| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| ·cDNA文库的研究进展 | 第12-15页 |
| ·普通cDNA文库 | 第12页 |
| ·差减文库 | 第12-14页 |
| ·固相cDNA文库 | 第14页 |
| ·均一化cDNA文库 | 第14-15页 |
| ·全长cDNA文库 | 第15页 |
| ·EST的研究进展 | 第15-19页 |
| ·EST的概述 | 第15页 |
| ·EST相关数据库 | 第15-16页 |
| ·EST自动化分析平台 | 第16-17页 |
| ·EST序列的应用 | 第17-19页 |
| ·转录组的研究进展 | 第19-23页 |
| ·转录组的概述 | 第19页 |
| ·转录组研究在植物中的应用 | 第19-23页 |
| 第二章 引言 | 第23-25页 |
| 第三章 岷江百合花全长CDNA文库的构建及EST分析 | 第25-35页 |
| ·实验材料 | 第25页 |
| ·植物材料 | 第25页 |
| ·主要仪器 | 第25页 |
| ·主要试剂 | 第25页 |
| ·菌株 | 第25页 |
| ·实验方法 | 第25-31页 |
| ·百合花及花蕾的采集与处理 | 第25-26页 |
| ·CTAB法提取百合花(蕾)总RNA | 第26页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测RNA | 第26页 |
| ·紫外分光光度仪测定RNA浓度 | 第26-27页 |
| ·第一链cDNA的合成 | 第27页 |
| ·LD—PCR扩增第一链cDNA合成双链cDNA | 第27-28页 |
| ·目的片段回收 | 第28-29页 |
| ·连接转化 | 第29页 |
| ·菌落鉴定 | 第29-30页 |
| ·EST序列的测定与分析 | 第30-31页 |
| ·结果与分析 | 第31-33页 |
| ·RNA的提取 | 第31页 |
| ·双链cDNA的合成与鉴定 | 第31页 |
| ·百合花cDNA原始文库的滴度检测 | 第31-33页 |
| ·百合花cDNA文库的插入片段检测 | 第33页 |
| ·EST序列的分析 | 第33页 |
| ·讨论 | 第33-34页 |
| ·实验材料的选择 | 第33-34页 |
| ·cDNA文库的质量 | 第34页 |
| ·小结 | 第34-35页 |
| ·获得较高质量的总RNA | 第34页 |
| ·构建了高质量的cDNA文库 | 第34-35页 |
| 第四章 岷江百合转录组分析 | 第35-47页 |
| ·技术路线 | 第35页 |
| ·材料 | 第35-36页 |
| ·实验材料 | 第35页 |
| ·主要仪器设备 | 第35页 |
| ·自配试剂 | 第35-36页 |
| ·实验方法 | 第36-41页 |
| ·RNA的提取 | 第36页 |
| ·RNA的检测 | 第36-37页 |
| ·mRNA的纯化 | 第37-38页 |
| ·反转录第一链的合成 | 第38页 |
| ·反转录第二链的合成 | 第38-39页 |
| ·末端修复 | 第39页 |
| ·3’末端加‘A’ | 第39页 |
| ·加Adapter | 第39-40页 |
| ·连接产物的胶回收纯化 | 第40页 |
| ·PCR | 第40-41页 |
| ·PCR产物的胶回收纯化 | 第41页 |
| ·DNA制备产物检测 | 第41页 |
| ·测序 | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-44页 |
| ·百合转录组大规模测序 | 第41-42页 |
| ·百合EST数据的预处理 | 第42页 |
| ·Consensus-gene统计 | 第42页 |
| ·百合EST序列的GO分类 | 第42-43页 |
| ·蛋白质功能和分类预测 | 第43-44页 |
| ·讨论 | 第44-46页 |
| ·重要植物基因组的研究进展 | 第44-45页 |
| ·大批量EST的应用 | 第45页 |
| ·大批量EST数据的拼接与聚类 | 第45页 |
| ·EST序列的批量注释与功能能分类 | 第45-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| ·通过高通量测序获得一大批EST序列 | 第46页 |
| ·对获得序列进行GO注释 | 第46-47页 |
| 第五章 结论 | 第47-49页 |
| ·构建了岷江百合花的全长CDNA文库 | 第47页 |
| ·EST序列的获得与分析 | 第47页 |
| ·岷江百合大规模EST的获得 | 第47页 |
| ·对获得序列进行了GO注释及蛋白质功能和分类预测 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-57页 |
| 致谢 | 第57-59页 |
| 攻读硕士期间发表文章 | 第59页 |