| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-17页 |
| 第一部分 文献综述 | 第17-64页 |
| 引言 | 第17-19页 |
| 第一章 芽孢杆菌研究进展 | 第19-36页 |
| 1 芽孢杆菌的分类概况 | 第19-21页 |
| ·芽孢杆菌的分类简史 | 第19页 |
| ·现有的芽孢杆菌属 | 第19-21页 |
| 2 芽孢杆菌属 | 第21-22页 |
| 3 芽孢杆菌分类鉴定方法 | 第22-30页 |
| ·芽孢杆菌分类鉴定的常用特征 | 第22-23页 |
| ·表型分类鉴定方法 | 第23-27页 |
| ·全细胞可溶蛋白电泳分析 | 第24页 |
| ·全细胞脂肪酸分析 | 第24-25页 |
| ·多位点酶电泳分析 | 第25页 |
| ·数值分类鉴定方法 | 第25-27页 |
| ·遗传学分类鉴定方法 | 第27-30页 |
| ·DNA-DNA杂交技术和DNA的G+C mol%测定 | 第28-29页 |
| ·保守基因序列分析 | 第29-30页 |
| 4 芽孢杆菌的资源利用 | 第30-36页 |
| ·在食品加工和保鲜中的应用 | 第30-31页 |
| ·在饲料添加剂和生物兽药上的应用 | 第31-32页 |
| ·在医学上的应用 | 第32页 |
| ·在植物病虫害生物防治中的应用 | 第32-33页 |
| ·生物肥料 | 第33页 |
| ·在工业生产中的应用 | 第33-34页 |
| ·在环境保护上的应用 | 第34页 |
| ·在基因工程和重组基因工程疫苗上的应用 | 第34-36页 |
| 第二章 饲用芽孢杆菌研究进展 | 第36-54页 |
| 1 绿色饲料添加剂 | 第36-37页 |
| 2 动物微生态制剂的发展历史 | 第37-38页 |
| 3 研制饲用微生态制剂的益生菌菌种 | 第38-39页 |
| 4 饲用芽孢杆菌的作用机理 | 第39-45页 |
| ·芽孢杆菌在动物消化道的增殖 | 第39-40页 |
| ·生物夺氧,有利于厌氧菌的生长 | 第40页 |
| ·拮抗动物病原细菌,维持和调整肠道微生态平衡 | 第40-41页 |
| ·产生多种酶类,提高动物消化酶活性 | 第41-42页 |
| ·芽孢杆菌的营养作用,促进动物生长 | 第42页 |
| ·促进动物器官的生理机能成熟,改善动物生产性能 | 第42-43页 |
| ·增强机体的免疫功能,提高抗病能力 | 第43-45页 |
| 5 饲用芽孢杆菌制剂的使用效果 | 第45-52页 |
| ·芽孢杆菌制剂在动物生产上的应用 | 第45-50页 |
| ·在猪生产上使用效果 | 第45-47页 |
| ·在家禽生产上的应用效果 | 第47-48页 |
| ·在反刍动物生产上的应用效果 | 第48-49页 |
| ·在水产养殖上的应用效果 | 第49-50页 |
| ·芽孢杆菌与其它益生菌复合使用 | 第50-52页 |
| 6 影响芽孢杆菌作用效果的因素 | 第52-54页 |
| ·饲用芽孢杆菌菌种和活性 | 第53页 |
| ·动物的生理状况 | 第53页 |
| ·饲料成分 | 第53页 |
| ·使用的剂量和饲喂方式 | 第53-54页 |
| 第三章 动物肠道微生物菌群结构及多样性研究方法 | 第54-62页 |
| 1 荧光原位杂交技术 | 第54-55页 |
| 2 脉冲场凝胶电泳 | 第55-56页 |
| 3 核酸探针杂交法 | 第56页 |
| 4 基因芯片技术 | 第56-57页 |
| 5 基于16S rDNA序列同源分析 | 第57页 |
| 6 ERIC-PCR | 第57-58页 |
| 7 PCR-DGGE方法 | 第58-60页 |
| 8 实时荧光定量PCR | 第60-62页 |
| 第四章 研究的目的意义及研究方法 | 第62-64页 |
| 1 饲用芽孢杆菌有待研究的问题 | 第62页 |
| 2 本研究的目的意义及研究方法 | 第62-64页 |
| 第二部分 研究内容 | 第64-155页 |
| 第五章 产酶芽孢杆菌的筛选及鉴定 | 第64-83页 |
| 1 材料与方法 | 第65-70页 |
| ·菌种 | 第65页 |
| ·培养基 | 第65-66页 |
| ·产酶芽孢杆菌筛选培养基 | 第65页 |
| ·芽孢杆菌产酶发酵培养基 | 第65-66页 |
| ·菌种鉴定用培养基及微量生化发酵管 | 第66页 |
| ·主要试剂 | 第66-67页 |
| ·酶活测定试剂 | 第66-67页 |
| ·16S rDNA序列分析用试剂 | 第67页 |
| ·主要仪器设备 | 第67页 |
| ·产酶芽孢杆菌的筛选 | 第67-68页 |
| ·产酶芽孢杆菌的初筛 | 第67-68页 |
| ·产酶芽孢杆菌的复筛 | 第68页 |
| ·高产酶活芽孢杆菌的初步鉴定 | 第68-69页 |
| ·16S rDNA序列分析 | 第69页 |
| ·菌株基因组DNA的提取 | 第69页 |
| ·菌株16S rDNA的扩增 | 第69页 |
| ·PCR产物检测及16S rDNA序列分析 | 第69页 |
| ·数据统计 | 第69-70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-79页 |
| ·产酶芽孢杆菌的筛选 | 第70-73页 |
| ·产纤维素酶活性芽孢杆菌的筛选 | 第70-71页 |
| ·产淀粉酶活性芽孢杆菌筛选 | 第71-72页 |
| ·产蛋白酶活性芽孢杆菌的筛选 | 第72页 |
