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豌豆根瘤菌染色体hurL基因突变对其结瘤基因表达和结瘤表型的影响

摘要第1-6页
目录第6-10页
一、引言第10-13页
二、材料与方法第13-40页
 1 菌株与质粒第13页
 2 引物、酶和主要生化试剂第13-15页
 3 基本的实验技术和方法第15-18页
   ·细菌培养第15-16页
   ·质粒DNA的抽提第16-17页
   ·感受态细胞制备和重组质粒的转化第17页
   ·从低熔点琼脂糖凝胶中回收DNA第17-18页
 4 根瘤菌总DNA的抽提第18-19页
   ·根瘤菌总DNA的小量抽提第18-19页
   ·根瘤菌总DNA的大量抽提第19页
 5 Southern杂交第19-22页
   ·切口平移法标记hurL基因探针第19-20页
   ·将DNA转移到尼龙膜第20-22页
   ·放射性标记的探针与固定于尼龙膜上的DNA进行杂交第22页
 6 豌豆根瘤菌基因组hurL基因的克隆及序列分析第22-24页
   ·豌豆根瘤菌基因组DNA PstI酶切片段3.0-3.2 kb部分文库的构建第22-23页
   ·利用斑点杂交的方法从根瘤菌基因组DNA部分文库中筛选含hurL阳性克隆第23-24页
   ·阳性克隆的PCR验证及序列分析第24页
   ·DNA序列分析及同源性比较第24页
 7 根瘤菌RNA的抽提第24-26页
   ·RNA专用仪器的预处理第24页
   ·水饱和酚的配制第24-25页
   ·根瘤菌RNA的抽提第25-26页
   ·RNA的甲醛变性电泳第26页
 8 引物延伸方法确定hurL基因的转录启始位点第26-28页
   ·引物P-1061的标记第26页
   ·根瘤菌总RNA与引物退火,延伸反应第26-28页
   ·DNA的测序第28页
 9 hurL启动子与lacZ融合表达质粒的构建第28-29页
 10 三亲本杂交第29-30页
 11 β-半乳糖苷酶的测定第30-31页
   ·试剂配制第30页
   ·β-半乳糖苷酶活性测定第30-31页
 12 豌豆根瘤菌hurL突变株的构建第31-34页
   ·含插入了卡那霉素抗性片段的hurL基因的重组质粒的构建第31-32页
     ·含卡那霉素抗性基因的DNA片段的制备第31-32页
     ·PCR方法在hurL基因中引入适当(XbaI)酶切位点第32页
     ·含插入了卡那霉素抗性片段的hurL基因的重组质粒的构建第32页
   ·豌豆根瘤菌hurL突变株的构建第32-33页
   ·豌豆根瘤菌hurL基因卡那霉素抗性插入突变菌株的验证第33-34页
     ·PCR方法验证第33页
     ·Southern杂交方法验证第33-34页
 13 hurL突变互补菌株的构建第34-35页
   ·根瘤菌电转化感受态细胞的制备第34-41534页
   ·含hurL基因DNA片段克隆于广宿主质粒pRK第41534-34页
   ·电转化构建hurL突变互补菌株第34-35页
 14 根瘤菌生长曲线的测定第35页
 15 根瘤菌活菌数的测定第35页
 16 根瘤菌对紫外线敏感性的测定第35-36页
 17 根瘤菌细胞粗提物的制备第36页
 18 凝胶延滞第36-37页
 19 结瘤基因表达报告质粒的构建第37页
 20 含多拷贝hurL基因的根瘤菌菌株的构建第37-38页
 21 豌豆根瘤菌在宿主植物上的结瘤试验第38-40页
   ·植物种子的灭菌与萌发第38-39页
   ·结瘤实验第39-40页
三、 实验结果第40-71页
 1 豌豆根瘤菌基因组中只含单一种类和单一拷贝的hurL基因第40-41页
 2 豌豆根瘤菌染色体hurL基因文库的构建第41-43页
 3 从豌豆根瘤菌染色体hurL基因文库中筛选hurL基因阳性克隆第43-45页
 4 重组质粒pUP33中含hurL基因的3.1 kb PstI外源片段的核苷酸序列分析第45-49页
 5 R. leguminosarum bv. viciae HurL与其它种类微生物同源蛋白之间的同源性比较第49-50页
 6 引物延伸方法确定hurL基因的转录起始位点第50-52页
 7 hurL基因在豌豆根瘤菌体内转录的研究第52-54页
 8 豌豆根瘤菌hurL突变株的构建第54-56页
 9 豌豆根瘤菌hurL突变株M704的验证第56-58页
 10 豌豆根瘤菌hurL突变株的生长表型第58-61页
 11 豌豆根瘤菌hurL突变株对紫外线的敏感性第61-62页
 12 豌豆根瘤菌hurL突变株M704在宿主植物Pisum sativum cv. Frisson(豌豆)和 Vicia hirsuta(野豌豆)上的结瘤表型第62-64页
 13 豌豆根瘤菌hurL突变株中NodD蛋白产量测定第64-66页
 14 豌豆根瘤菌hurL基因突变对结瘤基因表达的影响第66-68页
 15 增加豌豆根瘤菌体内hurL基因拷贝数对结瘤基因转录表达的影响第68-71页
四、 讨论第71-77页
 1 豌豆根瘤菌HurL与其它细菌HU类蛋白有很高的同源性第71页
 2 豌豆根瘤菌hurL基因位于其染色体DNA上第71-72页
 3 豌豆根瘤菌hurL基因在体内作为一个单独的启动子转录第72-73页
 4 hurL基因在豌豆根瘤菌体内表达的不稳定性第73页
 5 hurL基因参与nodD基因的转录调控第73-74页
 6 hurL基因参与调节其它结瘤基因的表达第74-75页
 7 豌豆根瘤菌hurL基因影响根瘤菌的生长第75页
 8 hurL基因突变影响豌豆根瘤菌在宿主植物上的结瘤第75-77页
结语第77-78页
参考文献第78-87页
发表文章附录第87-88页
致谢第88页

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