| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-14页 |
| 缩略词表 | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-35页 |
| ·分子系统学(Molecular phylogenetics) | 第16-18页 |
| ·分子系统学的概念和发展史 | 第16-17页 |
| ·分子系统学的理论基础 | 第17-18页 |
| ·系统学(Systematics) | 第17页 |
| ·分子进化 | 第17-18页 |
| ·植物分子系统学方法 | 第18页 |
| ·DNA序列在高等植物分子系统研究中的应用概况 | 第18-22页 |
| ·叶绿体基因组DNA(cpDNA) | 第18-19页 |
| ·核基因组DNA(nDNA)序列 | 第19-22页 |
| ·nrDNA | 第20-21页 |
| ·LCNG | 第21-22页 |
| ·线粒体基因组(mtDNA) | 第22页 |
| ·DNA序列在蔷薇科系统研究中的应用现状 | 第22-28页 |
| ·cpDNA序列 | 第22-23页 |
| ·ITS | 第23-24页 |
| ·LCNG | 第24-28页 |
| ·梨属植物系统关系研究进展 | 第28-34页 |
| ·梨属植物传统分类学概况 | 第28-31页 |
| ·梨属植物的命名、起源和分布 | 第28-29页 |
| ·梨属植物基本种及原产中国的梨属植物种 | 第29-31页 |
| ·梨属植物的系统演化 | 第31页 |
| ·梨属植物的分子系统学研究概况 | 第31-34页 |
| ·DNA分子标记在梨属系统研究中的应用 | 第31-33页 |
| ·DNA序列在梨属植物系统分析中的应用 | 第33-34页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第34-35页 |
| 第二章 ITS序列在梨属植物中的进化及其系统学价值 | 第35-58页 |
| ·材料和方法 | 第35-39页 |
| ·植物材料 | 第35-37页 |
| ·植物总基因组提取、扩增和测序 | 第37-38页 |
| ·序列排列及其数据分析 | 第38-39页 |
| ·ITS假基因序列判断 | 第39页 |
| ·系统树构建 | 第39页 |
| ·结果 | 第39-48页 |
| ·PCR条件对梨属植物ITS区扩增的影响 | 第39-41页 |
| ·ITS序列长度及ITS假基因判断 | 第41-43页 |
| ·ITS序列G+C含量、自由能、二级结构及替代模式 | 第43-45页 |
| ·序列分化度 | 第45-46页 |
| ·核苷酸多样性及中性进化检测 | 第46-47页 |
| ·重组鉴定 | 第47-48页 |
| ·系统分析结果 | 第48页 |
| ·讨论 | 第48-56页 |
| ·梨属植物中ITS假基因序列的鉴定 | 第48-51页 |
| ·梨属植物个体内ITS序列多态性(intra-individual ITS polymorphism) | 第51-54页 |
| ·梨属植物中ITS假基因的起源 | 第54-55页 |
| ·ITS假基因的系统应用性 | 第55-56页 |
| ·小结 | 第56-58页 |
| 第三章 梨属植物中Adh基因家族的分子进化及其系统学价值 | 第58-76页 |
| ·材料与方法 | 第58-60页 |
| ·植物材料 | 第58页 |
| ·扩增和测序 | 第58-59页 |
| ·序列分析 | 第59-60页 |
| ·系统分析 | 第60页 |
| ·结果 | 第60-70页 |
| ·梨属植物中Adh基因结构 | 第60-61页 |
| ·基源拷贝(paralog)的初步鉴定 | 第61页 |
| ·重组子检测 | 第61-62页 |
| ·各Adh位点序列特征 | 第62-63页 |
| ·序列长度 | 第62页 |
| ·序列分化度 | 第62-63页 |
| ·G+C含量 | 第63页 |
| ·系统关系分析 | 第63-70页 |
| ·内含子1+2区 | 第64-68页 |
| ·ORF区 | 第68-70页 |
| ·讨论 | 第70-75页 |
| ·梨属植物Adh基因家族的分子进化 | 第70-72页 |
| ·基于Adh数据的梨属植物系统推测 | 第72-74页 |
| ·Adh位点的系统发育应用性 | 第74-75页 |
| ·小结 | 第75-76页 |
| 第四章 基于cpDNA序列的梨属植物系统关系研究 | 第76-89页 |
| ·材料与方法 | 第76-78页 |
| ·植物材料 | 第76页 |
| ·matK、trnL-F和trnL内含子的扩增和测序 | 第76-77页 |
| ·序列分析及系统树构建 | 第77页 |
| ·二级结构预测 | 第77-78页 |
| ·结果 | 第78-84页 |
| ·matK序列 | 第78-79页 |
| ·trnL内含子及trnL-F区 | 第79-84页 |
| ·序列长度 | 第79-80页 |
| ·突变位点 | 第80-81页 |
| ·序列分化度 | 第81页 |
| ·二级结构 | 第81页 |
| ·系统树构建 | 第81-84页 |
| ·讨论 | 第84-88页 |
| ·matK | 第84页 |
| ·梨属植物中trnL-F区缺失的形成及其系统应用性 | 第84-86页 |
| ·基于trnL及trnL-F的进化史推断 | 第86-88页 |
| ·小结 | 第88-89页 |
| 第五章 梨属植物的cpSSR分析 | 第89-95页 |
| ·材料与方法 | 第89-90页 |
| ·材料 | 第89页 |
| ·PCR扩增及其产物分离 | 第89-90页 |
| ·数据分析 | 第90页 |
| ·结果 | 第90-92页 |
| ·梨属植物cpSSR多态性 | 第90-92页 |
| ·系统分析 | 第92页 |
| ·讨论 | 第92-94页 |
| ·小结 | 第94-95页 |
| 第六章 总结与展望 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-107页 |
| 附表 | 第107-112页 |
| 作者简历 | 第112页 |
