料与方法第81页
   ·实验动物第81页
   ·引物设计第81页
   ·PCR扩增条件第81页
   ·酶切条件第81页
   ·统计方法及数学模型第81页
 2 结果与分析第81-88页
   ·PCR产物的电泳结果第81-82页
   ·PCR产物酶切后的电泳结果第82页
   ·GHR该等位基因在资源参考家系中与部分生长性状的关联分析第82-88页
     ·该新等位基因与体重的关联分析第82-84页
     ·该新等位基因与脂肪沉积性状的关联分析第84-85页
     ·该新等位基因与胴体性状的关联分析第85-87页
     ·该新等位基因与体尺性状的关联分析第87-88页
 3 讨论第88-89页
 4 小结第89-91页
第九章 结论第91-94页
参考文献第94-101页
附录A 常用缩写词及英汉对照第101-102页
附录B cGHRmRNA and 3′UTR序列+新获得序列第102-104页
附录C 氨基酸改变后对cGHR蛋白二级结构和理化特性的预测第104-107页
附录D 部分测序报告第107-121页
致谢第121-122页
作者简历及在读期间的成果第122页

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