| ·高产酶活芽孢杆菌的筛选结果 | 第72-73页 |
| ·高产酶活Pab02菌株的初步鉴定 | 第73-74页 |
| ·芽孢杆菌16S rDNA PCR产物的检验 | 第74-75页 |
| ·芽孢杆菌Pab02 16S rDNA测序结果 | 第75-76页 |
| ·16S rDNA序列分析 | 第76-79页 |
| 3 讨论 | 第79-83页 |
| ·产酶活性芽孢杆菌的筛选 | 第79-81页 |
| ·产纤维素酶活性芽孢杆菌筛选 | 第79-80页 |
| ·产淀粉酶活性芽孢杆菌筛选 | 第80页 |
| ·产蛋白酶活性芽孢杆菌筛选 | 第80-81页 |
| ·益生芽孢杆菌Pab02的鉴定 | 第81-83页 |
| 第六章 芽孢杆菌Pab02对雄性小鼠生殖安全性评价 | 第83-100页 |
| 1 材料及方法 | 第84-88页 |
| ·材料 | 第84-86页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂的制备 | 第84页 |
| ·实验动物及基础日粮 | 第84-85页 |
| ·主要试剂及配制 | 第85-86页 |
| ·主要仪器和设备 | 第86页 |
| ·方法 | 第86-88页 |
| ·动物分组及饲养管理 | 第86页 |
| ·小鼠体重及生殖器官的测定 | 第86页 |
| ·小鼠睾丸组织形态学分析 | 第86-87页 |
| ·小鼠睾丸组织SOD活性和MDA水平测定 | 第87页 |
| ·小鼠附睾中精子活率、畸形率和精子顶体酶活性的检测 | 第87-88页 |
| ·小鼠血清睾酮水平的检测 | 第88页 |
| ·数据统计 | 第88页 |
| 2 结果 | 第88-94页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠体重及睾丸和附睾重的影响 | 第88-89页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠睾丸组织结构的影响 | 第89-92页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠睾丸组织SOD活性和MDA水平的影响 | 第92-93页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠附睾中精子活率、畸形率和精子顶体酶活性的影响 | 第93-94页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠血清睾酮水平的影响 | 第94页 |
| 3 讨论 | 第94-100页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠生长和生殖器官发育的影响 | 第94-96页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠睾丸组织MDA水平和SOD活性的影响 | 第96-97页 |
| ·芽孢杆菌Pab02对小鼠精子活率、精子畸形的影响 | 第97-98页 |
| ·芽孢杆菌对小鼠血清睾酮的影响 | 第98-100页 |
| 第七章 肉鸡口服芽孢杆菌Pab02后肠道中芽孢杆菌数量的动态变化 | 第100-113页 |
| 1 材料 | 第101页 |
| ·肉鸡 | 第101页 |
| ·菌株 | 第101页 |
| ·主要仪器 | 第101页 |
| ·主要试剂 | 第101页 |
| 2 方法 | 第101-104页 |
| ·引物和探针的设计 | 第102页 |
| ·制备芽孢杆菌Pab02菌悬液 | 第102页 |
| ·动物分组及饲养 | 第102-103页 |
| ·纯培养细菌基因组DNA的提取 | 第103页 |
| ·采集样品和提取肠道菌群的总DNA | 第103页 |
| ·标准品的制备 | 第103页 |
| ·RT-qPCR条件 | 第103-104页 |
| ·枯草芽孢杆菌TaqMan探针RT-qPCR标准曲线的制作 | 第104页 |
| ·TaqMan探针RT-qPCR对鸡肠道内芽孢杆菌的检测 | 第104页 |
| 3 结果与分析 | 第104-109页 |
| ·常规PCR产物电泳检测结果 | 第104-105页 |
| ·芽孢杆菌属常规PCR产物测序结果 | 第105-106页 |
| ·RT-qPCR标准曲线的建立 | 第106-107页 |
| ·RT-qPCR检测鸡肠道中芽孢杆菌的结果 | 第107-109页 |
| ·对照组鸡肠道内芽孢杆菌数的检测 | 第107页 |
| ·灌服芽孢杆菌Pab02后对鸡肠道中芽孢杆菌数量的检测 | 第107-109页 |
| 4 讨论 | 第109-113页 |
| ·常规PCR产物测序与引物和探针的验证 | 第109页 |
| ·肉鸡肠道中芽孢杆菌数量RT-qPCR检测方法的建立 | 第109-111页 |
| ·肠道菌群总DNA的提取 | 第111页 |
| ·肉鸡肠道中芽孢杆菌数量及口服芽孢杆菌Pab02后的变化规律 | 第111-113页 |
| 第八章 ERIC-PCR/PCR-DGGE分析肉鸡口服枯草芽孢杆菌Pab02后肠道菌群结构多样性的研究 | 第113-131页 |
| 1 材料 | 第114-115页 |
| ·主要仪器设备 | 第114-115页 |
| ·主要试剂 | 第115页 |
| 2 方法 | 第115-119页 |
| ·肠道菌群总DNA样品的处理 | 第116页 |
