稻瘟病菌3端非翻译区和水稻胚乳基因的生物信息学分析
致谢 | 第1-6页 |
摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7-12页 |
文献综述 | 第12-25页 |
3′UTR及其研究进展 | 第13-19页 |
水稻胚乳中稻米品质相关基因研究进展 | 第19-25页 |
第一部分 稻瘟病菌3端非翻译区数据挖掘与序列分析 | 第25-50页 |
摘要 | 第26-27页 |
Abstract | 第27-28页 |
1 前言 | 第28-29页 |
2 材料与方法 | 第29-33页 |
·3'UTR序列来源 | 第29-30页 |
·3'UTR顺式作用元件挖掘 | 第30-31页 |
·字符串的统计学分析 | 第31-33页 |
·UTR与稻瘟病菌基因关联 | 第33页 |
·UTR对应基因的注释与功能分类 | 第33页 |
3 结果与分析 | 第33-45页 |
·EST序列信息 | 第33-34页 |
·UTR碱基分布状况 | 第34-37页 |
·UTR信号元件 | 第37-42页 |
·R'MES检测结果 | 第37-39页 |
·穷尽扫描结果 | 第39-42页 |
·选择性PolyA尾 | 第42-45页 |
4 讨论 | 第45-48页 |
参考文献 | 第48-50页 |
第二部分 水稻胚乳特异表达基因的鉴定与分析 | 第50-75页 |
摘要 | 第51-52页 |
Abstract | 第52-53页 |
1 前言 | 第53-54页 |
2 材料与方法 | 第54-59页 |
·植物样品 | 第54页 |
·RNA提取 | 第54-55页 |
·重组质粒抽提和cDNA测序 | 第55页 |
·EST序列处理 | 第55-56页 |
·cDNA阵列制备 | 第56-57页 |
·探针制备与杂交 | 第57-58页 |
·cDNA阵列数据分析 | 第58-59页 |
·Northern杂交 | 第59页 |
3 结果与讨论 | 第59-70页 |
·EST序列分析与注释 | 第59-63页 |
·cDNA阵列检测胚乳高表达基因 | 第63-68页 |
·与水稻品质相关的高表达基因 | 第68-69页 |
·过敏蛋白相关基因 | 第69页 |
·结合蛋白 | 第69-70页 |
·其它水稻胚乳中的高表达基因 | 第70页 |
4 总结 | 第70-72页 |
参考文献 | 第72-75页 |
作者简历 | 第75页 |