| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-20页 |
| 1 肠道微生物在宿主动物生理功能中的作用 | 第11-12页 |
| 2 日粮成分和形态对动物肠道微生物区系的影响 | 第12-14页 |
| ·日粮成分对微生物菌群多样性的作用 | 第12-13页 |
| ·饲料形态对家禽肠道微生物区系的影响 | 第13-14页 |
| 3 肠道微生物的研究方法介绍 | 第14-18页 |
| 4 研究意义 | 第18-20页 |
| 第二章 不同形态玉米日粮对鹅肠道微生物区系的影响 | 第20-35页 |
| 1 材料与方法 | 第20-25页 |
| ·试验设计 | 第20页 |
| ·试验日粮与饲养管理 | 第20-21页 |
| ·样品的采集和处理 | 第21-22页 |
| ·肠道微生物总 DNA 的提取 | 第22页 |
| ·肠道微生物总 DNA 的定量和纯度检测 | 第22页 |
| ·PCR 扩增和产物的检测 | 第22-23页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第23-25页 |
| ·变性梯度凝胶的制备 | 第23-24页 |
| ·灌胶、加样 | 第24页 |
| ·电泳 | 第24页 |
| ·染色(银染法) | 第24-25页 |
| ·数据分析 | 第25页 |
| 2 实验仪器和试剂 | 第25-26页 |
| ·主要仪器设备 | 第25页 |
| ·主要试剂及配制方法 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-30页 |
| ·微生物总 DNA 的提取结果 | 第26-27页 |
| ·16S rRNA V3 区的PCR 扩增结果 | 第27页 |
| ·粉状玉米日粮和整粒玉米日粮对鹅肠道微生物区系的影响 | 第27-29页 |
| ·不同日粮组间菌群相似性分析 | 第29-30页 |
| 4 讨论 | 第30-34页 |
| ·样品的采集与混合 | 第30页 |
| ·DNA 提取方法 | 第30-31页 |
| ·变性梯度凝胶电泳 | 第31-32页 |
| ·不同形态玉米日粮对鹅肠道微生物区系的影响 | 第32-34页 |
| 5 小结 | 第34-35页 |
| 第三章 应用变性梯度凝胶电泳研究不同日龄鹅肠道细菌菌群的多样性 | 第35-59页 |
| 1 试验主要仪器和试剂 | 第35-36页 |
| ·主要仪器 | 第35页 |
| ·主要试剂及配制方法 | 第35-36页 |
| ·PCR 产物的连接、转化与克隆的主要试剂配制 | 第36页 |
| ·质粒DNA 的提取、鉴定的主要试剂 | 第36页 |
| 2 材料与方法 | 第36-41页 |
| ·试验设计 | 第36-37页 |
| ·样品的采集和肠道内容物总DNA 的提取检测 | 第37页 |
| ·16S rRNA 片段V6-V8 区的PCR 扩增和产物检测 | 第37-38页 |
| ·PCR 引物序列 | 第37页 |
| ·PCR 扩增反应体系 | 第37页 |
| ·PCR 扩增反应程序 | 第37-38页 |
| ·PCR 产物的检测 | 第38页 |
| ·扩增产物的DGGE 分离 | 第38页 |
| ·DGGE 胶上分离的16S rRNA 条带的切胶回收 | 第38页 |
| ·16S rRNA 片段的PCR 再扩增 | 第38页 |
| ·PCR 产物的切胶回收纯化 | 第38页 |
| ·PCR 产物的克隆 | 第38-40页 |
| ·感受态大肠杆菌的制备(CaCl_2 法) | 第38页 |
| ·DNA 片段的连接 | 第38-39页 |
| ·连接产物转化感受态大肠杆菌 | 第39页 |
| ·重组子的筛选 | 第39页 |
| ·质粒提取步骤 | 第39-40页 |
| ·重组子的鉴定 | 第40页 |
| ·测序 | 第40页 |
| ·数据分析 | 第40-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-54页 |
| ·16S rRNA 片段V6-V8 区的PCR 扩增 | 第41页 |
| ·不同日粮对鹅肠道菌群多样性的影响 | 第41-44页 |
| ·不同日龄鹅肠道菌群的多样性 | 第44页 |
| ·对各肠段鹅肠道微生物 DNA-DGGE 电泳图谱的聚类分析 | 第44-45页 |
| ·不同日龄鹅肠道菌群相似性分析 | 第45-46页 |
| ·16S rRNA 的再扩增及测序结果分析 | 第46-47页 |
| ·基于16S rRNA 序列的同源性分析及系统发育树分析 | 第47-51页 |
| ·十二指肠内优势菌群的组成与系统发育树分析 | 第47-48页 |
| ·空肠内优势菌群的组成与系统发育树分析 | 第48-49页 |
| ·回肠内优势菌群的组成与系统发育树分析 | 第49-50页 |
| ·盲肠内优势菌群的组成与系统发育树分析 | 第50-51页 |
| ·鹅不同肠段优势细菌的种类分析 | 第51-52页 |
| ·不同日龄鹅肠道细菌克隆条带的定量分析 | 第52-54页 |
| 4 讨论 | 第54-57页 |
| ·日粮来源和饲养环境对鹅肠道微生物组成多样性的影响 | 第54-55页 |
| ·日龄与日粮的互作效应 | 第55-56页 |
| ·肠道细菌的定量分析 | 第56-57页 |
| ·整粒玉米日粮对肠道菌群种类和数量的作用 | 第57页 |
| 5 小结 | 第57-59页 |
| 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第67页 |