| ·ERIC-PCR技术分析 | 第116页 |
| ·ERIC-PCR的反应体系和反应条件 | 第116页 |
| ·各肠道菌群总DNA的ERIC-PCR扩增 | 第116页 |
| ·图谱分析 | 第116页 |
| ·PCR-DGGE技术分析 | 第116-119页 |
| ·肠道菌群的16S rRNA V_3区PCR扩增 | 第116-117页 |
| ·菌群基因组总DNA 16S rDNA V_3区扩增DNA片段DGGE分析 | 第117页 |
| ·肠道菌群的DGGE条带的多样性分析 | 第117-118页 |
| ·割胶回收特征性条带并克隆测序 | 第118-119页 |
| 3 结果与分析 | 第119-127页 |
| ·ERIC-PCR分析肉鸡肠道菌群结构的多样性结果 | 第119-123页 |
| ·肉鸡肠道菌群ERIC-PCR指纹图谱 | 第119-121页 |
| ·ERIC-PCR检测肉鸡肠道菌群多样性 | 第121-123页 |
| ·PCR-DGGE分析肉鸡肠道菌群结构的多样性 | 第123-127页 |
| ·肉鸡肠道菌群PCR-DGGE指纹图谱 | 第123-125页 |
| ·PCR-DGGE检测肉鸡肠道菌群多样性 | 第125页 |
| ·优势条带回收图谱 | 第125-126页 |
| ·肠道优势条带克隆测序鉴定结果 | 第126-127页 |
| 4 讨论 | 第127-131页 |
| ·肉鸡灌服芽孢杆菌Pab02后对肠道菌群结构多样性影响 | 第127-130页 |
| ·ERIC-PCR和PCR-DGGE检测肉鸡肠道菌群结构的比较 | 第130-131页 |
| 第九章 芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡生长、肌肉品质、肠道菌群、消化酶活及免疫功能的影响 | 第131-155页 |
| 1 材料与方法 | 第132-137页 |
| ·材料 | 第132-134页 |
| ·肉鸡 | 第132页 |
| ·枯草芽孢杆菌Pab02制剂 | 第132-133页 |
| ·硫酸新霉素制剂 | 第133页 |
| ·肠道菌群检测培养基 | 第133页 |
| ·基础日粮 | 第133-134页 |
| ·方法 | 第134-137页 |
| ·动物分组及饲养管理 | 第135页 |
| ·增重及料重比的测定 | 第135页 |
| ·胴体品质的测定 | 第135-136页 |
| ·肌肉一般营养物质和氨基酸成份的测定 | 第136页 |
| ·肌肉氨基酸营养价值的评定 | 第136-137页 |
| ·肠道菌群的检测 | 第137页 |
| ·肠道消化酶活的检测 | 第137页 |
| ·免疫功能的检测 | 第137页 |
| 2 结果与分析 | 第137-150页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡增重和饲料转化率的影响 | 第138-139页 |
| ·枯草芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡胴体品质的影响 | 第139-140页 |
| ·枯草芽孢杆菌Pab02制剂对鸡肉品质的影响 | 第140-142页 |
| ·肉鸡肌肉氨基酸营养价值评价 | 第142-144页 |
| ·枯草芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡肠道菌群的影响 | 第144-145页 |
| ·枯草芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡消化酶活性的影响 | 第145-146页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡免疫器官的影响 | 第146-148页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂对新城疫血凝抑制抗体效价的影响 | 第148-149页 |
| ·枯草芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡血清免疫球蛋白水平的影响 | 第149-150页 |
| 3 讨论 | 第150-155页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡增重及饲料转化率的影响 | 第150页 |
| ·枯草芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡胴体品质和肌肉品质的影响 | 第150-151页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂对肠道菌群的调节作用 | 第151-152页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂对肠道消化酶活性的影响 | 第152页 |
| ·芽孢杆菌Pab02制剂对肉鸡免疫功能的影响 | 第152-155页 |
| 第三部分 结论及创新内容 | 第155-157页 |
| 1 结论 | 第155-156页 |
| 2 创新内容 | 第156-157页 |
| 参考文献 | 第157-184页 |
| 附录 | 第184-191页 |
| 致谢 | 第191-192页 |
| 攻读博士学位期间发表文章情况 | 第192页 |
